Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ESR1_0000900

Sequence Length

2176 nt

GC Content

0.3810

GUCAAGCCUAUGCAGCAAGAAGCCAAGUUGAGAAUUGAGCAAUUAUCUGAAGUGGGCAGUGGAGACGGCCAAACCAGAUAAUAUAUAACCAGAAAGUCACCGUGGAGGGAAAAUGUGGACUGAAAAUAGGAUAAGGGGUGGAGGUAGAAUGUCAAGCCAUUUGGUCAGUGUCCACAGUCCAAAUUUACUGAAUAACAGCCAAUUCCUUACUUCAUGUGGUUAUUUAGAGCGAGACUAGAGGACAAGUGAAAAAAAAAAAAAAGAGUUCAUUCCUAAGGUUGUUGCAUGUUUGUGCAAAAUUUCUUCAAAUCUCUGUUAUUAUCUGUUACAUGUCUAAUUCUGAGUACUUCCAGAGAUUGCAUUUCAUUACUUUAGAUUAGUGGGUUGAAGUGGUGGAGGAAGCCCAUAUAAUCUGACUUACAUGGAGAAAACAAGUCUUUUUUUAUAGUUUAGUUGAGUGUUAUAUUUAAUUAGCCUUUUUUUCCCUCCAUAAUGCAUGCUUAUGAAUUUUCCACUUAAAAUUCUGAGGCUCUGACCUUUAUCAUUUCCUCAUGGAGCAAUUUCUGUACCUCCUUAACUUUAGUAGAACAUAGCAAUGAAAUAUACAAGUCCCCUAGAAUAGAAUUUGUGUGAAUUUGGUUUUCUAAAAACACAACUACCAAAGUCUGAGGACCAGUGUGGUAUUUUUUUCUUCUAUUUGAUAUGGAAACCAUAAACUACUUACUUUGAGCAGAUGUUUCCCAGUCCUAAAAUACAGCUAUCAGUCCACUGGCCCCUAUAAAUCUGUUGGAGUGCACCUGCUAAUUCUGAAGCCUCCCUAAUACAAUGUUAAACUUUCCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGAAAAAAAUUGUAAAUUAGGUUCACUGUUGCUUGGAAUUAGGAAAAAAUAAAAACACAGGCAUACUAAUAUUUCAGAUGGAAAAACAAAGUUAAGAAUUCAACAAGUUUUUUUCCCCCACUCUAUCAUGUCUUGCACAUUUAAAGCUGUUAUACAACAUUUUAAAAACAAACCAAAAAAACCCAGGGCCUUUUUCCAACAGCUUAGGCUGAUGACCCACAGUAAAAAAGUGCCCCAUGGGAUAUUCUUAAAGCACCCCAAGGGAGUCUAUUGAAAUAACUUAAAGUAAAAAUUCAGAAGAAUUUUACAUGUAAUUAAAAAUUAAGAACGUUGUUUUAUAAGCAAUAGGGAAAAGCUGUAUUAAGUUGCAUUGCUCAAUUUCUCACUUGCUCUGUGCAGUGACUGCUUUUUCAACCAUGUAACAACGUCUGAAUCUUCGUGGUAAAAUCAUACCUAUCACAGCCACAGCAGGUUUUGUUCUGCUGCUGCACAUGUGAUUUGAGAUACUGUGGGCUGGGAGUUUUUUUUUUUUUAAUUUCUAAUGGCAAAAUGGAUCUAUAGAAAUGGAAGUCAUCUGUAAUCUCAGCACUUUGAGAGGCUGAGGUGGGUGGAUCACCGGAGGUCAGGAAUUGGAGACCAGCCCAGCCAACAUGGUGAAACCCAUCUCUACUAAAAAGAUAAAAAAUUAGCUGGCGGGCGUGGUGGUGUGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCAGAAGAAAUGCUUGAACCCAGGAGGUGGAGGUUGCAGUGAGCCGAGACCGCACCGUUGCACUCCAAUCUGGGUGGCAAGAGCGACACUACAUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAAUGGAAGUCAUCCCGUGGGCCUGAGUUGGUGUAGUGGAUUAUGGCCUGUGCGUGAAUGAAGAAAUACUUGCCAAUGGCAUCAGUGGUAACUAGCUUAAGCCCUACUCAGCUUUGUAAAAUAAUGUAAUCAAGGAAUUUGAUCUGAACAGGUAAGCCAAACAUUGAUUCUUCAGUGCCUAUUGAUAAGUGAGACUACUUUUCUUUUUAACAGCCUUAUUUCACUUAAGUGGGGAGUCAAACUAGCUUUAAUUAAGGAAAUCUGUAGAAAUCACCCACAUCUCCCUUUCCUUCUCUGUUAAAAAAACAAAAGGAAGAAGAAAACUAGGAAGGAGUAAGCACAAAGAUCUCUUCACAUUCUCCGGGACUGCGGUACCAAAUAUCAGCACAGCACUUCUUGAAAAAGGAUGUAGAUUUUAAUCUGAACUUUGAACCAUCACUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-526.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -573.48

Frequency: 0.0000

Diversity: 612.93

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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