Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EPS15_0010600
Sequence Length
1573 nt
GC Content
0.4247
CAUGAUACCAGUAGUCCUUUGCUAAUCAGUGGAACCUCUGCAGCUGAGCUCCCAUGGGCUGUAAAACCUGAAGAUAAGGCCAAAUAUGAUGCAAUAUUUGAUAGUUUAAGCCCAGUGAAUGGAUUUCUGUCUGGUGAUAAAGUGAAACCAGUGUUGCUCAACUCUAAGUUACCUGUGGAUAUCCUUGGAAGAGUUUGGGAGUUGAGUGAUAUUGACCAUGAUGGAAUGCUUGACAGAGAUGAGUUUGCAGUUGCCAUGUUUUUGGUAUACUGUGCACUGGAGAAAGAACCUGUGCCAAUGUCCUUGCCUCCAGCCUUGGUGCCACCAUCUAAGAGAAAAACGUGGGUUGUAUCCCCUGCAGAAAAAGCUAAAUAUGAUGAAAUCUUCCUGAAAACUGAUAAAGAUAUGGACGGAUUUGUGUCUGGAUUGGAGGUCCGUGAAAUAUUCUUGAAAACAGGUUUACCUUCUACCUUACUAGCCCAUAUAUGGUCAUUAUGCGACACAAAGGACUGUGGGAAGCUUUCAAAGGAUCAGUUUGCCUUGGCUUUUCACUUAAUCAGUCAGAAGUUAAUCAAGGGCAUUGAUCCUCCUCACGUUCUUACUCCUGAAAUGAUUCCACCAUCAGACAGGGCCAGUUUACAAAAGAACAUCAUAGGAUCAAGUCCUGUUGCAGAUUUCUCUGCUAUUAAGGAACUAGAUACUCUUAACAAUGAAAUAGUUGACCUACAGAGGGAAAAGAAUAAUGUGGAACAGGACCUUAAGGAGAAGGAAGAUACUAUUAAACAGAGGACAAGUGAGGUUCAGGAUCUUCAAGAUGAAGUUCAAAGGGAGAAUACUAAUCUGCAAAAACUACAGGCCCAGAAACAGCAGGUACAGGAACUCCUUGAUGAACUGGAUGAGCAGAAAGCCCAGCUGGAGGAGCAACUCAAGGAAGUCAGAAAGAAAUGUGCUGAGGAGGCCCAACUGAUCUCUUCUCUGAAAGCUGAAUUAACUAGUCAGGAAUCGCAGAUCUCCACUUACGAAGAAGAAUUGGCAAAAGCUAGAGAAGAGCUGAGCCGUCUACAGCAAGAAACAGCAGAAUUGGAGGAGAGUGUAGAGUCAGGGAAGGCUCAGUUGGAACCUCUUCAGCAGCACCUACAAGAUUCACAACAGGAAAUUAGUUCAAUGCAAAUGAAACUGAUGGAAAUGAAAGAUUUGGAAAAUCAUAAUAGUCAGUUAAAUUGGUGCAGUAGCCCACACAGCAUUCUUGUAAACGGAGCUACAGAUUAUUGCAGCCUCAGCACCAGCAGCAGUGAAACAGCCAACCUUAAUGAACAUGUUGAAGGCCAGAGCAACCUAGAGUCUGAGCCCAUACACCAGGAAUCUCCAGCAAGAAGUAGUCCUGAACUACUGCCUUCUGGUGUGACUGAUGAAAAUGAGGUGACUACAGCUGUUACUGAAAAAGUUUGUUCUGAACUCGACAAUAAUAGACAUUCAAAAGAGGAAGAUCCAUUUAAUGUAGACUCAAGUUCGCUGACAGGUCCAGUUGCAGAUACAAACUUGGAUUUUUUCCAGUCUGAUCCUUUUGUUGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-418.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -449.26
Frequency: 0.0000
Diversity: 355.88
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((.......)))...(((((((.((.(((...(((((((((((((((....))))).....(((((.......((((((((((......))))))).........)))((((((((..(((((((((.(((..((..(((....(((((((((((((((((((.((..((..((....))..))..)).))..)))))))))))))))))..)))..))....))).)))))))))((((((((((((((((......))))).)))))((((.((........)).)))).....(((((((((((((((((..(((...(((((...........(.(((......)))).((.......)).......(((.(((((((((...................))).))))))..)))....((((((((((.((((.....((((.......(((((((((((.(((((...((((....((((((....((.....))...))))))((.(((((.((....))..))))).))(((((((((.(((.....))).)))))))))....)))).((((((((......(((((((((((((...((((......))))..))))...)))......)))))).....))))))))((((((((.((.((((((((.((....((((((((.....((........))..)))))..)))..))))))).......))).)).))))))))..)))))))))))..........)))))......)))).....)))))))))))))).....((((((.((((((....((.((((((.....((........)).....))))))..))...))))))..))))))))))).)))..)))....)))))))).......))))))..(((..(((.....(((((((((((.((((((((.(.(((((((((...((((.........)))).....(((..(((((...........(((..((((...((((.......))))..)))))))...((........)).........))))).)))....)))))))))).))))))))..)))))))))))(((((.....((((..(....)..)))).((.....)).(((..(((((((....((((.............))))....)))))))..)))))))).(((((((.....(((....)))....)).)))))...(((((((.((..........)).)))))))..........)))..)))...((((((.(..((((((((.((..((((...((((((.((.(((..((..((((.(((.((((((.....))))))..))))))).))..))).))...))).))))))).(((......)))....)).))))))))..))))))).......(((((...(((.(((...))).))))))))))))))..)))))))).))))).))))))))))..((.(((.(((.....)))))).)).))).)).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((.......)))...(((((({,{{.(((...(((((((((({((({,..{{((({..,...(((.......))).(((((((......)))))))....,|,.,}}||{{{({({..(((((((((.(((..,...{{,....((((((((((((((((({(.((..((,.((....))..))..)).))..)))))))))))))))))..}},..}}...,))).))))))))){{|||{((((((((((......))))).))))}((((.((........)).)))),,,,.(((((((((((((({{({{(((...({(({...........{,(((......}})}||{.......,}.......{{{.{{(((((((......{{.....}}.,..}}}.}}}))).})))},..{(((((((((.((((.....((((.......(((({((((((.(((((...{(((....,{((({.,{,{,.,,,.,,,{{(({,((((({.........{(((((((,.{((((((((((((.(((.....))).))))))},....,)))))))))))))}}.}}}||||||,,{{{({...{({{.....,))))..}}))),.,||{,......)))).,,..,,)}},..((((((((.((.((((((((,,{....{(({((((.....{{........}}..)))))..))).,}))))},.......,)).)).))))))))..)))))))))))..........)}}})......)))).....)))))))))))))).....{(((((.((((((....{{.((((((.....{{........}}.....))))))..}}...))))))..))))))))})).))}..,,),},,)))))))).......)))))).,{{,....,.....(((((((((((.((((((((.{.(((((((((...((((.,.....,.))))...,{(({..(((((.,,......,.{{,..{(((...((((.......))))..)))}}}}.,.((........)).....,},.))))).))).},.)))))))))).))))))))..)))))))))))((({{.....,,(({.,....}},},}}.||,,..,,,..,|..(((((((....((((.............))))....)))))))..}}}))))).(((((((.....(((....)))....)).)))))...(((((({.({.,,,{.,,.,||.}|||||}.,{{{{..,{{{{,.,,..,.{(({{..(,,(((({({,.,,..,{||,,.|||{{{.((.(((..({..((((.(((.((((((.....))))))..))))))).))..))).))...})),)))}}}}.,,|,}}},,)))....,)})}))}))),.))})})),,,,,..{{{((...{{{.(({...))).))}}}))),}}}}}..})))}))).},))).))))))))))..{{.(({{(((.....)))))).)).)))..}.)))))))
Back