Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FAM120A_0000200
Sequence Length
746 nt
GC Content
0.6233
CCGCGCCCGCGCCCCCGCCGCCGCCAUGGGCGUGCAGGGCUUCCAGGACUACAUCGAGAAGCACUGCCCGAGCGCCGUGGUGCCGGUGGAGCUGCAGAAGCUGGCCCGGGGCAGCCUGGUGGGCGGCGGGCGGCAGCGGCCCCCGCAGACCCCGCUGCGCCUGCUGGUGGACGCCGACAACUGCCUGCACCGCCUCUACGGCGGCUUCUACACCGACUGGGUCAGCGGCGGCCAGUGGAACCACAUGCUUGGCUACCUGGCGGCGCUGGCCAAGGCCUGCUUCGGCGGCAACAUCGAGCUCUUCGUCUUCUUCAACGGCGCGCUCGAGAAGGCCCGGCUGCACGAGUGGGUCAAGCGGCAGGGCAACGAGCGCCAGACGGCACAGCAGAUCGUCAGCCAUGUCCAGAACAAGGGCACCCCGCCGCCAAAGGUCUGGUUCCUGCCGCCCGUCUGCAUGGCCCACUGCAUCCGCCUGGCGCUCAUCCGCUUCCACGUCAAGGUUGCACAGAGCAUUGAGGAUCACCAUCAGGAAGUGAUUGGUUUCUGCAGAGAGAAUGGUUUCCAUGGCUUGGUUGCGUAUGACUCUGAUUAUGCACUGUGCAACAUCCCCUACUAUUUCAGUGCCCAUGCCCUAAAACUGAGCCGGAACGGGAAAAGUCUCACCACAAGCCAAUAUCUGAUGCAUGAAGUUGCCAAGCAACUGGACCUGAAUCCAAAUCGUUUUCCUAUUUUUGCUGCUCUCUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-299.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -311.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 157.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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