Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_EPS15_0010200

Sequence Length

928 nt

GC Content

0.4246

AACAUCAUAGGAUCAAGUCCUGUUGCAGAUUUCUCUGCUAUUAAGGAACUAGAUACUCUUAACAAUGAAAUAGUUGACCUACAGAGGGAAAAGAAUAAUGUGGAACAGGACCUUAAGGAGAAGGAAGAUACUAUUAAACAGAGGACAAGUGAGGUUCAGGAUCUUCAAGAUGAAGUUCAAAGGGAGAAUACUAAUCUGCAAAAACUACAGGCCCAGAAACAGCAGGUACAGGAACUCCUUGAUGAACUGGAUGAGCAGAAAGCCCAGCUGGAGGAGCAACUCAAGGAAGUCAGAAAGAAAUGUGCUGAGGAGGCCCAACUGAUCUCUUCUCUGAAAGCUGAAUUAACUAGUCAGGAAUCGCAGAUCUCCACUUACGAAGAAGAAUUGGCAAAAGCUAGAGAAGAGCUGAGCCGUCUACAGCAAGAAACAGCAGAAUUGGAGGAGAGUGUAGAGUCAGGGAAGGCUCAGUUGGAACCUCUUCAGCAGCACCUACAAGAUUCACAACAGGAAAUUAGUUCAAUGCAAAUGAAACUGAUGGAAAUGAAAGAUUUGGAAAAUCAUAAUAGUCAGUUAAAUUGGUGCAGUAGCCCACACAGCAUUCUUGUAAACGGAGCUACAGAUUAUUGCAGCCUCAGCACCAGCAGCAGUGAAACAGCCAACCUUAAUGAACAUGUUGAAGGCCAGAGCAACCUAGAGUCUGAGCCCAUACACCAGGAAUCUCCAGCAAGAAGUAGUCCUGAACUACUGCCUUCUGGUGUGACUGAUGAAAAUGAGGUGACUACAGCUGUUACUGAAAAAGUUUGUUCUGAACUCGACAAUAAUAGACAUUCAAAAGAGGAAGAUCCAUUUAAUGUAGACUCAAGUUCGCUGACAGGUCCAGUUGCAGAUACAAACUUGGAUUUUUUCCAGUCUGAUCCUUUUGUUGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-236.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -254.30

Frequency: 0.0000

Diversity: 204.52

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(...((((((..((.((((((...(((((....))))).....))).))).))..)).......)))).....)((.((.(((((((((..(((...((.((.(((.((((((..(((((...((...(((.((((((....((((.......)))).((((((((.......((((((.((((((....((.((((((.....((........)).....))))))..))...))))))..))))))...((.((.....)).))(((.....)))..(((...((((((...........(((((((((((.((((((((.(.(((((((((...((((.........)))).....(((..(((((...........(((..((((...((((.......))))..)))))))...((........)).........))))).)))....)))))))))).))))))))..)))))))))))(((((.....((((..(....)..)))).((.....)).(((..(((((((....((((.............))))....)))))))..)))))))).(((((((.....(((....)))....)).)))))...(((((((.((..........)).))))))).....................((((((.(..((((((((.((..((((...((((((.((.(((..((..((((.(((.((((((.....))))))..))))))).))..))).))...))).))))))).(((......)))....)).))))))))..)))))))......))).)))....))))))))))).)))))))))...))...))).))...)))))).))).)).))......(((((.....))))))))..))))))))).))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(,,.(((((({(((.((((((...(((((....))))).....)))},)).)),.,)}},....})))....,){(.((.(((((((((..(((...((.((.(((.((((((..,((,(,,.{,.,.(((.((((({....((((.......}))).((((((((.......((((((.((((((....{{.((((((.....{{........}}.....))))))..}}...))))))..))))))..,{{.((.....}}.{{((((.{(..((..((({.....(((({.........(((((((((((.((((((((.{.(((((((((...((((.,.....,.))))...,{(({..(((((.,,......,.{{,..{(((...((((.......))))..)))}}}}.,.((........)).....,},.))))).))).},.)))))))))).))))))))..)))))))))))(((((.....,,{({.,....}|,,,},.,|,,..,,,.,{|..(((((((....((((.............))))....)))))))..,,,))))).(((((((.....({{....)))....)).)))))...(((((((.((.,..,,,...}}.}}}}}}}..,...,,,,.,...,,....,))))..(((((((.{........})))).)))..,{{{{((({{.,||,,,,,.,},{(((({.....)))))),.,))))))}))}.)))}).....))))))..),.)})))),.,||,....,|||||||}||..||,..},..,,,,},,.}}}....,,|)))))))).}))))))))..,))...))).))...)))))).))).)).))......{((((.....))))))))..))))))))).)))}