Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_FAM120A_0003100

Sequence Length

2194 nt

GC Content

0.5460

GUUGCACAGAGCAUUGAGGAUCACCAUCAGGAAGUGAUUGGUUUCUGCAGAGAGAAUGGUUUCCAUGGCUUGGUUGCGUAUGACUCUGAUUAUGCACUGUGCAACAUCCCCUACUAUUUCAGUGCCCAUGCCCUAAAACUGAGCCGGAACGGGAAAAGUCUCACCACAAGCCAAUAUCUGAUGCAUGAAGUUGCCAAGCAACUGGACCUGAAUCCAAAUCGUUUUCCUAUUUUUGCUGCUCUCUUAGGAAAUCACAUUCUGCCUGAUGAAGAUCUGGCUUCCUUUCACUGGAGUUUACUUGGUCCAGAACAUCCACUAGCCUCACUAAAGGUCCGGGCCCACCAGCUGGUCUUGCCACCUUGCGACGUAGUGAUCAAAGCCGUUGCUGACUAUGUACGCAACAUUCAGGACACCUCUGACUUGGAUGCCAUAGCUAAAGAUGUUUUCCAGCAUUCACAGUCUAGAACAGAUGACAAAGUUAUUCGAUUUAAGAGAGCAAUUGGAUAUUAUUCAGCGACUAGUAAGCCUAUGUCAUUUCAUCCACCACAUUACUUAGCAGCCAGACCCGGUCCGUUUGGAAUGCCUGGGAUGGUGCCGCCGCAUGUUCCUCCUCAGAUGCUCAACAUUCCGCAGACCUCUCUGCAAGCAAAGCCCGUGGCCCCACAGGUGCCCAGCCCAGGGGGCGCCCCGGGCCAGGGUCCAUACCCGUACAGCCUCUCUGAGCCAGCACCUCUCACUUUGGACACGAGCGGGAAGAAUCUGACGGAGCAGAACAGCUACAGCAACAUUCCUCACGAAGGGAAGCACACGCCGCUGUAUGAGCGGUCCUCGCCCAUCAACCCGGCCCAGAGCGGCAGCCCCAACCACGUGGAUUCCGCCUACUUCCCUGGCUCUUCUACAUCGUCAUCUUCCGACAACGACGAGGGCAGCGGAGGGGCGACAAACCAUAUCAGCGGGAACAAGAUUGGCUGGGAGAAGACGGGAAGCCACUCAGAGCCUCAGGCACGAGGAGACCCAGGAGACCAAACAAAGGCAGAAGGCUCGUCCACUGCCUCUUCAGGAAGCCAACUAGCCGAAGGCAAGGGAAGCCAGAUGGGCACUGUCCAGCCAAUCCCGUGCCUCCUGUCGAUGCCCACCAGGAACCACAUGGACAUCACCACACCUCCCCUGCCCCCCGUCGCACCUGAGGUGCUGAGAGUGGCCGAGCACAGGCACAAGAAGGGGCUGAUGUACCCCUACAUCUUCCAUGUCCUGACGAAGGGUGAAAUCAAAAUUGCUGUUUCUAUUGAAGAUGAAGCCAACAAGGACCUGCCUCCGGCCGCUCUGCUCUAUAGGCCAGUUCGUCAGUAUGUUUACGGAGUCCUGUUUAGUUUGGCAGAAAGCAGAAAGAAAACUGAGAGACUUGCUUUUAGAAAGAACAGACUUCCACCAGAAUUUUCACCAGUGAUCAUUAAAGAAUGGGCAGCUUACAAAGGAAAGUCUCCUCAAACCCCGGAACUGGUUGAAGCUCUUGCCUUCAGGGAGUGGACCUGCCCCAACCUGAAGAGGCUGUGGUUGGGUAAGGCGGUAGAGGACAAGAACCGCAGGAUGAGGGCCUUCCUGGCCUGCAUGAGGUCGGACACCCCAGCCAUGCUCAACCCUGCCAACGUGCCCACUCACCUCAUGGUGCUCUGCUGCGUCUUACGGUACAUGGUGCAGUGGCCGGGAGCACGCAUCCUUCGGCGUCAGGAGCUAGAUGCCUUCCUGGCUCAGGCGCUGUCCCCCAAACUCUACGAGCCUGAUCAGCUCCAGGAGCUCAAGAUUGAGAACCUAGAUCCCCGAGGAAUUCAGCUAUCAGCUCUCUUCAUGAGUGGAGUAGACAUGGCCUUGUUUGCAAAUGAUGCAUGCGGACAGCCAAUCCCCUGGGAACACUGUUGUCCUUGGAUGUAUUUUGAUGGGAAGCUCUUCCAAUCCAAACUCCUCAAAGCCAGCCGGGAAAAGACCCCACUCAUUGACCUCUGUGAUGGUCAGGCUGAUCAGGCUGCCAAGGUAGAGAAGAUGCGCCAGAGCGUCCUCGAGGGGCUCAGCUUCUCCAGGCAGAGCCACACGCUCCCUUUCCCGCCGCCACCUGCCCUGCCCUUCUACCCUGCCUCUGCGUACCCCCGGCACUUUGGGCCUGUCCCACCCUCUCAGGGCAGGGGCAGAGGCUUUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-739.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -779.12

Frequency: 0.0000

Diversity: 542.11

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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