Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EPS15_0016000
Sequence Length
624 nt
GC Content
0.4167
UGGGUUGUAUCCCCUGCAGAAAAAGCUAAAUAUGAUGAAAUCUUCCUGAAAACUGAUAAAGAUAUGGACGGAUUUGUGUCUGGAUUGGAGGUCCGUGAAAUAUUCUUGAAAACAGGUUUACCUUCUACCUUACUAGCCCAUAUAUGGUCAUUAUGCGACACAAAGGACUGUGGGAAGCUUUCAAAGGAUCAGUUUGCCUUGGCUUUUCACUUAAUCAGUCAGAAGUUAAUCAAGGGCAUUGAUCCUCCUCACGUUCUUACUCCUGAAAUGAUUCCACCAUCAGACAGGGCCAGUUUACAAAAGAACAUCAUAGGAUCAAGUCCUGUUGCAGAUUUCUCUGCUAUUAAGGAACUAGAUACUCUUAACAAUGAAAUAGUUGACCUACAGAGGGAAAAGAAUAAUGUGGAACAGGACCUUAAGGAGAAGGAAGAUACUAUUAAACAGAGGACAAGUGAGGUUCAGGAUCUUCAAGAUGAAGUUCAAAGGGAGAAUACUAAUCUGCAAAAACUACAGGCCCAGAAACAGCAGGUACAGGAACUCCUUGAUGAACUGGAUGAGCAGAAAGCCCAGCUGGAGGAGCAACUCAAGGAAGUCAGAAAGAAAUGUGCUGAGGAGGCCCAACUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-146.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -159.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 161.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...(((.(.(((.(.....((.....(((......((((((............(((((((((....)))))))))...((((((((((.((((.....((((.......(((((((((((.(((((...((((....((((((....((.....))...))))))((.(((((.((....))..))))).))(((((((((.(((.....))).)))))))))....)))).((((((((......(((((((((((((...((((......))))..))))...)))......)))))).....))))))))((((((((.((.((((((((.((....((((((((.....((........))..)))))..)))..))))))).......))).)).))))))))..)))))))))))..........)))))......)))).....)))))))))))))).....((((((.((((((....((.((((((.....((........)).....))))))..))...))))))..))))))((.((.((.....)).)).)).(((......))).)))))))))...))...).))).).)))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((...{({.{,(((,,.....,,.....,,,,,,..,((((((.....,,.....{{{{{{(({,,..}}}})))))...{(((((((((.((((.....((((.......(((((((((((.(((((...{(((....,{((({.,{,{,.,,,.,,,{{(({,((((({.........{(((((((,.{((((((((((((.(((.....))).))))))},....,)))))))))))))}}.}}}||||||,,{{{{{...{({{.....,))))..}}))),.,||{,......)))).,,..,,)}},..((((((((.((.((((((((,,{....{(({((((.....{{........}}..)))))..))).,}))))},.......,)).)).))))))))..)))))))))))..........)))))......)))).....)))))))))))))}.....{(((((.((((((....{{.((((((.....,{........}}.....))))))..,,...))))))..)))))},,.{,.((.....}}.),|||.|,|.,,}..})),))))})))}...,,...}.))),).}}}))))),..,.
Back