Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_EPS15_0018600

Sequence Length

356 nt

GC Content

0.4017

GCCAUGUUUUUGGUAUACUGUGCACUGGAGAAAGAACCUGUGCCAAUGUCCUUGCCUCCAGCCUUGGUGCCACCAUCUAAGAGAAAAACGUGGGUUGUAUCCCCUGCAGAAAAAGCUAAAUAUGAUGAAAUCUUCCUGAAAACUGAUAAAGAUAUGGACGGAUUUGUGUCUGGAUUGGAGGUCCGUGAAAUAUUCUUGAAAACAGGUUUACCUUCUACCUUACUAGCCCAUAUAUGAACAUCAUAGGAUCAAGUCCUGUUGCAGAUUUCUCUGCUAUUAAGGAACUAGAUACUCUUAACAAUGAAAUAGUUGACCUACAGAGCUUUAUUUAACCACACAUGAACCUUCCAUUCUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-68.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -76.82

Frequency: 0.0000

Diversity: 72.01

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((..((((....(.((((((((((.(((.((.(......).)).)))..)))))).(((((((....)).)))))........(.(((......)))))))).)....))))))))))...(((((((((...................))).))))))..))(((((.(((((((.((((................((((.........)))).......((...(((((...)))))))(((.((((((...(((((....))))).....))).))).))).((((((.((((......))))...)).))))...............)))).))).)))).)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((,{{((((....{.((((((((((.(((.((.{......}.)).)))..)))))).(((((({....)),)})))........{.(((......)))})))).,....)))))))))).,.(((((((((......{{.....}}.,..))).))))))..))(((((.(((((((.((((....,..,{{{....,|||,.........}}||....,,.{,...{((({...})))}||(({.{(((((,,.(((((....))))).....))),,)).))}.(((({{.((((......))))...,,.))))...,,..........)))).)))}}))).)))))