Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EPS15_0017300
Sequence Length
552 nt
GC Content
0.4130
GCCAUGUUUUUGGUAUACUGUGCACUGGAGAAAGAACCUGUGCCAAUGUCCUUGCCUCCAGCCUUGGUGCCACCAUCUAAGAGAAAAACGUGGGUUGUAUCCCCUGCAGAAAAAGCUAAAUAUGAUGAAAUCUUCCUGAAAACUGAUAAAGAUAUGGACGGAUUUGUGUCUGGAUUGGAGGUCCGUGAAAUAUUCUUGAAAACAGGUUUACCUUCUACCUUACUAGCCCAUAUAUGGUCAUUAUGCGACACAAAGGACUGUGGGAAGCUUUCAAAGGAUCAGUUUGCCUUGGCUUUUCACUUAAUCAGUCAGAAGUUAAUCAAGGGCAUUGAUCCUCCUCACGUUCUUACUCCUGAAAUGAUUCCACCAUCAGACAGGGCCAGUUUACAAAAGAACAUCAUAGGAUCAAGUCCUGUUGCAGAUUUCUCUGCUAUUAAGGAACUAGAUACUCUUAACAAUGAAAUAGUUGACCUACAGAGGGAAAAGAAUAAUGUGGAACAGGACCUUAAGGAGAAGGAAGAUACUAUUAAACAGAGGACAAGUGAGGUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-127.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -139.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 196.89
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((((.(((.((.((((.((........)).)))))).)))))....(((......((((...)))).....))))))))))))).(((.....(((.((.......((.....(((((..((((((((.....(((((..(((((((((....)))))))))..))))).(((((((((....(((((......((((.........)))).(((.((((....(((((.(((((.........((((..(((((((........((((((((..(((((((((((((.(((.....))).)))))))).....))))))))))))).......)))))))))))...)))))...)))))......)))).)))......)))))..)))).)))))..((((((((.((.((((((((.((....((((((((.....((........))..)))))..)))..))))))).......))).)).))))))))..........))))))))..))))).....))......)))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((({{({{{{{{|,,..,{.{{|{,{{,,...,..)|,}}|||,,{||{|{{{{((({{{,(,((((,..,,)),},,,}.,,,,,,,|}||{,,,...}}||||{.......,|,.....{((({..((((((({.....(({,,..{{{{{{||{.,,,}))}})))},.,))))}|||{{{{,,..,,,|{{{{....}|||{,|.{{{{{{,{|{{{.,.{(((.....{((({,{{,{..,.,...{(((({.(((((,.........{(((((((,.{((((((((((((.(((.....))).))))))),....,)))))))))))))}}.}}})))))).,{{{{{...{({{.....,))))..}}))),.,||{{....,,)))}.||,,,}}}}}..((((((((.((.((({{(((||,....{{{{{{{{.....|{........}}..)))))..))}.,}})))),...,...})).)).)))))))),,},}}}}},)))}))))..}}}},....}))),}}.,,})))},)}}
Back