Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ESR1_0001800

Sequence Length

522 nt

GC Content

0.6897

GUGGCCCGCCGGUUUCUGAGCCUUCUGCCCUGCGGGGACACGGUCUGCACCCUGCCCGCGGCCACGGACCAUGACCAUGACCCUCCACACCAAAGCAUCUGGGAUGGCCCUACUGCAUCAGAUCCAAGGGAACGAGCUGGAGCCCCUGAACCGUCCGCAGCUCAAGAUCCCCCUGGAGCGGCCCCUGGGCGAGGUGUACCUGGACAGCAGCAAGCCCGCCGUGUACAACUACCCCGAGGGCGCCGCCUACGAGUUCAACGCCGCGGCCGCCGCCAACGCGCAGGUCUACGGUCAGACCGGCCUCCCCUACGGCCCCGGGUCUGAGGCUGCGGCGUUCGGCUCCAACGGCCUGGGGGGUUUCCCCCCACUCAACAGCGUGUCUCCGAGCCCGCUGAUGCUACUGCACCCGCCGCCGCAGCUGUCGCCUUUCCUGCAGCCCCACGGCCAGCAGGUGCCCUACUACCUGGAGAACGAGCCCAGCGGCUACACGGUGCGCGAGGCCGGCCCGCCGGCAUUCUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-215.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -224.83

Frequency: 0.0000

Diversity: 87.60

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((..(((((((((((((......(((((.((((((((((((.((((((.((((((.((((.(((.((((..(((.((..((.........))..))))).)))).))..(((...))).((((.((((..(((((((.((.........)).).))))))....))))..))))).))))..)))))).)))))).(((.....))).......))))))).......))))))))))((((.....(((((.(((((((((((((((((......)).)))......(((((((((((........))))...))))))))))))))))))).)))))...)))).(((((((...))))))))))).((.(((((.....((((.((((..(((...(((((.((.((((..(((((.(......).)))))....))))..)).)))))((........))......))).))))))))))))).))...)))))))))..)))).(........)

Thermodynamic Ensemble Prediction

,((({..((((((((({({(......(((((.((((((((((((.((((((.((((((.((((.{((.{(((..{{|,|{..|,.........,|..}}})),})))})}..,||,..}}}.((((.((((.,((((((,.(,.........},},.))))))..,.))))..))))}.)))).,}))))).)))))).,{(,....|}}...,,,.))))))).......))))))))))((((.....(((((.(((((((((((((((({...,..,,.,))...}}}|((((((((((........))))...))))))})))))))))))).)))))...)))).(((((((...)))))))}}},.{{,(((((....,(({{{((((..(((...(((((.((.((((..(((((.(......}.)))))....))))..)).)))))((........))......))).)))))))),,,))}))}}}))))))))),,))|}.{........)