Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EPS15_0005800
Sequence Length
1558 nt
GC Content
0.4268
GCCAUGUUUUUGGUAUACUGUGCACUGGAGAAAGAACCUGUGCCAAUGUCCUUGCCUCCAGCCUUGGUGCCACCAUCUAAGAGAAAAACGUGGGUUGUAUCCCCUGCAGAAAAAGCUAAAUAUGAUGAAAUCUUCCUGAAAACUGAUAAAGAUAUGGACGGAUUUGUGUCUGGAUUGGAGGUCCGUGAAAUAUUCUUGAAAACAGGUUUACCUUCUACCUUACUAGCCCAUAUAUGGUCAUUAUGCGACACAAAGGACUGUGGGAAGCUUUCAAAGGAUCAGUUUGCCUUGGCUUUUCACUUAAUCAGUCAGAAGUUAAUCAAGGGCAUUGAUCCUCCUCACGUUCUUACUCCUGAAAUGAUUCCACCAUCAGACAGGGCCAGUUUACAAAAGAACAUCAUAGGAUCAAGUCCUGUUGCAGAUUUCUCUGCUAUUAAGGAACUAGAUACUCUUAACAAUGAAAUAGUUGACCUACAGAGGGAAAAGAAUAAUGUGGAACAGGACCUUAAGGAGAAGGAAGAUACUAUUAAACAGAGGACAAGUGAGGUUCAGGAUCUUCAAGAUGAAGUUCAAAGGGAGAAUACUAAUCUGCAAAAACUACAGGCCCAGAAACAGCAGGUACAGGAACUCCUUGAUGAACUGGAUGAGCAGAAAGCCCAGCUGGAGGAGCAACUCAAGGAAGUCAGAAAGAAAUGUGCUGAGGAGGCCCAACUGAUCUCUUCUCUGAAAGCUGAAUUAACUAGUCAGGAAUCGCAGAUCUCCACUUACGAAGAAGAAUUGGCAAAAGCUAGAGAAGAGCUGAGCCGUCUACAGCAAGAAACAGCAGAAUUGGAGGAGAGUGUAGAGUCAGGGAAGGCUCAGUUGGAACCUCUUCAGCAGCACCUACAAGAUUCACAACAGGAAAUUAGUUCAAUGCAAAUGAAACUGAUGGAAAUGAAAGAUUUGGAAAAUCAUAAUAGUCAGUUAAAUUGGUGCAGUAGCCCACACAGCAUUCUUGUAAACGGAGCUACAGAUUAUUGCAGCCUCAGCACCAGCAGCAGUGAAACAGCCAACCUUAAUGAACAUGUUGAAGGCCAGAGCAACCUAGAGUCUGAGCCCAUACACCAGGAAUCUCCAGCAAGAAGUAGUCCUGAACUACUGCCUUCUGGUGUGACUGAUGAAAAUGAGGUGACUACAGCUGUUACUGAAAAAGUUUGUUCUGAACUCGACAAUAAUAGACAUUCAAAAGAGGAAGAUCCAUUUAAUGUAGACUCAAGUUCGCUGACAGGUCCAGUUGCAGAUACAAACUUGGAUUUUUUCCAGUCUGAUCCUUUUGUUGGCAGUGAUCCUUUCAAGGAUGAUCCUUUUGGAAAAAUCGAUCCAUUUGGUGGUGAUCCUUUCAAAGGUUCAGAUCCAUUUGCAUCAGACUGUUUCUUCAGGCAAUCUACUGAUCCUUUUGCCACUUCAAGCACUGACCCUUUCAGUGCAGCCAACAAUAGCAGUAUUACAUCGGUAGAAACGUUGAAGCACAAUGAUCCUUUUGCUCCUGGUGGAACAGUUGUUGCAGCAAGCGAUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-411.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -441.06
Frequency: 0.0000
Diversity: 490.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((((.(((.((.((((.((........)).)))))).)))))....(((......((((...)))).....))))))))))))).(((.(((.(.(((.............(((((((...((((..((.((((((......((((((((((((((.((.......)).))))))))(((.((..((((....))))..))..)))............)))))).(((((.......))).))((((((.((((((..........(((((((..(((((((((((((.(((.....))).)))))))).....))))))))))))))).)))))))))..(((((...((((......))))..))))).)))))).)).)))).)))))))(((((.((((((...(((((....))))).....))).)))............((((......)))).((.(((((((((..(((...((.((.(((.((((((..(((((...((...(((.((((((....((((.......)))).((((((((.......((((((.((((((....((.((((((.....((........)).....))))))..))...))))))..))))))...((.((.....)).))(((.....)))..(((...((((((...........(((((((((((.((((((((.(.(((((((((...((((.........)))).....(((..(((((...........(((..((((...((((.......))))..)))))))...((........)).........))))).)))....)))))))))).))))))))..)))))))))))(((((.....((((..(....)..)))).((.....)).(((..(((((((....((((.............))))....)))))))..)))))))).(((((((.....(((....)))....)).)))))...(((((((.((..........)).))))))).....................((((((.(..((((((((.((..((((...((((((.((.(((..((..((((.(((.((((((.....))))))..))))))).))..))).))...))).))))))).(((......)))....)).))))))))..)))))))......))).)))....))))))))))).)))))))))...))...))).))...)))))).))).)).))......(((((.....))))))))..))))))))).))...(((.(((((.((((((.(((((..((((........))))...)).))).))))))..))))).))))))))...((((...(((((((((.(((((((((((((((((....((((........(((((((.....)))))))...........))))......)))))))))..(((((.....)))))......))))..)))).)))))))))..))))))).).))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((({{{{{,||||,,,,((,{(((,((,,.,,,..|},||||||,|||{|{{{{{{{{{{{{{({{({,.,,||,||,.,..,,,,,}||||{{{{.,{|,|,{((........,....,,,{({{,,,(((({{,,.,,,((,....||{{,,|||,||||||.|}}}},..{{((({(({{,{(({.....((((.....,,(({{{{{{{{{.{{{{{...{{((.,...{((((.,,,,..},,.,,{(((({.((((({.........{(((((((,.{((((((((((((.(((.....))).))))))},....,)))))))))))))}}.}}})))))).,{{(((...(({{......))))..}}))),,}||||.,..,}))})}|},,}|||||.,((((((({,((,({{{{|||||,....|||{{{{{.....{{........},..}}))},.||}|||||||||..,,,...||.||.|||}||||,,}}}}}}}}}}}..,.,.,..,||||}...{,,|}}}....,)))}||||||||},.....((((((.((((((....{{.((((((.....{{........}}.....))))))..}}...))))))..))))))}},}|.||,....)},||||||}||}.,,..,,||}}|,.{((,,.......,,(((((((((((.((((((((.{.(((((((((...((((.,.....,.))))...,{(({..(((((.,,......,.{{,..{(((...((((.......))))..)))}}}}.,.((........)).....,},.))))).))).},.)))))))))).))))))))..))))))))))){|{{{.....{,{{,.,....||||,||,{{{..,{||.{{{,.(((((((....((((.............))))....)))))))...,||||||.(((((((.....(({....)))....)).)))))...{{{{(({.{{.,,.||,,,,}}.}|||||,.,{{{,,.{{{{,,.,.....|}}}}..(((((((.{........})))).)))..,{{{,(((,,,,,,{{{{.,{|.((((((.....))))))..})))))),))..)))}},....)))))),,}..,,)}))}}})}}....{((((({{{{{{{{{.{{{.....,.,{{{{{...,,,.{||...))).)))))))),..,},..,}},.}},..,,))),}))).))}),}}}}}}}|(((.....)))}||||{{}||||}}}|{||.,,{((,((({(,((((((,(((({..{{{{........)))}...)).))},)))))}.,))))).)))}}}})},,||||,|,|||||||||,|{{({{{,(((((((((....{(((........(((((((.....))))))).,,........))})......)))))))))..{{|||..,,,))}}}.....,}}}}}})})),))))))))}},)})}})}.),))}.)}}
Back