Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EPS15_0023500
Sequence Length
653 nt
GC Content
0.4747
GGCCUCGCCUGCGGCCGCUCCCUCCGCCUCCUCCCCGCCCCGAGCCCCAGUCAGCCCGUCUUCCUUCCCCUCCCUUGCAUGAUGGAAACACCAUGGCUGCGGCGGCCCAGCUCUCUCUGACACAGUUAUCAAGUGGGAAUCCUGUAUAUGAAAAAUACUAUAGACAGGUUGAUACAGGCAAUACUGGAAGGGUGUUGGCUUCUGAUGCUGCUGCUUUCCUGAAAAAAUCAGGGCUUCCAGACUUGAUACUUGGAAAGAUUUGGGAUUUAGCCGACACAGAUGGCAAAGGUAUCCUGAACAAACAAGAAUUCUUUGUUGCUUUGCGUCUUGUGGCAUGUGCCCAGAAUGGAUUGGAAGUUUCACUAAGUAGUUUGAACCUGGCUGUUCCUCCACCAAGAUUUCAUGAUACCAGUAGUCCUUUGCUAAUCAGUGGAACCUCUGCAGCUGAGCUCCCAUGGGCUGUAAAACCUGAAGAUAAGGCCAAAUAUGAUGCAAUAUUUGAUAGUUUAAGCCCAGUGAAUGGAUUUCUGUCUGGUGAUAAAGUGAAACCAGUGUUGCUCAACUCUAAGUUACCUGUGGAUAUCCUUGGAAGAGUUUGGGAGUUGAGUGAUAUUGACCAUGAUGGAAUGCUUGACAGAGAUGAGUUUGCAGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-178.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -191.04
Frequency: 0.0000
Diversity: 160.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(.((((.((((((((((.....((.........))...))))..........(((((....................))))).........))))))))))).))((((...(((....(((.((((((((.((((.(((((.((((........)))).))))).......((.(((((((.....))))))).))......((....))..((((((.....)))))).))))..)))))))).)))...)))..(((((((((((.(((.(((((((((((((..((.((......)).))..))))))))).)))).)))(((.(((....))))))........(((.((((((((...((((..((..((((.((((..................))))))))...))....))))...)))))))).)))...)))))).)))))((((((......(((.......))).(((((((......)))))))........))))))((((((..(((((((((.(((..((..(((....(((((((((((((((((((.((..((..((....))..))..)).))..)))))))))))))))))..)))..))....))).)))))))))..))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(.((((.((((((((({.....(,.........},...)))}....,..,,,{{(({................,...))))).........))))))))))).))((((...(((..{.{((.((((((((.((({.(((((.((((........)))).))))).......((.(((((((.....))))))).))......((....))..{(((((.....)))))}.})))..)))))))),))),..)))..(((((((((((.{{(,({(((((((((((..(,{((....,,||{|,..,}))))))|,}}}).|||(((.(((....)))))}...|||,.{{|,{{{{{{{{..,{{||.{{{{,{{{(.{{,,...,}}}}}.}..,}}}.},}}}))).|,.}}}}))))},}},)))}},,.})},,.)))))).)))))((((((.,{{,.(((.......))).(((((((......)))))))....}),,))))))((((((..(((((((((.(((,.,...{{,....((((((((((((((((({(.((..((,.((....))..))..)).))..)))))))))))))))))..}}}..},...,))).)))))))))..))))))))))
Back