Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_EPS15_0009400

Sequence Length

964 nt

GC Content

0.4232

AACAUCAUAGGAUCAAGUCCUGUUGCAGAUUUCUCUGCUAUUAAGGAACUAGAUACUCUUAACAAUGAAAUAGUUGACCUACAGAGGGAAAAGAAUAAUGUGGAACAGGACCUUAAGGAGAAGGAAGAUACUAUUAAACAGAGGACAAGUGAGGUUCAGGAUCUUCAAGAUGAAGUUCAAAGGGAGAAUACUAAUCUGCAAAAACUACAGGCCCAGAAACAGCAGGUACAGGAACUCCUUGAUGAACUGGAUGAGCAGAAAGCCCAGCUGGAGGAGCAACUCAAGGAAGUCAGAAAGAAAUGUGCUGAGGAGGCCCAACUGAUCUCUUCUCUGAAAGCUGAAUUAACUAGUCAGGAAUCGCAGAUCUCCACUUACGAAGAAGAAUUGGCAAAAGCUAGAGAAGAGCUGAGCCGUCUACAGCAAGAAACAGCAGAAUUGGAGGAGAGUGUAGAGUCAGGGAAGGCUCAGUUGGAACCUCUUCAGCAGCACCUACAAGAUUCACAACAGGAAAUUAGUUCAAUGCAAAUGAAACUGAUGGAAAUGAAAGAUUUGGAAAAUCAUAAUAGUCAGUUAAAUUGGUGCAGUAGCCCACACAGCAUUCUUGUAAACGGAGCUACAGAUUAUUGCAGCCUCAGCACCAGCAGCAGUGAAACAGCCAACCUUAAUGAACAUGUUGAAGGCCAGAGCAACCUAGAGUCUGAGCCCAUACACCAGGAAUCUCCAGCAAGAAGUAGUCCUGAACUACUGCCUUCUGGUGUGACUGAUGAAAAUGAGGUGACUACAGCUGUUACUGAAAAAGUUUGUUCUGAACUCGACAAUAAUAGACAUUCAAAAGAGGAAGAUCCAUUUAAUGUAGACUCAAGUUCGCUGACAGGUCCAGUUGCAGAUACAAACUUGGAUUUUUUCCAGUCUGAUCCUUUUGUUGGCAGUGAUCCUUUCAAGGAUGAUCCUUUUGGAAAAAUCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-245.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -263.48

Frequency: 0.0000

Diversity: 212.29

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.((((..(((((((((((((...(((((....))))).....))).)))............((((......)))).((.(((((((((..(((...((.((.(((.((((((..(((((...((...(((.((((((....((((.......)))).((((((((.......((((((.((((((....((.((((((.....((........)).....))))))..))...))))))..))))))...((.((.....)).))(((.....)))..(((...((((((...........(((((((((((.((((((((.(.(((((((((...((((.........)))).....(((..(((((...........(((..((((...((((.......))))..)))))))...((........)).........))))).)))....)))))))))).))))))))..)))))))))))(((((.....((((..(....)..)))).((.....)).(((..(((((((....((((.............))))....)))))))..)))))))).(((((((.....(((....)))....)).)))))...(((((((.((..........)).))))))).....................((((((.(..((((((((.((..((((...((((((.((.(((..((..((((.(((.((((((.....))))))..))))))).))..))).))...))).))))))).(((......)))....)).))))))))..)))))))......))).)))....))))))))))).)))))))))...))...))).))...)))))).))).)).))......(((((.....))))))))..))))))))).))...)))))))......)))).)(..(((....)))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

,.{,,,..(((((({{(((((...(((((....))))).....)))},)}......||,...,...,.....}}||.((.(((((((((..(((...((.((.(((.((((((..,((,(,,.{{.,.(((.((((({....((((.......)))).((((((((.......((((((.((((((....{{.((((((.....{{........}}.....))))))..}}...))))))..))))))..,{{.((.....}}.{{((((.{(..((..((({.....(((({.........(((((((((((.((((((((.{.(((((((((...((((.,.....,.))))...,{(({..(((((.,,......,.{{,..{(((...((((.......))))..)))}}}}.,.((........)).....,},.))))).))).},.)))))))))).))))))))..)))))))))))(((((.....,,{({.,....}|,,,},.,|,,..,,,.,{|..(((((((....((((.............))))....)))))))..,,,))))).(((((((.....({{....)))....)).)))))...(((((((.((.,..,.,...}}.}}}}}}}..,...,,,,.,...,,....,))))..(((((((.{........})))).)))..,{{{{((({{.,||,,,,..,},{(((({.....)))))),.,))))))))),.))))).....))))))..),.))))))..,||,....,|||||||}||..||,..,,..,,,,},,.}}}....,,,)))))))).}))))))))..,))...))).))...)))))).))).)).))......{((((.....))))))))..))))))))).))},.}}|||||....,})))},)||,,,|},,...,.,,