Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EPS15_0023400
Sequence Length
528 nt
GC Content
0.4205
UUAUCAAGUGGGAAUCCUGUAUAUGAAAAAUACUAUAGACAGGUUGAUACAGGCAAUACUGGAAGGGUGUUGGCUUCUGAUGCUGCUGCUUUCCUGAAAAAAUCAGGGCUUCCAGACUUGAUACUUGGAAAGAUUUGGGAUUUAGCCGACACAGAUGGCAAAGGUAUCCUGAACAAACAAGAAUUCUUUGUUGCUUUGCGUCUUGUGGCAUGUGCCCAGAAUGGAUUGGAAGUUUCACUAAGUAGUUUGAACCUGGCUGUUCCUCCACCAAGAUUUCAUGAUACCAGUAGUCCUUUGCUAAUCAGUGGAACCUCUGCAGCUGAGCUCCCAUGGGCUGUAAAACCUGAAGAUAAGGCCAAAUAUGAUGCAAUAUUUGAUAGUUUAAGCCCAGUGAAUGGAUUUCUGUCUGGUGAUAAAGUGAAACCAGUGUUGCUCAACUCUAAGUUACCUGUGGAUAUCCUUGGAAGAGUUUGGGAGUUGAGUGAUAUUGACCAUGAUGGAAUGCUUGACAGAGAUGAGUUUGCAGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-139.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -150.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 143.34
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((.((((.(((((.((((........)))).))))).......((.(((((((.....))))))).))......((....))..((((((.....)))))).))))..))))))))............(((((((((((.(((.(((((((((((((..((.((......)).))..))))))))).)))).)))(((.(((....))))))........(((.((((((((...((((..((..((((.((((..................))))))))...))....))))...)))))))).)))...)))))).)))))((((((......(((.......))).(((((((......)))))))........))))))((((((..(((((((((.(((..((..(((....(((((((((((((((((((.((..((..((....))..))..)).))..)))))))))))))))))..)))..))....))).)))))))))..))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,,,,.((((((,.(((((.((((........)))).)))))......,((.(((((((.....))))))).))..,,,.((,{{{{{..{(((((.....)))))}.{(((({.........}}))}}.,.{{((((,,,,,(({,{({,((((((((((({..,..,{..,.,,{{{|...,}})))))}}))))})))|||}|||....,)))))}..,,,..{({,{{{{{({{...{{{{.,{{{,{{{(.{(,,...,}},,..|..,,,,.||}}}}||,{|,,..}})))},},})))))}}.)}}))})),,)),)))))|(((((.,{{,.(((.......))).(((((((......)))))))....}},,)))))}((((((..(((((((((.(((,.,...{{{....((((((((((((((((({(.((..((,.((....))..))..)).))..)))))))))))))))))..}}}..},...,))).)))))))))..)))))).,..
Back