Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ERBB2IP_0009300
Sequence Length
1611 nt
GC Content
0.3737
UGUCUAAAAAUGACUACAAAACGAAGUUUGUUUGUGCGGUUGGUACCAUGUCGCUGUCUACGAGGGGAAGAGGAGACUGUCACUACUCUUGAUUAUUCUCAUUGCAGCUUAGAACAAGUUCCGAAAGAGAUUUUUACUUUUGAAAAAACCUUGGAGGAACUCUAUUUAGAUGCUAAUCAGAUUGAAGAGCUUCCAAAGCAACUUUUUAACUGUCAGUCUUUACACAAACUGAGUUUGCCAGACAAUGAUUUAACAACGUUACCAGCAUCCAUUGCAAACCUUAUUAAUCUCAGGGAACUGGAUGUCAGCAAGAAUGGAAUACAGGAGUUUCCAGAAAAUAUAAAAAAUUGUAAAGUUUUGACAAUUGUGGAGGCCAGUGUAAACCCUAUUUCCAAGCUCCCUGAUGGAUUUUCUCAGCUGUUAAACCUAACCCAGUUGUAUCUGAAUGAUGCUUUUCUUGAGUUCUUGCCAGCAAAUUUUGGCAGAUUAACUAAACUCCAAAUAUUAGAGCUUAGAGAAAACCAGUUAAAAAUGUUGCCUAAAACUAUGAAUAGACUGACCCAGCUGGAAAGACUGGAUUUGGGAAGUAACGAAUUCACGGAAGUGCCUGAAGUACUUGAGCAACUAAGUGGAUUGAAAGAGUUUUGGAUGGAUGCUAAUAGACUGACUUUUAUUCCAGGGUUUAUUGGUAGUUUGAAACAGCUCACAUAUUUGGAUGUUUCUAAAAAUAAUAUUGAAAUGGUUGAAGAAGGAAUUUCAACAUGUGAAAACCUUCAAGACCUCCUAUUAUCAAGCAAUUCACUUCAGCAGCUUCCUGAGACUAUUGGUUCGUUGAAGAAUAUAACAACGCUUAAAAUAGAUGAAAACCAGUUAAUGUAUCUGCCAGACUCUAUAGGAGGGUUAAUAUCAGUAGAAGAACUGGAUUGUAGUUUCAAUGAAGUUGAAGCUUUGCCUUCAUCUAUUGGGCAGCUUACUAACUUAAGAACUUUUGCUGCUGAUCAUAAUUACUUACAGCAGUUGCCCCCAGAGAUUGGAAGCUGGAAAAAUAUAACUGUGCUGUUUCUCCAUUCCAAUAAACUUGAGACACUUCCAGAGGAAAUGGGUGAUAUGCAAAAAUUAAAAGUCAUUAAUUUAAGUGAUAAUAGAUUAAAGAAUUUACCCUUUAGCUUUACAAAGCUACAGCAAUUGACAGCUAUGUGGCUCUCAGAUAAUCAGUCCAAACCCCUGAUACCUCUUCAAAAAGAAACUGAUUCAGAGACCCAGAAAAUGGUGCUUACCAACUACAUGUUCCCUCAACAGCCAAGGACUGAGGAUGUUAUGUUUAUAUCAGAUAAUGAAAGUUUUAACCCUUCAUUGUGGGAGGAACAGAGGAAACAGCGGGCUCAAGUUGCAUUUGAAUGUGAUGAAGACAAAGAUGAAAGGGAGGCACCUCCCAGGGAGGGAAAUUUAAAAAGAUAUCCAACACCAUACCCAGAUGAGCUUAAGAAUAUGGUCAAAACUGUUCAAACCAUUGUACAUAGAUUAAAAGAUGAAGAGACCAAUGAAGACUCAGGAAGAGAUUUGAAACCACAUGAAGAUCAACAAGAUAUAAAUAAAGAUGUGGGUGUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-374.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -406.60
Frequency: 0.0000
Diversity: 372.02
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((......((((.(.....).)))).(((((.((((((...(((((((((((((((....(((....((....)).(((((..((((.(((((..(((.((((((((.((...((((((....(((.(((((.(....).))))).)))...)))))).......(((....))).((((((((((((..((.(((.......(((..((((((((.....(((((...)))))...(((..((......))..)))...((((((((((..(((((((.(((((((((((((.(((((.((.((.......((..((((...(((((((.((.......((((((....)))))).....)).)))))))...))))..)))))).))).)).))))))).....((((.((((((...(((........)))(((((.....)))))((((((((((((((((((((......))))))......................)))))))).)))))).(((((....(((((......))).)).....)))))...))))))))))...((((((((........))))))))...((((((.....)))))).............))))))))).))))..))))))))))...))))))))..))).((..(((((((((((......((((((((.((...((((.((((((.........)))))).))))((((...(((((..(((((.....))))).)))))..))))..........................((((((((.....((.((((..(((((..........))))).....((((((((((..((((((..(.((.(((...((((((.....)))))).....))))).)..)))))).....(((((((((...))))))))).....))))))))))(((((.((((......)))).......(((((((..............))))))))))))))))))...))))))))............)).))))))))......)))))))))))..))...((((...))))..((((((........((((....((((((......))))))....)))).......))))))..((((((....))))))............))).)).)))))).......))))))....((((((...(((((.......(((.....))).(((..(((.....)))..)))...........(((((((((.(((..((((..(((((...((((..((......))..))))...)))))..))))..))))))).))))))))))...))).))).))))))))))..)))..))))).))))...)).)))..(((((....))))).(((..(((.((((....)))).)))..).))...))))))).)))....).)))))))...)))))).)))))(((((.......(((....)))........)))))...........))).)(((.(..((((((.........................))))))...).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,(({......|||,,{...,,..,|||,(((((.((((((.,.(((((((((((((((....(((,.,.((....}}.||.|,..((((.(((((..(((.((((((((,(,...{(((((..{{({(.{((((.|...,).)))}},)))...)))))|,,.,{{.(({.,..)}}}|||{||||||{|},|,,{{{..,,,,.{{{..((((((((.....(((((...}))))...,....{{..........}}}...((((((((((..(((((((.(((((((((((((.(((((.,{.,,.......((..((((...(((((((.({.......((((((....)))))).....)).)))))))...))))..)))}}}.)))},).))))))}.,,.{((((.((((((...,,,........}}}(((((.....))))){(((((((((((((((((({......})))))......................))))))))))))))}.(((((....{,(((......))).,}.....)))))...))))))))))}.}|(((((((........)))))))}.,.((((({.....}}}}}}..,,......,,}))))))))).))))..))))))))))...))))))))..}},.|{,,{||{(((((((.,....((((((((.((.,{{((((((.,,.}}}}},...,,,,.|{{|.|((((,..(((((..(((((.....))))).)))))..})}}...,,,,.},},.,,.,,,,.,{,..((((((((.,,..((.((((..(((((..........))))).....((((((((((..((((((..(.((.(((...((((((.....)))))).....))))).)..))))))...,.(((((((((...)))))))))..,,.))))))))))(((((,(({{......}})).......(((((((............,.)))))))))))))))})).},)))))))),,.....,....)).))))))))...,,.))))))))))),,)}...{(((...)))}..((((((..,.....((((....((((((......))))))..,.))))...,...))))))..{(((({....}))))}.,,,....,...))}.}},))))})},|,,..}}}))}....((((((...(((({{{.....}},.,{|..,}.{{{..{||.....|||,.}},.,,.......{((((((((,,(((..((((..(((((...((((,,((.....,)),.))))...)))))..))))..))))))).))))))))))...))).))),)}))))))))..)))..))))).))))...,,.},...(((((....))))).(({..(((.((((....)))).)))..}.))...))))))).)))....),,)))))),..)))))).)))))(((((.......{{{....}}).....,..})))}....,||,...})).}{{{.,..((((((....,{,.....,,,..........)))))).,.}.}})
Back