Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ERBB2IP_0023400

Sequence Length

2002 nt

GC Content

0.4001

AUUGGAGGGCUAAAAAUCUAUGAUAUUCUUAGUGAUAAUGGACCUCAGCAGCCAAGUACAACCGUUAAAAUCACAUCUGCUGUUGAUGGAAAAAAUAUAGUCAGGAGCAAGUCUGCCACACUGUUGUAUGAUCAACCAUUGCAGGUAUUUACUGGUUCUUCCUCAUCUUCUGAUUUAAUAUCAGGAACAAAGGCAAUUUUCAAGUUUGAUUCAAAUCAUAAUCCCGAAGAGCCAAAUAUAAUAAGAGGCCCCACAAGUGGCCCACAAUCUGCACCUCAAAUAUAUGGUCCUCCACAGUAUAAUAUCCAAUACAGUAGCAGUGCUGCAGUCAAAGACACUUUGUGGCACUCCAAACAAAAUCCCCAAAUAGACCAUGCCAGUUUUCCUCCUCAGCUCCUUCCUAGAUCAGAGAGCACAGAAAAUCAAAGUUAUGCUAAACAUUCUGCCAAUAUGAAUUUCUCUAAUCAUAACAAUGUUCGAGCUAAUACUGCAUACCAUUUACAUCAGAGACUUGGCCCAGCAAGACAUGGGGAAAUGUGGGCCAUCUCACCAAACGACCGACUUAUUCCUGCAGUAACUCGAAGUACAAUCCAGCGACAAAGUAGUGUGUCCUCCACAGCCUCUGUAAAUCUUGGUGAUCCAGGCUCUACAAGGCGGGCUCAGAUUCCUGAAGGAGAUUAUUUAUCAUACAGAGAGUUCCACUCAGCGGGAAGAACUCCUCCAAUGAUGCCAGGAUCACAGAGACCCCUUUCUGCACGAACAUACAGCAUAGAUGGUCCAAAUGCAUCAAGACCUCAGAGUGCUCGACCCUCUAUUAAUGAAAUACCAGAGAGAACUAUGUCAGUUAGUGAUUUCAAUUAUUCACGGACUAGUCCUUCAAAAAGACCAAAUGCAAGGGUUGGUUCUGAGCAUUCUUUAUUAGAUCCUCCAGGAAAAAGUAAAGUUCCUCGUGACUGGAGAGAACAAGUACUUCGACAUAUUGAAGCCAAAAAGUUAGAAAAGAUGCCUUUGAGUAAUGGACAGAUGGGCCAGCCUCUCAGGCCUCAGGCAAAUUAUAGUCAAAUACAUCACCCCCCUCAGGCAUCUGUGGCAAGGCAUCCCUCUAGAGAACAACUAAUUGAUUACUUGAUGCUGAAAGUGGCCCACCAGCCUCCAUAUACACAGCCCCAUUGUUCUCCUAGACAAGGCCAUGAACUGGCAAAACAAGAGAUUCGAGUGAGGGUUGAAAAGGAUCCAGAACUUGGAUUUAGCAUAUCAGGUGGUGUCGGGGGUAGAGGAAACCCAUUCAGACCUGAUGAUGAUGGUAUAUUUGUAACAAGGGUACAACCUGAAGGACCAGCAUCAAAAUUACUGCAGCCAGGUGAUAAAAUUAUUCAGGCUAAUGGCUACAGUUUUAUAAAUAUUGAACAUGGACAAGCAGUGUCCUUGCUAAAAACUUUCCAGAAUACAGUUGAACUCAUCAUUGUACGAGAAGUUUCCUCAUAAGCACUGUGGACAAAAAAAGCGGGGAAGACAGCAAGAUUUAUUGGAAGAUACUUACAGGGGAAAUUAAUAUUUUGACUAUUUUUAUAUAUAAAGAAGAACUCAAAAAAUUAUGUUCAAAUUUGUACAUUAAUGAAAUAAUGGAACUUGUGGUUAGAGGGAAAGAACCACUGUACAGAAUAUAAAGGAGACUGUUGAAUUCAUACCAUAUAAAACUUGUUAGGUUUUUAAACAUAGCAAUCAAGGCUACAAAAACAAACCUGUGUUGUUUUUGUAUAGAUUGUAGGUUUAUUUUUGGAUUUCAUAUACAUGACUGAACUGUGUGCAAGGCAAUAGUUAGCCUUGAUUUUAGCCCAGAGACAGAUGGCAGAGCUAUCUCUCUCAUAGCUUUUAUGCCCUUAUUUUUAUUCAACUGGUAUUAAUGUUUUUCUCCUGAAACUACUUUUUUUGAUGUGGGCAAGAGAUUUGAAGUGUUGGCUUUUGCUAUGUGCAUAUUGAAUUGAAGAGUGAGUAGGUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-484.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -525.15

Frequency: 0.0000

Diversity: 475.82

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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