Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ERBB2IP_0002200
Sequence Length
1560 nt
GC Content
0.3532
CUGUGGUUUUCAUAUAUUCAGGUUAUAUUGUUUGCAUGAUCCUGAAGUCUUGAAGCACCUAAUAAUGGUGUUCUUGGAAUUUCACACCUUAGGUCACUCUAGACUCUUUGUGGGAGCAUGGAGGGAGGUCUGAUGGAGGGGGGGUGGGGAGAGGAGGGUAUGUUUGUAGUAGGACCAGUGCAAGAAACUAGUGAUCUAAAAAUGAAUCUUGUUGCCAAGGUUAUCACACAACCUAGAAUAAGUUGGUUUGACUUUCCUCUUCCUUAUAGAUUUUGGAAGUGAUUUAAGAGGCAUAUCCUUUGAGACUAGAAUAAAUCUCUCAGUCUUCUAGGAAAAGAUAAGGAUCUUGGCAGCAUCAAAUGGAUCCUUUGGGUGCCCUAUUAAUCCCUGGGGACUUCAGAAGAUUUAGUUUAUUGUCUUGAUGCUGACUGCAAAAUAGCAGGGACUGUAUAUAGUAGAUGCUUUUUGAUUUGUCGUGGAUACCUGGUAUCAACAGAGGGUCCUGUCUGCUCUUUUAAAAGCCAUUCCCAAGCCAGGGACCCUAGGAGUCAUCUUUAUUUUCCUGACCUUAGUAAUUGAAAUUUCUGUCGAUUCUGUCUUACAAAUGUCUACAGAGUGAGACACUUUAGGGUAGGAUAGGAAGGCUGGAUAAGGUGAAGGGCUUUUGAUAGGCAGAGGGUAAAAACAAUUACCUUAAUCUGUUUUUUCCCCAAUUAUAAAAAUAAUCUUGCUGUAAAAAUUCAAACAUAGAAAUAUAGAACAUAGAAGAUGAAAAUUCUCCACAAUUCCAUCUCCCAGAUAUACUCCGGUAUGUGUAGUUAAAAUUGAUAGCUAGCUAGAAUCAAAUUCCCUCUGAAGAGUGUGUAUCAAUUUGUACUUCCAUCAAUGGUAUAUAAAAUUACCUGUAUGCAUUUUUGACCAAAAUGGGUAUUGGUUGUCUUAUAAUACUUGUGGACAUCUGAGAGAGGCAAUAUAGUAUAGUAUGUAAGAACAUAAGUUUUGGAGUCAGAUUGCCUGGAUUUAAAUCCACGACUUACUAAUUAUGACAUUGAAAAAUUAAAUGUCAAUUCUUUUAGGUAUAGUACAUAUACAGUGUGCCUUUUGUGUUCUACAUGGUUUUUAUUGAUGUGUUGCUUAUCCUUAUGCAUUGGCUCUGGUGUUUGCCAUAUGGAUGCUUAAAUUUUAAUGUAAUCAAAUUUGUCAGUCUCUUUAUGCCUUUUGGUUUUAAUGUUAUUAUUGGAAAGUAUUUGCACCAAGAUUAUAAAAGUAAUAACCUAGCUUUUUAAAUUUUGGCUUAAGGAGUGAAAAAAUAAUCUAGCUUUAUGCUCCCCAAAUUUCUAACUAGUUGUAGUGCCGUUUGUUGAAUAAUCGUUUUACUUCUGAAAGUCUGCCUUUAUCAAUAGUAAAUCCCCAAAUAUGUUUAUACUAUGUCAGGAUUUUCUUUUUUUUAUUUGUUGUGUUUUUUAUGAUACUAUGCUAUUUUGACCUCUCUCCCCUUCAUUGUAUAUUUAAUAUCUGGAAGUGUUGCUUUGUUACUCUGCUUUUAAAUGAAUUUUCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-394.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -426.87
Frequency: 0.0000
Diversity: 368.54
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((..(((((.((..(((((.(((..((..((((..(((((((((((...((((((.......))))))...)).))))))(((....((((......))))....)))...((((((((((.....(((((((.(((((((((((.(.(((((((((((((((((((((((.(((.......))).))((((.......).))).(((((((((((((.........((((((..(((((.....)))))..(.(((((...........))))).).....(((((.....))))).((((((((.......))).)))))))))))..........)))))))))))))......((((((((((((((((......((((.(((.((..(((((((.....(((((((((....((((...((((......)))).....)))))))))))))..))))))).)).))).))))....))))))..))))))))))..(((((.((.(((((((((.(((((...((((....((((((((....))))....(((((.((((((.((((((........)))))).((((((((...((....))..))))))))..)))))))))))))))....))))....)).))).))))))))).)))))))(((.(((((((((((...)))).))))))).)))..(((((....))))))))))))........)))))))............(((.....)))...))))))).)..)))))))))))(.((((((....)))))).)(((..(((((((((.(..(((....(((.........)))..)))..))))))))))..))))))))))..((((........)))).((((.((((((.....)))))).)))).((.(((((.((((...))))))))).))(((((((((((.((((((((((((..((((((((((....(((((.((((((...(((((....)))))..((((.(((((.(((((((((((.........((((((.(....(((...(((((((((.(((((.(((...((((...)))).)))...)))))))))).))))...)))...).))))))..((((....))))...((((...(((((((..........)))))))...))))......(((....)))))))))))))).))))).)))).......((((((((..((((((.........))))))..))))))))....((((((((((.........(((.....)))...(((((.....((((....))))...)))))...........))))))))))...)))))).))))).....((.((((((....(((.((....)))))....)))))).))............))))))))))....)))))))))))).))).))))))))))))))).))).............))).)))).))..))).)).)))....)).)))))....))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((..(((((.,,.,(((((.(({..({..{{|{.,{||||||{(((.{,{(((((.......)))))),..)),.|||||{({...,((((......)))},,.,)))}}}{{((((((((.....(((((((,(((((((((((.,.((((((((((((((,({({({({{,,,{{{{{{.,|{{{.,{{{|,....,|{.,|.((((((((((((({{{.,.,,,(({{{,..,{{{{},,.,}}}}},,{.(((((..,.....,..))))).),.,,,(((((,,..,|||,,(((((((((.......))).)))))),,))),..,|||...,)))))}}|||||||{..,((((({(((((((,(({.....,,,,.|||}||},|||||,||||||,|,{,{,{{,|}}||||||.({{(.....,)))),.||,|,,..,)}),}))})))))))).}},)}},)))),,,}))))))..}}}}}))))),.(((((.((.(((((((((.(((((...((((.{{,{,,{{{{|,,.,|||,....{(({|{((((({.,{{{({........|}}}||,((((((((...((,,..}}..))))))))..}))))))))))})))},},))))....)).))).))))))))).)))))))(((.((((((({(({...}))}.))))))).)))..,{{{{....,,,,}}}}}}||,.....,,}}}}}}},...........,||.....}},...})))))).,..))))))))))){.((((((....)))))).}{((..(((((((({,(..(((....{{{.......,.))}..)))..))))))))))..))))))))))..((((,,,,....}|||.((((.((((((.....)))))).)))).||,{(((||||{,...}}))))))).},(((((((((((.(((((((((((({{((((((((((....(((((.((((((...(((((....))))).,((((.(((((.(((((((((((.........((((((.{....(((...(((((((((.(((((.(((...((((...,))).)))...))))))))))},)))...)))...).))))))..{(((....)))},,.(((,{{,(((((((..........)))))))..})),)},.,,.{((....)))))))))))))).))))).)))).......((((((((..((((((.........))))))..))))))))....((((((((((...,..,..(((.....))}...((({{.....{({{....}))},..}}}}),,},.,..,..))))))))))...)))))).)))))..,,.((.((((((....(((.((....)))))....)))))}.))............))))))))))}}}.)))))))))))).))).)))))))))))))))},)}...........,,}||,}}}}.}}..}}}.}}.}})....}}.)))))....))).
Back