Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ESR1_0007200
Sequence Length
351 nt
GC Content
0.5812
CACCCUGAAGUCUCUGGAAGAGAAGGACCAUAUCCACCGAGUCCUGGACAAGAUCACAGACACUUUGAUCCACCUGAUGGCCAAGGCAGGCCUGACCCUGCAGCAGCAGCACCAGCGGCUGGCCCAGCUCCUCCUCAUCCUCUCCCACAUCAGGCACAUGAGUAACAAAGGCAUGGAGCAUCUGUACAGCAUGAAGUGCAAGAACGUGGUGCCCCUCUAUGACCUGCUGCUGGAGAUGCUGGACGCCCACCGCCUACAUGCGCCCACUAGCCGUGGAGGGGCAUCCGUGGAGGAGACGGACCAAAGCCACUUGGCCACUGCGGGCUCUACUUCAUCGCAUUCCUUGCAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-114.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -119.68
Frequency: 0.0001
Diversity: 64.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((((((...)))))((((((.........).)))))......(((((.((...)).)))))..((((.(((((((((((((......))))).((....))......((((((.((..(((((((......(((..(((.(((.(((((.((((..((......))..)).)))))...)).))).)))..)))(((.((((((((((((((....((((.(((.(.(((((...((.....))...)).))))))).))))))))))))))))))))))))))))..)).))..)))).))))))))...)))).....)))))..(((.....)))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((((((((...}))),{((({,...,,....|,})))}{{,,..({(({.{{...}),))})),.((((.(((((((((((((......))))).,,....||....}}((((((.((..(((((((.,,,,,(,{..,((.(((.{,,,,,||||..,,.,,}.,)),.}}.|||||{{.,,.,,,.)))}.}))(((.((((((((((((((....((((.(((.(.(({{(,.,({....,)),..)).))}}))).))))))))))))))))))))))))))))..)).)),.,))).))))))))...)))),,,.,)))))..(((.....)))....
Back