Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FAM120A_0007100
Sequence Length
388 nt
GC Content
0.6263
CAGCCAGACCCGGUCCGUUUGGAAUGCCUGGGAUGGUGCCGCCGCAUGUUCCUCCUCAGAUGCUCAACAUUCCGCAGACCUCUCUGCAAGCAAAGCCCGUGGCCCCACAGGUGCCCAGCCCAGGGGGCGCCCCGGGCCAGGGUCCAUACCCGUACAGCCUCUCUGAGCCAGCACCUCUCACUUUGGACACGAGCGGGAAGAAUCUGACGGAGCAGAACAGCUACAGCAACAUUCCUCACGAAGGGAAGCACACGCCGCUGUAUGAGCGGUCCUCGCCCAUCAACCCGGCCCAGAGCGGCAGCCCCAACCACGUGGAUUCCGCCUACUUCCCUGGCUCUUCUACAUCGUCAUCUUCCGACAACGACGAGGGCAGCGGAGGGGCGACAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-132.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -139.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 54.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((......)))..)((((((((.((((((.(((.((.(((((.(((((((((((((((.((.........(((((....))))).......((((.((((((....(((((((........)))))))..)))))))))).....(((((....((....((((.........))))....))......))))).)).)))))).))))..)))))((....))....(((((......)))))......((((((.....))))))....(((.........))).....))))).)).))).)).)).))))))((((..((((((((.(((((.....((((..((....))..)))).)))))))).))))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((......))},.)((((((((.({((((.(((.((.(((((.(((((((((((((((.((.........(((((....))))).......((((.((((((....(((((((........)))))))..)))))))))).....(((((...,((....((((.........))))....)).,..,.))))).}).)))))).))))..)))))((....}}....(((((......))))},.....((((((.....)))))}..,.||(,........)))...,.))))).)).))).)).}).),))))((((,.((((((({,(((((.....((((..((....))..)))).)))))))).))))))))).))))
Back