Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ESR1_0001500
Sequence Length
633 nt
GC Content
0.3918
GAGAAUCGCUUGAACCCAGGAGGCAGAGGGUGCAGUGAGCCGAGACUGCGCCACUGCACUUCAGCCUGGGGAACAAGAGCGAAACUCUGUCUCAAAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAAAUAAAAAAUUAAAAUGUACAAUAGAGUGUGUAAAACCAGGAAAUCUACAUCUUGACACUUAACUACCCAAGACGCAAUUGGUUCCUCGUCUGAUUUUUAAAAGAAGUUUCCACUUUCUUCGGAAAAUCACGACAGUCCUUGUUCUCAAUUUCUUUGUUUUUAAGAAGAGAAAUGUUGUAUGAUUUCACUUAUAUAAACUACCUAGAAUAGGCAAAUUCACAGGGAUAGAAAGGUGGAAUGGAGGUGACCAAAGGUGGAAAGGAAGGAGGAUUGUUCAAUGGGUACAACAUUUCUGUUUGGGAUGAUGAAGAAUUUCUGGAGAUGGACAAUGGUGAUGGCUGCACAACACUGGGAAUGUGCUUAAUGCCAUUACUUAAAAAUGGCUAAAAAUCAUGCAUUUUAUGUUAUGUAUAUUUACAACUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGUGUCUUGCUCUGUCAUCCAGGCUGGAUGGCGGUGGCAUGAUCUCGGCUCAUUGCAACCUCCACCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-204.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -217.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 154.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.............)(..(((((..((((.(((((((((((((((.((.((((((((..(((((((((((..(((.((((((.((.((((((((((((.................(((((.(((((....((((((((((((((((((((.....(((((........)))))............((((.......))))......(((((((((((..(((((((....)).)))))..)))))))).))).((((.(.(((..((.(((((((((.((..(((.(((((((((((((....((((((.(((...((((((...........................)))))).))).))))))(((....)))....(((.((...)).))).....))))))))))))).)))..)).))))))))).))..))).).))))...(((((((((.(((((..........))))).....)))))))))..................)))))))))))....))))))))).....))))).))))))))))))))))).)).)))))))))..)))))))))))..)))))))).)).))))))))))))))).))))..)))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..........,..){..(((((..((((.(((((((((((((((.,{.((((((((..(((((((((((..((,{((((((.((.((((((((((((.................{{(((.(((({,.,.(((((((((((((((((({{....,((((({.{{,.{,|||||,,,......,,,(({{,,,{...||||,,,,,,(((((((((((..(((((({....})})))))..)))))))).))).((((,(.(((..,{.(((((({{{.,,..{{|,|||{{{{((((((,{,,{{{{{|.|||,..{{{(((.,,,{......,}||..,}},.}....}})))).}},,}}}}}}|||...}))}....|||.{{,,.}}.)))..,,,)))}}}}}}}}}).))),.}}.))))})))},)),,))}.}.}}}}...(((((((((.(((((..........))))).....))))))))).....,,,.,........}))))))))))....))))))))).....)))))}})))})))))))))))).)).)))))))))..)))))))))))..)))))))).}}.))))))))))))))).))))..)))))..)
Back