Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EPS15_0013800
Sequence Length
1644 nt
GC Content
0.4270
UUAUCAAGUGGGAAUCCUGUAUAUGAAAAAUACUAUAGACAGGUUGAUACAGGCAAUACUGGAAGGGUGUUGGCUUCUGAUGCUGCUGCUUUCCUGAAAAAAUCAGGGCUUCCAGACUUGAUACUUGGAAAGAUUUGGGAUUUAGCCGACACAGAUGGCAAAGGUAUCCUGAACAAACAAGAAUUCUUUGUUGCUUUGCGUCUUGUGGCAUGUGCCCAGAAUGGAUUGGAAGUUUCACUAAGUAGUUUGAACCUGGCUGUUCCUCCACCAAGAUUUCAUGAUACCAGUAGUCCUUUGCUAAUCAGUGGAACCUCUGCAGCUGAGCUCCCAUGGGCUGUAAAACCUGAAGAUAAGGCCAAAUAUGAUGCAAUAUUUGAUAGUUUAAGCCCAGUGAAUGGAUUUCUGUCUGGUGAUAAAGUGAAACCAGUGUUGCUCAACUCUAAGUUACCUGUGGAUAUCCUUGGAAGAGUUUGGGAGUUGAGUGAUAUUGACCAUGAUGGAAUGCUUGACAGAGAUGAGUUUGCAGUUGCCAUGUUUUUGGUAUACUGUGCACUGGAGAAAGAACCUGUGCCAAUGUCCUUGCCUCCAGCCUUGGUGCCACCAUCUAAGAGAAAAACGUGGGUUGUAUCCCCUGCAGAAAAAGCUAAAUAUGAUGAAAUCUUCCUGAAAACUGAUAAAGAUAUGGACGGAUUUGUGUCUGGAUUGGAGGUCCGUGAAAUAUUCUUGAAAACAGGUUUACCUUCUACCUUACUAGCCCAUAUAUGGUCAUUAUGCGACACAAAGGACUGUGGGAAGCUUUCAAAGGAUCAGUUUGCCUUGGCUUUUCACUUAAUCAGUCAGAAGUUAAUCAAGGGCAUUGAUCCUCCUCACGUUCUUACUCCUGAAAUGAUUCCACCAUCAGACAGGGCCAGUUUACAAAAGAACAUCAUAGGAUCAAGUCCUGUUGCAGAUUUCUCUGCUAUUAAGGAACUAGAUACUCUUAACAAUGAAAUAGUUGACCUACAGAGGGAAAAGAAUAAUGUGGAACAGGACCUUAAGGAGAAGGAAGAUACUAUUAAACAGAGGACAAGUGAGGUUCAGGAUCUUCAAGAUGAAGUUCAAAGGGAGAAUACUAAUCUGCAAAAACUACAGGCCCAGAAACAGCAGGUACAGGAACUCCUUGAUGAACUGGAUGAGCAGAAAGCCCAGCUGGAGGAGCAACUCAAGGAAGUCAGAAAGAAAUGUGCUGAGGAGGCCCAACUGAUCUCUUCUCUGAAAGCUGAAUUAACUAGUCAGGAAUCGCAGAUCUCCACUUACGAAGAAGAAUUGGCAAAAGCUAGAGAAGAGCUGAGCCGUCUACAGCAAGAAACAGCAGAAUUGGAGGAGAGUGUAGAGUCAGGGAAGGCUCAGUUGGAACCUCUUCAGCAGCACCUACAAGAUUCACAACAGGAAAUUAGUUCAAUGCAAAUGAAACUGAUGGAAAUGAAAGAUUUGGAAAAUCAUAAUAGUCAGUUAAAUUGGUGCAGUAGCCCACACAGCAUUCUUGUAAACGGAGCUACAGAUUAUUGCAGCCUCAGCACCAGCAGCAGUGAAACAGCCAACCUUAAUGAACAUGUUGAAGGCCAGAGCAACCUAGAGUCUGAGCCCAUACACCAGGAAUCUCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-453.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -487.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 331.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((.((((.(((((.((((........)))).))))).......((.(((((((.....))))))).))......((....))..((((((.....)))))).))))..))))))))..((((....((((((((...((((.......))))......))))))))......(((.((((..(((((((((.(((((..(((((((...((....((.((((..((((((((......(((((((((.(((..(((((((..((((((((((.(((....((((..((((((....))))))...(((((((..((((.((((((((((......(((.......))).(((((((......)))))))........)))))...((((..(((((((((.(((..((..(((....(((((((((((((((((((.((..((..((....))..))..)).))..)))))))))))))))))..)))..))....))).)))))))))..))))((((((((((......))))).)))))...((((((.(((.((.(......).)).)))..)))))).(((((((....)).)))))........)))))..)).))..)))))))....))))..))).))))))))))..))....(((...(((((((..((((((((.((.......)).))))))))...))).)))).....)))((((.((((((.(((((...((((....((((((....((.....))...))))))((.(((((.((....))..))))).))(((((((((.(((.....))).)))))))))....)))).((((((((......(((((((((((((...((((......))))..))))...)))......)))))).....))))))))((((((((.((.((((((((.((....((((((((.....((........))..)))))..)))..))))))).......))).)).))))))))..))))))))))).))))...........)))))..))).)))))))))((((...))))..((((((.((((((....((.((((((.....((........)).....))))))..))...))))))..))))))...((.((.....)).))(((((..(((...(((((...((((...........(((((((((((.((((((((.(.(((((((((...((((.........)))).....(((..(((((...........(((..((((...((((.......))))..)))))))...((........)).........))))).)))....)))))))))).))))))))..)))))))))))(((((.....((((..(....)..)))).((.....)).(((..(((((((....((((.............))))....)))))))..)))))))).(((((((.....(((....)))....)).))))).)))).))).)).)))....)))))...))))))))..))))))....)).))))))).))))))))))))))..)))))))((..((........))..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,({{{{||(,(((,.(((((.((((........)))}.})))).......((.(((((((.....))))))}.)},..,,.((....)}..{(((((.....)))))|.|}}|,,}))))))}..{({{..|.{((((((({,.((({.......,)))..,},.))))))}}......((,{((((..(((((((((.(((((.,(((((((...((....((.((((..((((((((..,...{((((((((.(((,.(((((({..((((((((((.(((..,,({((((.{((,,...})},))}...(((((((..(({(.((((((((((.,{{,.(((.......))).(((((((......)))))))....}},.))))),..((((..(((((((((.(((,.,...{{{....((((((((((((((((({(.((..((,.((....))..))..)).))..)))))))))))))))))..}}}..},...,))).)))))))))..))))((((((((((......))))).)))))...((((((.(((.((.{......}.)).)))..)))))).(((((({....)),)})))........}))))..}}.))..)))))))....))),..))).))))))))))..}}....(({...(((((((..((((((((.{{.......}).))))))))...))),}))).....)))((((.((((((.(((((...{(((....,{((({.,{,{,.,,,.,,,{{(({,((((({.........{(((((((,.{((((((((((((.(((.....))).))))))},....,)))))))))))))}}.}}}||}}||,,{{{{{...{({{.....,))))..}}))),.,||,,.....,)))).,,..,,)}},..((((((((.((.((((((((,,{....{(({((((.....{{........}}..)))))..))).,}))))},.......,)).)).))))))))..))))))))))).}}}}...........))))),.))).))))))))}{{{{,,.,,,},.((((((.((((((....{{.((((((.....{{........}}.....))))))..}}...))))))..)))))),,.{{.((.....)).),((({{{((.(({{,{,......,|{...........(((((((((((.((((((((.{.(((((((((...((((.,.....,.))))...,{(({..(((((.,,......,.{{,..{(((...((((.......))))..)))}}}}.,.((........)).....,},.))))).))).},.)))))))))).))))))))..)))))))))))(((((.....,,{(,.,....}}}},}}.,|,,...,,.,{|..(((((((....((((.............))))....)))))))..,,,))))).(((((((.....(((....)))....)).))))).,....})))..)))},}}.,},}}.,,))))))))..))))))....)).))))))),))))))))))))))..)))))))||..||......,,)),.))})))
Back