Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_FAM120A_0004900

Sequence Length

2368 nt

GC Content

0.5600

GAAAUCACAUUCUGCCUGAUGAAGAUCUGGCUUCCUUUCACUGGAGUUUACUUGGUCCAGAACAUCCACUAGCCUCACUAAAGGUCCGGGCCCACCAGCUGGUCUUGCCACCUUGCGACGUAGUGAUCAAAGCCGUUGCUGACUAUGUACGCAACAUUCAGGACACCUCUGACUUGGAUGCCAUAGCUAAAGAUGUUUUCCAGCAUUCACAGUCUAGAACAGAUGACAAAGUUAUUCGAUUUAAGAGAGCAAUUGGAUAUUAUUCAGCGACUAGUAAGCCUAUGUCAUUUCAUCCACCACAUUACUUAGCAGCCAGACCCGGUCCGUUUGGAAUGCCUGGGAUGGUGCCGCCGCAUGUUCCUCCUCAGAUGCUCAACAUUCCGCAGACCUCUCUGCAAGCAAAGCCCGUGGCCCCACAGGUGCCCAGCCCAGGGGGCGCCCCGGGCCAGGGUCCAUACCCGUACAGCCUCUCUGAGCCAGCACCUCUCACUUUGGACACGAGCGGGAAGAAUCUGACGGAGCAGAACAGCUACAGCAACAUUCCUCACGAAGGGAAGCACACGCCGCUGUAUGAGCGGUCCUCGCCCAUCAACCCGGCCCAGAGCGGCAGCCCCAACCACGUGGAUUCCGCCUACUUCCCUGGCUCUUCUACAUCGUCAUCUUCCGACAACGACGAGGGCAGCGGAGGGGCGACAAAGCCUUUCCAACUCUACUUGCAAAAAAACUUUGUGUUUCACAAAGAGAAUUCCAUCGUGCUCUGCUCCAGGAUCCUGAGGCAUGGCCAUAUCAGCGGGAACAAGAUUGGCUGGGAGAAGACGGGAAGCCACUCAGAGCCUCAGGCACGAGGAGACCCAGGAGACCAAACAAAGGCAGAAGGCUCGUCCACUGCCUCUUCAGGAAGCCAACUAGCCGAAGGCAAGGGAAGCCAGAUGGGCACUGUCCAGCCAAUCCCGUGCCUCCUGUCGAUGCCCACCAGGAACCACAUGGACAUCACCACACCUCCCCUGCCCCCCGUCGCACCUGAGGUGCUGAGAGUGGCCGAGCACAGGCACAAGAAGGGGCUGAUGUACCCCUACAUCUUCCAUGUCCUGACGAAGGGUGAAAUCAAAAUUGCUGUUUCUAUUGAAGAUGAAGCCAACAAGGACCUGCCUCCGGCCGCUCUGCUCUAUAGGCCAGUUCGUCAGUAUGUUUACGGAGUCCUGUUUAGUUUGGCAGAAAGCAGAAAGAAAACUGAGAGACUUGCUUUUAGAAAGAACAGACUUCCACCAGAAUUUUCACCAGUGAUCAUUAAAGAAUGGGCAGCUUACAAAGGAAAGUCUCCUCAAACCCCGGAACUGGUUGAAGCUCUUGCCUUCAGGGAGUGGACCUGCCCCAACCUGAAGAGGCUGUGGUUGGGUAAGGCGGUAGAGGACAAGAACCGCAGGAUGAGGGCCUUCCUGGCCUGCAUGAGGUCGGACACCCCAGCCAUGCUCAACCCUGCCAACGUGCCCACUCACCUCAUGGUGCUCUGCUGCGUCUUACGGUACAUGGUGCAGUGGCCGGGAGCACGCAUCCUUCGGCGUCAGGAGCUAGAUGCCUUCCUGGCUCAGGCGCUGUCCCCCAAACUCUACGAGCCUGAUCAGCUCCAGGAGCUCAAGAUUGAGAACCUAGAUCCCCGAGGAAUUCAGCUAUCAGCUCUCUUCAUGAGUGGAGUAGACAUGGCCUUGUUUGCAAAUGAUGCAUGCGGACAGCCAAUCCCCUGGGAACACUGUUGUCCUUGGAUGUAUUUUGAUGGGAAGCUCUUCCAAUCCAAACUCCUCAAAGCCAGCCGGGAAAAGACCCCACUCAUUGACCUCUGUGAUGGUCAGGCUGAUCAGGCUGCCAAGGUAGAGAAGAUGCGCCAGAGCGUCCUCGAGGGGCUCAGCUUCUCCAGGCAGAGCCACACGCUCCCUUUCCCGCCGCCACCUGCCCUGCCCUUCUACCCUGCCUCUGCGUACCCCCGGCACUUUGGGCCUGUCCCACCCUCUCAGGGCAGGGGCAGAGGCUUUGCAGGCGUCUGUGGCUUUGGAGGCCCCUAUGGGGAAACGGUAGCAACAGGCCCUUACCGUGCCUUCCGUGUGGCGGCAGCAUCGGGACACUGCGGAGCCUUCUCAGGCAGUGACAGCAGCAGGACUAGCAAGUCCCAGGGCGGAGUCCAACCUAUACCUUCUCAGGGAGGCAAACUAGAAAUAGCUGGCACUGUGGUUGGCCAUUGGGCUGGGAGCAGGCGGGGCCGUGGGGGCCGGGGGCCUUUCCCCCUGCAGGUGGUUUCUGUCGGAGGACCAGCUAGAGGGCGUCCAAGAGGAGUUAUUUCCACCCCAGUGAUUAGAACAUUUGGAAGAGGUGGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-852.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -894.24

Frequency: 0.0000

Diversity: 653.70

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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