Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ERBB2IP_0022700
Sequence Length
1612 nt
GC Content
0.3902
UAGUCAAGACACCUCACUCUGCUCUCCAGUGAAACAAACUCAUAUUGAUAUUAAUUCCAAAAUCAGGCAAGAAGAUGAAAAUUUUAACAGCCUUUUACAAAAUGGAGAUAUUUUAAACAGUUCAACAGAGGAAAAGUUCAAAGCUCAUGAUAAAAAAGAUUUUAACUUACCUGAAUAUGAUUUGAAUGUUGAAGAGCGAUUAGUUCUAAUUGAGAAAAGUGUUGACUCAACAGCCACAGCUGAUGACACUCACAAAUUAGAUCAUAUCAAUAUGAAUCUUAAUAAACUUAUAACUAAUGAUACAUUUCAACCAGAGAUCAUGGAAAGAUCAAAAACACAGGAUAUUGUGCUUGGAACAAGCUUUUUAAGCAUUAAUUCUAAAGAGGAAACUGAGCACUUGGAAAAUGGAAACAAGUAUCCUAAUUUGGAAUCCGUAAAUAAGGUAAAUGGACAUUCUGAGGAAACUUCCCAGUCUCCUAAUAGGACUGAACCACAUGACAGUGAUUGUUCUGUUGACUUAGGUAUUUCCAAAAGCACUGAAGAUCUCUCCCCUCAGAAAAGUGGUCCAGUUGGAUCUGUUGUGAAAUCUCAUAGCAUAACUAAUAUGGAGAUUGGAGGGCUAAAAAUCUAUGAUAUUCUUAGUGAUAAUGGACCUCAGCAGCCAAGUACAACCGUUAAAAUCACAUCUGCUGUUGAUGGAAAAAAUAUAGUCAGGAGCAAGUCUGCCACACUGUUGUAUGAUCAACCAUUGCAGGUAUUUACUGGUUCUUCCUCAUCUUCUGAUUUAAUAUCAGGAACAAAGGCAAUUUUCAAGUUUGAUUCAAAUCAUAAUCCCGAAGAGCCAAAUAUAAUAAGAGGCCCCACAAGUGGCCCACAAUCUGCACCUCAAAUAUAUGGUCCUCCACAGUAUAAUAUCCAAUACAGUAGCAGUGCUGCAGUCAAAGACACUUUGUGGCACUCCAAACAAAAUCCCCAAAUAGACCAUGCCAGUUUUCCUCCUCAGCUCCUUCCUAGAUCAGAGAGCACAGAAAAUCAAAGUUAUGCUAAACAUUCUGCCAAUAUGAAUUUCUCUAAUCAUAACAAUGUUCGAGCUAAUACUGCAUACCAUUUACAUCAGAGACUUGGCCCAGCAAGACAUGGGGAAAUGUGGGCCAUCUCACCAAACGACCGACUUAUUCCUGCAGUAACUCGAAGUACAAUCCAGCGACAAAGUAGUGUGUCCUCCACAGCCUCUGUAAAUCUUGGUGAUCCAGGCUCUACAAGGCGGGCUCAGAUUCCUGAAGGAGAUUAUUUAUCAUACAGAGAGUUCCACUCAGCGGGAAGAACUCCUCCAAUGAUGCCAGGAUCACAGAGACCCCUUUCUGCACGAACAUACAGCAUAGAUGGUCCAAAUGCAUCAAGACCUCAGAGUGCUCGACCCUCUAUUAAUGAAAUACCAGAGAGAACUAUGUCAGUUAGUGAUUUCAAUUAUUCACGGACUAGUCCUUCAAAAAGACCAAAUGCAAGGGUUGGUUCUGAGCAUUCUUUAUUAGAUCCUCCAGGAAAAAGUAAAGUUCCUCGUGACUGGAGAGAACAAGUACUUCGACAUAUUGAAGCCAAAAAGUUAGAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-359.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -392.93
Frequency: 0.0000
Diversity: 494.02
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((..((....)).)))((.(((((((((.(....((((......((((((...((((.....((((...(((((....)))))....)))).........))))))))))......)))).....(((((((((((.((((.((...........))))))))))).((((..((((((((....(((((((.(..(((((((.(((((((((...(((((((.(((.((((....)))).)))...((........)).....)))))))...))))))).....)).)))))))....).)))))))...))))))))...............)))).....(((((((((((.(((((((...(((((...(((..(((((....(((((((((.((..(((((..(((((......)))))...))))).......(((..(((((..((((((((..((((((((((((((..(((((((((.((.((((((..((((((((((.((((.(((((..............((((.(........).))))......(((((....)))))((((((((....))))))))..........((((...(((((((((.........((((((..((.((.....(((((.(((((((..........................)))))))((((.....((((((.(((..(((....)))....)))))))))......))))(((((((......(((((((((......(((((((.....)))))))....................((((....)))).......)))))))))............((((........))))....)))))))............)))))....)).)).))))))........))))((((((((((((...)))....)))))))))...................................)))))....))))..))))).))))))))))......))))..))))))....((((.((((...(((((..........)))))......((((((....(((((((..............((((..((((((......((((......))))))))))))))...........((.....)).))))))).))))))..................)))).))))........((((.((((...(((((....)))))...)))))))).)).))))..))))).))))))))..............((((...))))...))))))...)))))...((((......))))((((((....))))))................)))..)))))..))).........)).)))))))))..))))).................(((.((((.(((.((.((((((....)))))).)).))))))).))).....)))...)))))))))))).))))))))))).(((((((...(((....)))...))))))))))))).).)))))))))........((((((....))))))...............))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,{{...{,....,.,{{,{.(((((((((......,{{(,,,,,,((((({...((((.....((((...(((((....)))))....))))..,......)))))}))}}......}}}|,,.,.(((({{{((((.{{{,{{,.{........,},})},}}))}.,{|...{{{({{{{,..,(((({((,(,.{{{{{|{,{{{{({{{,...((({{{,.(((.((((....)))).))),,,|},,...,,,}}|||||}}}})))}}.}}}}}},.....}}.,}}}}}},,..,.}})))}}...}||||}}}...,),,,.......,{(((....((((((((((,..,,,||}}}})}||,.,,}}|..,(((({{{(((,((((((({...,{({{..||||{.,,,..}}}}),,.|||||......,,,..,||||,.{(((((((,..,,{{,(((((({{{..,,||||||,.{{,(,,{{(,|||,{{,|||||||{,{{{,((,....}}..,,,,}||||,|,,......}}))))},..,{{{((|,,{{{{.,.((((((((....))))))))...}}},,.||||{{{{(((((((({....{{{{{,,,,,{..,,,,},,.}}}}}({((((((((..,{,....................,)))))))),||.....((((((.(((,.(((....}))....)))}}))}}......}},,{((((((......(((((((((......(((((((.....)))))))....,{,..........,||{({{....})},.......)))))))))..........{.((((.,....}.)))),...))))))}...........}))))))))},.{{{{........)))}.|}.{.(((((((((({{...},,...,))))))))).,........,,.}}}....},}}})))))))}}}))))....{((({{{{...,,,,}}.)))),|||||,,,,,.,||},,}},.....|}|}}....{{(({.{,.....,,))))}..,,{{((((((,,,,({(((((..............((((..(((((({.,....(,,......,))))))))))))).......,...{{,,...||,|}}}))},}}}}||{{.,.....,{,{{{{.,||..{{||,,...}}}.((((.((((.,.(((((....))))).,.))))))))||||||,|,,|||||.}}}}},,,...,|{{{,...{,((((((..{{|...))),.))))))))}..,|||||{,,|||||,{{|||,,,,,||||||......,.......,,,{{,||||}....||||},.....,}.}}})))}|)}})|)))}}...}|......}}|||||.|{{{.|||.||,{((((|,...,))))),)),))}})))|||||....,,,...,}))}})))))))))))})))))),(((((({...(((....)))...}))))))}))))},),))))))))).....,,.((((({....}))))).......,,,.,...,}
Back