Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EPS15_0010400
Sequence Length
1321 nt
GC Content
0.4254
GCCAUGUUUUUGGUAUACUGUGCACUGGAGAAAGAACCUGUGCCAAUGUCCUUGCCUCCAGCCUUGGUGCCACCAUCUAAGAGAAAAACGUGGGUUGUAUCCCCUGCAGAAAAAGCUAAAUAUGAUGAAAUCUUCCUGAAAACUGAUAAAGAUAUGGACGGAUUUGUGUCUGGAUUGGAGGUCCGUGAAAUAUUCUUGAAAACAGGUUUACCUUCUACCUUACUAGCCCAUAUAUGGUCAUUAUGCGACACAAAGGACUGUGGGAAGCUUUCAAAGGAUCAGUUUGCCUUGGCUUUUCACUUAAUCAGUCAGAAGUUAAUCAAGGGCAUUGAUCCUCCUCACGUUCUUACUCCUGAAAUGAUUCCACCAUCAGACAGGGCCAGUUUACAAAAGAACAUCAUAGGAUCAAGUCCUGUUGCAGAUUUCUCUGCUAUUAAGGAACUAGAUACUCUUAACAAUGAAAUAGUUGACCUACAGAGGGAAAAGAAUAAUGUGGAACAGGACCUUAAGGAGAAGGAAGAUACUAUUAAACAGAGGACAAGUGAGGUUCAGGAUCUUCAAGAUGAAGUUCAAAGGGAGAAUACUAAUCUGCAAAAACUACAGGCCCAGAAACAGCAGGUACAGGAACUCCUUGAUGAACUGGAUGAGCAGAAAGCCCAGCUGGAGGAGCAACUCAAGGAAGUCAGAAAGAAAUGUGCUGAGGAGGCCCAACUGAUCUCUUCUCUGAAAGCUGAAUUAACUAGUCAGGAAUCGCAGAUCUCCACUUACGAAGAAGAAUUGGCAAAAGCUAGAGAAGAGCUGAGCCGUCUACAGCAAGAAACAGCAGAAUUGGAGGAGAGUGUAGAGUCAGGGAAGGCUCAGUUGGAACCUCUUCAGCAGCACCUACAAGAUUCACAACAGGAAAUUAGUUCAAUGCAAAUGAAACUGAUGGAAAUGAAAGAUUUGGAAAAUCAUAAUAGUCAGUUAAAUUGGUGCAGUAGCCCACACAGCAUUCUUGUAAACGGAGCUACAGAUUAUUGCAGCCUCAGCACCAGCAGCAGUGAAACAGCCAACCUUAAUGAACAUGUUGAAGGCCAGAGCAACCUAGAGUCUGAGCCCAUACACCAGGAAUCUCCAGCAAGAAGUAGUCCUGAACUACUGCCUUCUGGUGUGACUGAUGAAAAUGAGGUGACUACAGCUGUUACUGAAAAAGUUUGUUCUGAACUCGACAAUAAUAGACAUUCAAAAGAGGAAGAUCCAUUUAAUGUAGACUCAAGUUCGCUGACAGGUCCAGUUGCAGAUACAAACUUGGAUUUUUUCCAGUCUGAUCCUUUUGUUGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-336.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -364.07
Frequency: 0.0000
Diversity: 313.72
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((......))))....((.((((.((........)).))))))...(((((((((((((((((..(((...(((((...........(.(((......)))).((.......)).......(((.(((((((((...................))).))))))..)))....((((((((((.((((.....((((.......(((((((((((.(((((...((((....((((((....((.....))...))))))((.(((((.((....))..))))).))(((((((((.(((.....))).)))))))))....)))).((((((((......(((((((((((((...((((......))))..))))...)))......)))))).....))))))))((((((((.((.((((((((.((....((((((((.....((........))..)))))..)))..))))))).......))).)).))))))))..)))))))))))..........)))))......)))).....)))))))))))))).....((((((.((((((....((.((((((.....((........)).....))))))..))...))))))..))))))))))).)))..)))....)))))))).......))))))...............(((((((((((.((((((((.(.(((((((((...((((.........)))).....(((..(((((...........(((..((((...((((.......))))..)))))))...((........)).........))))).)))....)))))))))).))))))))..)))))))))))(((((.....((((..(....)..)))).((.....)).(((..(((((((....((((.............))))....)))))))..)))))))).(((((((.....(((....)))....)).)))))...(((((((.((..........)).)))))))....((((((...........((((((.(..((((((((.((..((((...((((((.((.(((..((..((((.(((.((((((.....))))))..))))))).))..))).))...))).))))))).(((......)))....)).))))))))..)))))))...............((((((((((((((.....((((..(((((.(..(((....)))..).))).)).))))....)))))))............))))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((......)))),,,.((.((((.((........)).)))))).,,}.....(((((((({{({{(((...({(({...........{,(((......}})}||{.......,}.......{{{.{{(((((((......{{.....}}.|..}}}.}}}))).})))},..{(((((((((.((((.....((((.......(((({((((((.(((((...{(((....,{((({.,{,{,.,,,.,,,{{(({,((((({.........{(((((((,.{((((((((((((.(((.....))).))))))},....,)))))))))))))}}.}}}||}}}|,,{{(({...{({{......))))..}}))),.,||,,.....,)))).,,..,,)}},..((((((((.((.(((((((({,{....{(({((((.....{{........}}..)))))..}}}.,}))))},.......,)).)).))))))))..)))))))))))..........)}}})......)))).....)))))))))))))).....((((((.((((((....{{.((((((.....{{........}}.....))))))..}}...))))))..))))))))})).))}..,,),},,)))))))).,((((..(((({..(((((........(((((((((((.((((((((.{.(((((((((...((((.,.....,.))))...,{(({..(((((.,,......,.{{,..{(((...((((.......))))..)))}}}}.,.((........)).....,},.))))).))).},.)))))))))).))))))))..)))))))))))(((((.....,,{({.,....}|,,,||.{{{,..,,,..||..{((((((....{(({.............)))}....)))))))..,,,}}))).(((((((.....(({....)))....)).)))))...{{{{(((.({....,,,...}}.}||||},,,{{{{,.{({{{,.,.....|||}}..(((((((.{........})))).))),.,,{{.(((..{{,.((((.{{(.((((((.....))))))..))))))).))..))),)}...,))))))|,|....}}}))),}},...,(((((((((((((((.(((........(((((..,{{{.(({...))).)))))))).,,,....||,..}}},...))).)))).)))).)))))))|(((.....))),.))))))))))..)))),}.
Back