Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EPS15_0010700
Sequence Length
1807 nt
GC Content
0.4267
GUUGAUACAGGCAAUACUGGAAGGGUGUUGGCUUCUGAUGCUGCUGCUUUCCUGAAAAAAUCAGGGCUUCCAGACUUGAUACUUGGAAAGAUUUGGGAUUUAGCCGACACAGAUGGCAAAGGUAUCCUGAACAAACAAGAAUUCUUUGUUGCUUUGCGUCUUGUGGCAUGUGCCCAGAAUGGAUUGGAAGUUUCACUAAGUAGUUUGAACCUGGCUGUUCCUCCACCAAGAUUUCAUGAUACCAGUAGUCCUUUGCUAAUCAGUGGAACCUCUGCAGCUGAGCUCCCAUGGGCUGUAAAACCUGAAGAUAAGGCCAAAUAUGAUGCAAUAUUUGAUAGUUUAAGCCCAGUGAAUGGAUUUCUGUCUGGUGAUAAAGUGAAACCAGUGUUGCUCAACUCUAAGUUACCUGUGGAUAUCCUUGGAAGAGUUUGGGAGUUGAGUGAUAUUGACCAUGAUGGAAUGCUUGACAGAGAUGAGUUUGCAGUUGCCAUGUUUUUGGUAUACUGUGCACUGGAGAAAGAACCUGUGCCAAUGUCCUUGCCUCCAGCCUUGGUGCCACCAUCUAAGAGAAAAACGUGGGUUGUAUCCCCUGCAGAAAAAGCUAAAUAUGAUGAAAUCUUCCUGAAAACUGAUAAAGAUAUGGACGGAUUUGUGUCUGGAUUGGAGGUCCGUGAAAUAUUCUUGAAAACAGGUUUACCUUCUACCUUACUAGCCCAUAUAUGGUCAUUAUGCGACACAAAGGACUGUGGGAAGCUUUCAAAGGAUCAGUUUGCCUUGGCUUUUCACUUAAUCAGUCAGAAGUUAAUCAAGGGCAUUGAUCCUCCUCACGUUCUUACUCCUGAAAUGAUUCCACCAUCAGACAGGGCCAGUUUACAAAAGAACAUCAUAGGAUCAAGUCCUGUUGCAGAUUUCUCUGCUAUUAAGGAACUAGAUACUCUUAACAAUGAAAUAGUUGACCUACAGAGGGAAAAGAAUAAUGUGGAACAGGACCUUAAGGAGAAGGAAGAUACUAUUAAACAGAGGACAAGUGAGGUUCAGGAUCUUCAAGAUGAAGUUCAAAGGGAGAAUACUAAUCUGCAAAAACUACAGGCCCAGAAACAGCAGGUACAGGAACUCCUUGAUGAACUGGAUGAGCAGAAAGCCCAGCUGGAGGAGCAACUCAAGGAAGUCAGAAAGAAAUGUGCUGAGGAGGCCCAACUGAUCUCUUCUCUGAAAGCUGAAUUAACUAGUCAGGAAUCGCAGAUCUCCACUUACGAAGAAGAAUUGGCAAAAGCUAGAGAAGAGCUGAGCCGUCUACAGCAAGAAACAGCAGAAUUGGAGGAGAGUGUAGAGUCAGGGAAGGCUCAGUUGGAACCUCUUCAGCAGCACCUACAAGAUUCACAACAGGAAAUUAGUUCAAUGCAAAUGAAACUGAUGGAAAUGAAAGAUUUGGAAAAUCAUAAUAGUCAGUUAAAUUGGUGCAGUAGCCCACACAGCAUUCUUGUAAACGGAGCUACAGAUUAUUGCAGCCUCAGCACCAGCAGCAGUGAAACAGCCAACCUUAAUGAACAUGUUGAAGGCCAGAGCAACCUAGAGUCUGAGCCCAUACACCAGGAAUCUCCAGCAAGAAGUAGUCCUGAACUACUGCCUUCUGGUGUGACUGAUGAAAAUGAGGUGACUACAGCUGUUACUGAAAAAGUUUGUUCUGAACUCGACAAUAAUAGACAUUCAAAAGAGGAAGAUCCAUUUAAUGUAGACUCAAGUUCGCUGACAGGUCCAGUUGCAGAUACAAACUUGGAUUUUUUCCAGUCUGAUCCUUUUGUUGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-495.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -532.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 317.13
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....(((((((((((.....)))))))((((((..(((((..(..((((((.........(((((..((((((.(((.((((....(.((((((((...((((.......))))......)))))))))...)))).)))((..(((((((((.(((((..(((((((...((....((.((((..((((((((......(((((((((.(((..(((((((..((((((((((.(((....((((..((((((....))))))...(((((((..((((.((((((((((......(((.......))).(((((((......)))))))........)))))...((((..(((((((((.(((..((..(((....(((((((((((((((((((.((..((..((....))..))..)).))..)))))))))))))))))..)))..))....))).)))))))))..))))((((((((((......))))).)))))...((((((.(((.((.(......).)).)))..)))))).(((((((....)).)))))........)))))..)).))..)))))))....))))..))).))))))))))..))....(((...(((((((..((((((((.((.......)).))))))))...))).)))).....)))((((.((((((.(((((...((((....((((((....((.....))...))))))((.(((((.((....))..))))).))(((((((((.(((.....))).)))))))))....)))).((((((((......(((((((((((((...((((......))))..))))...)))......)))))).....))))))))((((((((.((.((((((((.((....((((((((.....((........))..)))))..)))..))))))).......))).)).))))))))..))))))))))).))))...........)))))..))).)))))))))((((...))))..((((((.((((((....((.((((((.....((........)).....))))))..))...))))))..))))))...((.((.....)).))(((((..(((...(((((...((((...........(((((((((((.((((((((.(.(((((((((...((((.........)))).....(((..(((((...........(((..((((...((((.......))))..)))))))...((........)).........))))).)))....)))))))))).))))))))..)))))))))))(((((.....((((..(....)..)))).((.....)).(((..(((((((....((((.............))))....)))))))..)))))))).(((((((.....(((....)))....)).))))).)))).))).)).)))....)))))...))))))))..))))))....)).))))))).))))))))))))))..)))))))))))))......)))))).)..)))))))))))...))))....))((((..(.((...(((((..((((((..((((((.......))))))....((((((((((((((((.(((........(((((...(((.(((...))).))))))))........(((....)))..))).)))).)))).))))))))..))))))..)))))....))....)..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.,.,.(((((((((((.....)))))))((((((..(((((..(..((((((.........(((((..((((({.,,,.((((....{.(((((((({{.((({.......}))).,,,..)))))))),...)))).,,|((..(((((((((.(((((.,(((((((...((....((.((((..((((((((..,...{((((((((.(((,.(((((({..((((((((((.(((..,,({((((.{((,,...})},))}...(((((((..(({(.((((((((((.,{{,.(((.......))).(((((((......)))))))....}},.))))),..((((..(((((((((.(((,.,...{{{....((((((((((((((((({(.((..((,.((....))..))..)).))..)))))))))))))))))..}}}..},...,))).)))))))))..))))((((((((((......))))).)))))...((((((.(((.((.{......}.)).)))..)))))).(((((({....)),)})))........}))))..}}.))..)))))))....))),..))).))))))))))..}}....(({...(((((((..((((((((.{{.......}).))))))))...))),}))).....)))((((.((((((.(((((...{(((....,{((({.,{,{,.,,,.,,,{{(({,((((({.........{(((((((,.{((((((((((((.(((.....))).))))))},....,)))))))))))))}}.}}}||}}||,,{{{{{...{({{.....,))))..}}))),.,||,,.....,)))).,,..,,)}},..((((((((.((.((((((((,,{....{(({((((.....{{........}}..)))))..))).,}))))},.......,)).)).))))))))..))))))))))).}}}}...........))))),.))).))))))))}{{{{,,.,,,},.((((((.((((((....{{.((((((.....{{........}}.....))))))..}}...))))))..)))))),,.{{.((.....)).),((({{{((.(({{,{,......,|{...........(((((((((((.((((((((.{.(((((((((...((((.,.....,.))))...,{(({..(((((.,,......,.{{,..{(((...((((.......))))..)))}}}}.,.((........)).....,},.))))).))).},.)))))))))).))))))))..)))))))))))(((((.....,,{(,.,....}}}},}}.,|,,...,,.,{|..(((((((....((((.............))))....)))))))..,,,))))).(((((((.....(((....)))....)).))))).,....})))..)))},}}.,},}}.,,))))))))..))))))....)).))))))),))))))))))))))..)))))))))))))......)))))).}..)))))))))))...))))..,.))((((..{.((,..(((((..((((((..((((((.......))))))....((((((((((((((((.(((........(((((..,{{{.(({...))).)))))))).,,,....|,,..,}},...))).)))).)))).))))))))..}}))))..)))))..,.))....}..))))
Back