Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ESR1_0001900
Sequence Length
830 nt
GC Content
0.6181
GUGGCCCGCCGGUUUCUGAGCCUUCUGCCCUGCGGGGACACGGUCUGCACCCUGCCCGCGGCCACGGACCAUGACCAUGACCCUCCACACCAAAGCAUCUGGGAUGGCCCUACUGCAUCAGAUCCAAGGGAACGAGCUGGAGCCCCUGAACCGUCCGCAGCUCAAGAUCCCCCUGGAGCGGCCCCUGGGCGAGGUGUACCUGGACAGCAGCAAGCCCGCCGUGUACAACUACCCCGAGGGCGCCGCCUACGAGUUCAACGCCGCGGCCGCCGCCAACGCGCAGGUCUACGGUCAGACCGGCCUCCCCUACGGCCCCGGGUCUGAGGCUGCGGCGUUCGGCUCCAACGGCCUGGGGGGUUUCCCCCCACUCAACAGCGUGUCUCCGAGCCCGCUGAUGCUACUGCACCCGCCGCCGCAGCUGUCGCCUUUCCUGCAGCCCCACGGCCAGCAGGUGCCCUACUACCUGGAGAACGAGCCCAGCGGCUACACGGUGCGCGAGGCCGGCCCGCCGGCAUUCUACAGGCCAAAUUCAGAUAAUCGACGCCAGGGUGGCAGAGAAAGAUUGGCCAGUACCAAUGACAAGGGAAGUAUGGCUAUGGAAUCUGCCAAGGAGACUCGCUACUGUGCAGUGUGCAAUGACUAUGCUUCAGGCUACCAUUAUGGAGUCUGGUCCUGUGAGGGCUGCAAGGCCUUCUUCAAGAGAAGUAUUCAAGGACAUAACGACUAUAUGUGUCCAGCCACCAACCAGUGCACCAUUGAUAAAAACAGGAGGAAGAGCUGCCAGGCCUGCCGGCUCCGUAAAUGCUACGAAGUGGGAAUGAUGAAAGGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-314.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -329.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 235.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.((.(((...((((((...(((((....))).)).)).)).))....))).))))))))..(((.....(((..(((((((..(((.......)))..)))((((.(((...))).....))))...(((((((....((((........(((((((....(((.((((..((((((((((((..((.(((((.(((...((.....))...))).))))).))..))).)))).)))))....(((((.(((((((((((((((((......)).)))......(((((((((((........))))...))))))))))))))))))).)))))....(((.(((((((...))))))).....(((((.((......)).)))))..((..((((..........))))..)).((((....(((((((((((((.(..((((((......))))))..)....((((....))))..((((((.((((((((((....)))))........(((..................)))....(((((((.......((((((...((........))......)))))).....)))))))......)))))))))))(((..((......))..))).(((((((.(((...))))))))))..))))).))))))))))))((((((...)))))).......(((((((.........))))))).)))......(((((...))))).......)))).))).)))))))))))....)))))))((((.....)))).)).))..)))......))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({({((.(((...{({(({...{((((.,,{|||.||.||{||.}},,.,})),)))))}}}||.{|,,.,,{{||,{{{{(({..{{...{,,..,||{.,}}|}},.,||}..,,,.{(({.{||{.,(((((((.{..,,,,....,...,||||||....|||}{,||},((((((((((((.{{(.(((((.(((...((.....))...))).))))}.)).}))).)))).)))))....(((({.{((((((((((({((({,..,..||.|}}...,}}{((((((((((........))))...))))))})))))))))))}.}))))....|||,{((((((...))))))}.....(((((.({....,,||.}||}}.{((....))}...|||}},||||||,,.((((,...(((((((((((((,(..((((((......))))))..,....((((....)))).|((((((.((((((((((....)))))..,{{...(((.....,............))).,,,{((((((.......((((((.,.((........})....,.)))))).....))))))}......)))))))))))|{(..((......})..))).{((((((.(({...}))))))))}..))))).))))))))))))((((((...}))))).......(((((((.........))))))).|,,......({(({...}}))).......}})),))}.}))))))}}))}},,)}))))}{{{{....,)}}).})))))..,,.,....))),
Back