Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FAM120A_0002600
Sequence Length
1260 nt
GC Content
0.5429
GUUGCACAGAGCAUUGAGGAUCACCAUCAGGAAGUGAUUGGUUUCUGCAGAGAGAAUGGUUUCCAUGGCUUGGUUGCGUAUGACUCUGAUUAUGCACUGUGCAACAUCCCCUACUAUUUCAGUGCCCAUGCCCUAAAACUGAGCCGGAACGGGAAAAGUCUCACCACAAGCCAAUAUCUGAUGCAUGAAGUUGCCAAGCAACUGGACCUGAAUCCAAAUCGUUUUCCUAUUUUUGCUGCUCUCUUAGGAAAUCACAUUCUGCCUGAUGAAGAUCUGGCUUCCUUUCACUGGAGUUUACUUGGUCCAGAACAUCCACUAGCCUCACUAAAGGUCCGGGCCCACCAGCUGGUCUUGCCACCUUGCGACGUAGUGAUCAAAGCCGUUGCUGACUAUGUACGCAACAUUCAGGACACCUCUGACUUGGAUGCCAUAGCUAAAGAUGUUUUCCAGCAUUCACAGUCUAGAACAGAUGACAAAGUUAUUCGAUUUAAGAGAGCAAUUGGAUAUUAUUCAGCGACUAGUAAGCCUAUGUCAUUUCAUCCACCACAUUACUUAGCAGCCAGACCCGGUCCGUUUGGAAUGCCUGGGAUGGUGCCGCCGCAUGUUCCUCCUCAGAUGCUCAACAUUCCGCAGACCUCUCUGCAAGCAAAGCCCGUGGCCCCACAGGUGCCCAGCCCAGGGGGCGCCCCGGGCCAGGGUCCAUACCCGUACAGCCUCUCUGAGCCAGCACCUCUCACUUUGGACACGAGCGGGAAGAAUCUGACGGAGCAGAACAGCUACAGCAACAUUCCUCACGAAGGGAAGCACACGCCGCUGUAUGAGCGGUCCUCGCCCAUCAACCCGGCCCAGAGCGGCAGCCCCAACCACGUGGAUUCCGCCUACUUCCCUGGCUCUUCUACAUCGUCAUCUUCCGACAACGACGAGGGCAGCGGAGGGGCGACAAACCAUAUCAGCGGGAACAAGAUUGGCUGGGAGAAGACGGGAAGCCACUCAGAGCCUCAGGCACGAGGAGACCCAGGAGACCAAACAAAGGCAGAAGGCUCGUCCACUGCCUCUUCAGGAAGCCAACUAGCCGAAGGCAAGGGAAGCCAGAUGGGCACUGUCCAGCCAAUCCCGUGCCUCCUGUCGAUGCCCACCAGGAACCACAUGGACAUCACCACACCUCCCCUGCCCCCCGUCGCACCUGAGGUGCUGAGAGUGGCCGAGCACAGGCACAAGAAGGGGCUGAUGUACCCCUACAUCUUCCAUGUCCUGACGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-396.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -418.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 383.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(...((.(((.(((((..(((((((.((....((((((((..((((((.((((...))))(((((((((((((((((......)))))).....))))).((((...((..((((((..............))))))..))...))))............))))))....((........))((((((...))))))(((......))).......................))))))..))))))))....)).)))))))..))))).((((((((((.(((((.(......).)))))...........((....(((((((.(((((.(.....((((((((((.....((((((((((((.(.(((.....))).).))))))).)))))....))))))...((((((((((((((...(((.......))).....))))))).)))).)))..((((((((.((.(((((((((.........))))))))).......((.........)))).))))))))...................))))..).))))).)).)))))...))..((((((.(((.(..((.(((((((((((((((.((.........(((((....))))).......((((.((((((....(((((((........)))))))..)))))))))).....(((((....((....((((.........))))....))......))))).)).)))))).))))..)))))))..).))).))))))....))))))))))....((((((.....))))))....(((.........))).))).))))))))(......(((((((....((((.((((((((((((..((((.(((.((((((.......(((((.((((((.(((((((.((....((((....(.((........((((.((((....(((((((.((.((.....((((..(((....((....((.(((((.........(((((..((.....)).)))))))))).))...)).....)))..))))..((((.((....(((((...)))))))...)))))))).)))))))....))))))))...)).)))))...)).))...))))).))))))..))))).....)))))).)))..))))..)))).)))).....)))))))).((((((....)))))).))))))).........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({.{,,.{{{{.{,(((((..(((((((.((.{,.((((((((..((((((.{(((...}}}|(((((((((({(((((,......,,,|||,..,,|},||.{{((...{{..{(((((,.....,,......))))))..)).,.)))}...}}..,,,,.})}))),...,,....,,,.},{(((((...)))))}(((......})),....,,..,.........,,..))))))..)))))))).,,,)}.)))))))..))))|((((((((.((.(((((.(......).)))))....,{{....((((..,,..|||},.|||,,..{{{((((((((((...,,((((((((((((.(.(((.....))).).))))))).))))}....||||,}...{(((((((((((((...(((.......))).....))))))).)))).))}..,(((((({.,|,{{{{{{{{{...,,,.,,}}})))))}...,,,.|{,,,,,},..}})).})))})},.,{{{{,...........(({.((({{(...,...))))))..))).,{({,{({{((.({,((.(((((((((((((((.{{.........(((((....))))).......((((.((((((....(((((((........)))))))..)))))))))).....(((((...{((....((((..,,...,,))))....))....,.))))).}}.}))))).))))..)))))||....}}..,.{{{{{...,,,)))))}}....((((((.....)))))}..,,||{,.,.....,)))..,}.))))),}){}|,.,,..||||}}..{(((,.((((((({{((({{{,.,.(((({.{{....}}..,|||,|}||||||.|||||||}}.....||,,....,.||,..}}}}}||||}|||,.,..}}.||}}}})},((({{.((((({((,.{({{(.{...({((,({.........(((((..(({{..{|{.,||}},..,}.)),}}))..}}.))),.||||{.((((.{{....(((({...)))))))...)))).)))))}}|||,{{{{.{{{...|,.....},))).}}}).,,...,,)),}))),,,,,),)))..})}))))),))))).}}})|{,.,,.|||||{,{,{{(((((........))))).,,))})}.,))},))).,...}
Back