Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EPS15_0008000
Sequence Length
1491 nt
GC Content
0.4252
GCCAUGUUUUUGGUAUACUGUGCACUGGAGAAAGAACCUGUGCCAAUGUCCUUGCCUCCAGCCUUGGUGCCACCAUCUAAGAGAAAAACGUGGGUUGUAUCCCCUGCAGAAAAAGCUAAAUAUGAUGAAAUCUUCCUGAAAACUGAUAAAGAUAUGGACGGAUUUGUGUCUGGAUUGGAGGUCCGUGAAAUAUUCUUGAAAACAGGUUUACCUUCUACCUUACUAGCCCAUAUAUGGUCAUUAUGCGACACAAAGGACUGUGGGAAGCUUUCAAAGGAUCAGUUUGCCUUGGCUUUUCACUUAAUCAGUCAGAAGUUAAUCAAGGGCAUUGAUCCUCCUCACGUUCUUACUCCUGAAAUGAUUCCACCAUCAGACAGGGCCAGUUUACAAAAGAACAUCAUAGGAUCAAGUCCUGUUGCAGAUUUCUCUGCUAUUAAGGAACUAGAUACUCUUAACAAUGAAAUAGUUGACCUACAGAGGGAAAAGAAUAAUGUGGAACAGGACCUUAAGGAGAAGGAAGAUACUAUUAAACAGAGGACAAGUGAGGUUCAGGAUCUUCAAGAUGAAGUUCAAAGGGAGAAUACUAAUCUGCAAAAACUACAGGCCCAGAAACAGCAGGUACAGGAACUCCUUGAUGAACUGGAUGAGCAGAAAGCCCAGCUGGAGGAGCAACUCAAGGAAGUCAGAAAGAAAUGUGCUGAGGAGGCCCAACUGAUCUCUUCUCUGAAAGCUGAAUUAACUAGUCAGGAAUCGCAGAUCUCCACUUACGAAGAAGAAUUGGCAAAAGCUAGAGAAGAGCUGAGCCGUCUACAGCAAGAAACAGCAGAAUUGGAGGAGAGUGUAGAGUCAGGGAAGGCUCAGUUGGAACCUCUUCAGCAGCACCUACAAGAUUCACAACAGGAAAUUAGUUCAAUGCAAAUGAAACUGAUGGAAAUGAAAGAUUUGGAAAAUCAUAAUAGUCAGUUAAAUUGGUGCAGUAGCCCACACAGCAUUCUUGUAAACGGAGCUACAGAUUAUUGCAGCCUCAGCACCAGCAGCAGUGAAACAGCCAACCUUAAUGAACAUGUUGAAGGCCAGAGCAACCUAGAGUCUGAGCCCAUACACCAGGAAUCUCCAGCAAGAAGUAGUCCUGAACUACUGCCUUCUGGUGUGACUGAUGAAAAUGAGGUGACUACAGCUGUUACUGAAAAAGUUUGUUCUGAACUCGACAAUAAUAGACAUUCAAAAGAGGAAGAUCCAUUUAAUGUAGACUCAAGUUCGCUGACAGGUCCAGUUGCAGAUACAAACUUGGAUUUUUUCCAGUCUGAUCCUUUUGUUGGCAGUGAUCCUUUCAAGGAUGAUCCUUUUGGAAAAAUCGAUCCAUUUGGUGGUGAUCCUUUCAAAGGUUCAGAUCCAUUUGCAUCAGACUGUUUCUUCAGGCAAUCUACUGAUCCUUUUGCCACUUCAAGCACUGACCCUUUCAGUGCAGCCAACAAUAGCAGUAUUACAUCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-391.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -421.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 318.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...))(..((..(((((((((((.((........)).)))).....(((((((((((((((((..(((...(((((...........(.(((......)))).((.......)).......(((.(((((((((...................))).))))))..)))....((((((((((.((((.....((((.......(((((((((((.(((((...((((....((((((....((.....))...))))))((.(((((.((....))..))))).))(((((((((.(((.....))).)))))))))....)))).((((((((......(((((((((((((...((((......))))..))))...)))......)))))).....))))))))((((((((.((.((((((((.((....((((((((.....((........))..)))))..)))..))))))).......))).)).))))))))..)))))))))))..........)))))......)))).....)))))))))))))).....((((((.((((((....((.((((((.....((........)).....))))))..))...))))))..))))))))))).)))..)))....)))))))).......))))))((((....((...(((((((((((((.((((((((.(.(((((((((...((((.........)))).....(((..(((((...........(((..((((...((((.......))))..)))))))...((........)).........))))).)))....)))))))))).))))))))..))))))))))).)).))....))))......(((((((.((((..(((((((((.(((((((....((((.............))))....)))))))...........(((((((.....(((....)))....)).)))))...(((((((.((..........)).)))))))....((((((...........((((((.(..((((((((.((..((((...((((((.((.(((..((..((((.(((.((((((.....))))))..))))))).))..))).))...))).))))))).(((......)))....)).))))))))..)))))))...............((((((((((((((.....((((..(((((.(..(((....)))..).))).)).))))....)))))))............)))))))))))))..(((.(((((.((((((.(((((..((((........))))...)).))).))))))..))))).)))....)))))))))..)))))))))))..(((((.............))))).......(((((((.....)))))))...........)))))))..))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((...}}{..((..(((((((((((.((........)).)))).....(((((((((((((({{((((({..,{{{{{...........{,(((......}})}||{.......,}.......{{{.{{(((((((......{{.....}}.|..}}}.}}}))).})))},..{(((((((((.((((.....((((.......(((({((((((.(((((...{(((....,{((({.,{,{..,,,.,,{{{(({,((((({.........{(((((((,.{((((((((((((.(((.....))).))))))},....,)))))))))))))}}.}}}||})}|,,{{{{{...{({{.....,))))..}}))),.,||{,.....,)))).,,..,,)}},..((((((((.((.((((((((,,{....{(({((((.....{{........}}..)))))..))).,}))))},.......,)).)).))))))))..)))))))))))..,,......}}}}}.,....)))).....)))))))))))))}.....((((((.((((((....{{.((((((.....{{........}}.....))))))..}}...))))))..))))))}}}}}.}}}...,)},},)))))))).,,....}}}}|}.{((,,..,,...{{(((((((((((.((((((((.{.(((((((((...((((.,.....,.))))...,{(({..(((((.,,......,.{{,..{(((...((((.......))))..)))}}}}.,.((........)).....,},.))))).))).},.)))))))))).))))))))..))))))))))).}}.,,....||||......{(((((,{((((..(((((((((.(((((((....((((.............))))....)))))))...,((((((.(((((((.....(((....)))....)).))))).,.....,,......,.))))))}...(((({..(((((,.((((({.......,||,,..(((((((.{........,)))).)))...,|{.(((..{{,.((((.(((.((((((.....))))))..))))))).))..))).}}....)))))),......))))))))))...{(((((((((((((((.(((........(((((..,{{{.(({...))).)))))))).,,,....|,,..,}},...))).)))).)))).)))))))|(((.....))),((((((.((({...,{((.((.((((((.(((((((((((((....))}....)),})))..}))).)).)))))).))))))).)))))).)))))))))..))))))))))}..{{{{|||..,,)}},,,,))))}.......(((((((.....)))))))...........)))))))..))..}
Back