Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EPS15_0005700
Sequence Length
1468 nt
GC Content
0.4230
UGGGUUGUAUCCCCUGCAGAAAAAGCUAAAUAUGAUGAAAUCUUCCUGAAAACUGAUAAAGAUAUGGACGGAUUUGUGUCUGGAUUGGAGGUCCGUGAAAUAUUCUUGAAAACAGGUUUACCUUCUACCUUACUAGCCCAUAUAUGGUCAUUAUGCGACACAAAGGACUGUGGGAAGCUUUCAAAGGAUCAGUUUGCCUUGGCUUUUCACUUAAUCAGUCAGAAGUUAAUCAAGGGCAUUGAUCCUCCUCACGUUCUUACUCCUGAAAUGAUUCCACCAUCAGACAGGGCCAGUUUACAAAAGAACAUCAUAGGAUCAAGUCCUGUUGCAGAUUUCUCUGCUAUUAAGGAACUAGAUACUCUUAACAAUGAAAUAGUUGACCUACAGAGGGAAAAGAAUAAUGUGGAACAGGACCUUAAGGAGAAGGAAGAUACUAUUAAACAGAGGACAAGUGAGGUUCAGGAUCUUCAAGAUGAAGUUCAAAGGGAGAAUACUAAUCUGCAAAAACUACAGGCCCAGAAACAGCAGGUACAGGAACUCCUUGAUGAACUGGAUGAGCAGAAAGCCCAGCUGGAGGAGCAACUCAAGGAAGUCAGAAAGAAAUGUGCUGAGGAGGCCCAACUGAUCUCUUCUCUGAAAGCUGAAUUAACUAGUCAGGAAUCGCAGAUCUCCACUUACGAAGAAGAAUUGGCAAAAGCUAGAGAAGAGCUGAGCCGUCUACAGCAAGAAACAGCAGAAUUGGAGGAGAGUGUAGAGUCAGGGAAGGCUCAGUUGGAACCUCUUCAGCAGCACCUACAAGAUUCACAACAGGAAAUUAGUUCAAUGCAAAUGAAACUGAUGGAAAUGAAAGAUUUGGAAAAUCAUAAUAGUCAGUUAAAUUGGUGCAGUAGCCCACACAGCAUUCUUGUAAACGGAGCUACAGAUUAUUGCAGCCUCAGCACCAGCAGCAGUGAAACAGCCAACCUUAAUGAACAUGUUGAAGGCCAGAGCAACCUAGAGUCUGAGCCCAUACACCAGGAAUCUCCAGCAAGAAGUAGUCCUGAACUACUGCCUUCUGGUGUGACUGAUGAAAAUGAGGUGACUACAGCUGUUACUGAAAAAGUUUGUUCUGAACUCGACAAUAAUAGACAUUCAAAAGAGGAAGAUCCAUUUAAUGUAGACUCAAGUUCGCUGACAGGUCCAGUUGCAGAUACAAACUUGGAUUUUUUCCAGUCUGAUCCUUUUGUUGGCAGUGAUCCUUUCAAGGAUGAUCCUUUUGGAAAAAUCGAUCCAUUUGGUGGUGAUCCUUUCAAAGGUUCAGAUCCAUUUGCAUCAGACUGUUUCUUCAGGCAAUCUACUGAUCCUUUUGCCACUUCAAGCACUGACCCUUUCAGUGCAGCCAACAAUAGCAGUAUUACAUCGGUAGAAACGUUGAAGCACAAUGAUCCUUUUGCUCCUGGUGGAACAGUUGUUGCAGCAAGCGAUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-385.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -414.21
Frequency: 0.0000
Diversity: 435.58
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.....((((.(((((...........((.((((((((((...................))).((.(((((((((((((((((.(((.(((((.....(((((......((((.((((((.(((((...((((....((((((....((.....))...))))))((.(((((.((....))..))))).))(((((((((.(((.....))).)))))))))....)))).((((((((......(((((((((((((...((((......))))..))))...)))......)))))).....))))))))((((((((.((.((((((((.((....((((((((.....((........))..)))))..)))..))))))).......))).)).))))))))..))))))))))).)))).............((((.......)))).((((((((.......((((((.((((((....((.((((((.....((........)).....))))))..))...))))))..))))))...((.((.....)).))(((.....)))..(((...((((((...........(((((((((((.((((((((.(.(((((((((...((((.........)))).....(((..(((((...........(((..((((...((((.......))))..)))))))...((........)).........))))).)))....)))))))))).))))))))..)))))))))))(((((.....((((..(....)..)))).((.....)).(((..(((((((....((((.............))))....)))))))..)))))))).(((((((.....(((....)))....)).)))))...(((((((.((..........)).))))))).....................((((((.(..((((((((.((..((((...((((((.((.(((..((..((((.(((.((((((.....))))))..))))))).))..))).))...))).))))))).(((......)))....)).))))))))..)))))))......))).)))....))))))))))).............)))))))))).)))...))))))).)))))))))))).))))))).))(((((((((.(......(((...(((.(((((.((((((.(((((..((((........))))...)).))).))))))..))))).)))...)))...).)))))))))))))).)))))))))))((((..(.(((((........(((((((.....)))))))......(((((((.((.((((...(((((((.(((((.....)))))....)))))))....)))).)).)))))))..))))).)..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.....{(((.(((({..,,......,{{,{,,{(((({{,.....((,....||,|.,|||,||||{({(({{{{,{(((((,(((,{((((.....((((,....,{(({{.((((((.(((({...{(((.,...{((((.,,,,..,,,.,,{(((({,(((((,.........{(((((((,.{((((((((((((.(((.....))).))))))},....,)))))))))))))}}.}}}}))))}.,{{(({...(({{......))))..}}))),.}||||....,,))}),||,,}|}|||..((((((((.((.((({{({(||,....{{{{{{{(.....{{........}}..))))}..||},|}})))}|..,,,..,}).)).)))))))),,}}))))))))).}}}}.|,,,,,..{,{{((,{.,{{..,||||{((((((((.......((((((.((((((....{{.((((((.....{{........}}.....))))))..}}...))))))..))))))...{{.((.....}}.||(((({((,.{{..{({{.....{(({,.........(((((((((((.((((((((.{.(((((((((...((((.,.....,.))))...,{(({..(((((.,,......,.{{,..{(((...((((.......))))..)))}}}}.,.((........)).....,},.))))).))).},.)))))))))).))))))))..)))))))))))((({{.....,,{(,.,....}||,,|,.{|{,..,,,.,{|..(((((((....((((.............))))....)))))))..,,|}}))).(((((((.....({{....)))....)).)))))...(({((((.((.,,.,,,...}}.}}}|}}}......,.,,,,,..},....}))))..(((((({,{........})))).))),..,{{,{{{|,.,|}}}}}}..}}||{{||,,}},)))))),.})))))}}||.,||}||....,)}}))).,)..},}||}|||}|{....{||{{|||,||}}}|...},.,,}}}}||{{|,..,,,.{||,,,))).})}})))),...))}}})))}).)}}..,))))))).)))))))}},,,|{((.....))||{(((((|,|,,..,,{((...(((.(((((.((((((.(((({..((((........))))...)).))).))))))..))))).))),..))).,,|,)))))})}|})))).)))))))))))((((,.{.{((((........(((((((.....)))))))......{{{{{||.{{.,,,{||||||||{{.(((((.....)))))....,}))))}.}}})})},)).))))))),,))))).}.,))))
Back