Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EPS15_0003500
Sequence Length
723 nt
GC Content
0.4246
AUGCAAAUGAAACUGAUGGAAAUGAAAGAUUUGGAAAAUCAUAAUAGUCAGUUAAAUUGGUGCAGUAGCCCACACAGCAUUCUUGUAAACGGAGCUACAGAUUAUUGCAGCCUCAGCACCAGCAGCAGUGAAACAGCCAACCUUAAUGAACAUGUUGAAGGCCAGAGCAACCUAGAGUCUGAGCCCAUACACCAGGAAUCUCCAGCAAGAAGUAGUCCUGAACUACUGCCUUCUGGUGUGACUGAUGAAAAUGAGGUGACUACAGCUGUUACUGAAAAAGUUUGUUCUGAACUCGACAAUAAUAGACAUUCAAAAGAGGAAGAUCCAUUUAAUGUAGACUCAAGUUCGCUGACAGGUCCAGUUGCAGAUACAAACUUGGAUUUUUUCCAGUCUGAUCCUUUUGUUGGCAGUGAUCCUUUCAAGGAUGAUCCUUUUGGAAAAAUCGAUCCAUUUGGUGGUGAUCCUUUCAAAGGUUCAGAUCCAUUUGCAUCAGACUGUUUCUUCAGGCAAUCUACUGAUCCUUUUGCCACUUCAAGCACUGACCCUUUCAGUGCAGCCAACAAUAGCAGUAUUACAUCGGUAGAAACGUUGAAGCACAAUGAUCCUUUUGCUCCUGGUGGAACAGUUGUUGCAGCAAGCGAUUCAGCCACAGACCCCUUUGCUUCUGUUUUUGGGAAUGAAUCAUUUGGAGGUGGAUUUGCUGACUUCAGCACAUUGUCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-184.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -199.21
Frequency: 0.0000
Diversity: 202.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(.((((((((((((((....((((.............))))....)))))))....(((.((....)))))....(((....)))....(((((....((((((((..((.(((((....((......(((((((.((((............))))..(((((((...........)))).)))..((((((((((.(((......)))((((((.....))))))...)))))))))).((((((.(((((.((((((.......))))))....((((((((((((((((.(((........(((((...(((.(((...))).))))))))........(((....)))..))).)))).)))).))))))))(((.....))).((((((.((((....(((.((.((((((.(((((((((((((....)))....)).))))..)))).)).)))))).))))))).)))))).))))).)))))).))))))).....))..(((((((((....((((........(((((((.....)))))))...........))))......)))))))))...))))).)).)))))))).....)))))..((((...(((((((......)))))))...))))....(((...((....))....)))......))))))).)..(((...(((((....))))).....)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((.(((((((....((((.............))))....)))))))...,((((((.(((((((.....(((....)))....)).))))).,,....{{..,,.,|,}}}}}}}...(((({..{((((,.((((({.......,||,,..(((((((.{........,)))).)))...||{.(((..{{,.((((.(((.((((((.....))))))..))))))).))..))),}}....)))))),......))))))))))...{(((((((((((((((.(((........(((((..,{{{.(({...))).)))))))).,,,....|,,..,}},...))).)))).)))).)))))))|(((.....))),((((((.(((,...,(((.((.((((((.(((((((((((((....}}|....}}.,)))..}))).)).)))))).})))))).)))))}.)))))))))(.{((((((((.{((({{,,(((((((((....{(((........(((((((.....))))))).,,........))}},.....)))))))))..{{|||..,,.))))).,....,})}}})})},))}}}}))}|||||,.,,|||(({(({.{{{((({.,,....|,.,}}))....)))..}}}})).}}}},,}|||}},.(((((....))))),}},,}),..)
Back