Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_EPS15_0005300

Sequence Length

328 nt

GC Content

0.4268

GAAGAUCCAUUUAAUGUAGACUCAAGUUCGCUGACAGGUCCAGUUGCAGAUACAAACUUGGAUUUUUUCCAGUCUGAUCCUUUUGUUGGCAGUGAUCCUUUCAAGGAUGAUCCUUUUGGAAAAAUCGAUCCAUUUGGUGGUGAUCCUUUCAAAGGUUCAGAUCCAUUUGCAUCAGACUGUUUCUUCAGGCAAUCUACUGAUCCUUUUGCCACUUCAAGCACUGACCCUUUCAGUGCAGCCAACAAUAGCAGUAUUACAUCGGUAGAAACGUUGAAGCACAAUGAUCCUUUUGCUCCUGGUGGAACAGUUGUUGCAGCAAGCGAUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-85.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -89.68

Frequency: 0.0011

Diversity: 57.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((.....((((..(((((.(..(((....)))..).))).)).))))....)))))))....(((((((((.(......(((...(((.(((((.((((((.(((((..((((........))))...)).))).))))))..))))).)))...)))...).)))))))))...((((((....(((((((((....((((........(((((((.....)))))))...........))))......)))))))))....))))))........))((.(((((..((.((.(((....))).)).)))))))...))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((.....((((..(((((.{..(((....)))..).))).)).))))....))))))),...({(((((((.{....,,(((...(((.(((((.((((((.(((((..((((........))))...)).))).))))))..))))).)))...)))...|,}))))))||,,,({((((,...(((((((((....{(((........(((((((.....))))))).,.........))})......)))))))))...,}})}}}...,,.,.,}{{.{{{{{.,||.{|,|||,,,,)}),)).))))}))...))