Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ESR1_0007100
Sequence Length
373 nt
GC Content
0.5737
GAGUGUACACAUUUCUGUCCAGCACCCUGAAGUCUCUGGAAGAGAAGGACCAUAUCCACCGAGUCCUGGACAAGAUCACAGACACUUUGAUCCACCUGAUGGCCAAGGCAGGCCUGACCCUGCAGCAGCAGCACCAGCGGCUGGCCCAGCUCCUCCUCAUCCUCUCCCACAUCAGGCACAUGAGUAACAAAGGCAUGGAGCAUCUGUACAGCAUGAAGUGCAAGAACGUGGUGCCCCUCUAUGACCUGCUGCUGGAGAUGCUGGACGCCCACCGCCUACAUGCGCCCACUAGCCGUGGAGGGGCAUCCGUGGAGGAGACGGACCAAAGCCACUUGGCCACUGCGGGCUCUACUUCAUCGCAUUCCUUGCAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-122.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -128.19
Frequency: 0.0001
Diversity: 67.79
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.......(((((((((.((.(.....(((((...))))).(((.....)))...).)).)))))).)))......))))))(......((((.(((((((((((((......))))).((....))......((((((.((..(((((((......(((..(((.(((.(((((.((((..((......))..)).)))))...)).))).)))..)))(((.((((((((((((((....((((.(((.(.(((((...((.....))...)).))))))).))))))))))))))))))))))))))))..)).))..)))).))))))))...))))............(((.....)))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.......({(((((((.((.,.....(((((...))))).(((.....}))...}.)).))))))},)).....,)))))){||.|..(({(.(((((((((((((......))))).,,....||....}}((((((.((..(((((((.,,,,,(,{..,((.(((.{,,,,,||||..,,.,,}.,)),.}}.|||||{{.,,.,,,.)))}.}))(((.((((((((((((((....((((.(((.(.(({{(,.,({....,)),..)).))}}))).))))))))))))))))))))))))))))..)).)),.,))).))))))))...))))............(((.....)))...)
Back