Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ERBB2IP_0018200
Sequence Length
1327 nt
GC Content
0.3564
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-259.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -288.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 292.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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