Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FAM120A_0007800
Sequence Length
1241 nt
GC Content
0.5794
CCAGACCCGGUCCGUUUGGAAUGCCUGGGAUGGUGCCGCCGCAUGUUCCUCCUCAGAUGCUCAACAUUCCGCAGACCUCUCUGCAAGCAAAGCCCGUGGCCCCACAGGUGCCCAGCCCAGGGGGCGCCCCGGGCCAGGGUCCAUACCCGUACAGCCUCUCUGAGCCAGCACCUCUCACUUUGGACACGAGCGGGAAGAAUCUGACGGAGCAGAACAGCUACAGCAACAUUCCUCACGAAGGGAAGCACACGCCGCUGUAUGAGCGGUCCUCGCCCAUCAACCCGGCCCAGAGCGGCAGCCCCAACCACGUGGAUUCCGCCUACUUCCCUGGCUCUUCUACAUCGUCAUCUUCCGACAACGACGAGGGCAGCGGAGGGGCGACAAACCAUAUCAGCGGGAACAAGAUUGGCUGGGAGAAGACGGGAAGCCACUCAGAGCCUCAGGCACGAGGAGACCCAGGAGACCAAACAAAGGCAGAAGGCUCGUCCACUGCCUCUUCAGGAAGCCAACUAGCCGAAGGCAAGGGAAGCCAGAUGGGCACUGUCCAGCCAAUCCCGUGCCUCCUGUCGAUGCCCACCAGGAACCACAUGGACAUCACCACACCUCCCCUGCCCCCCGUCGCACCUGAGGUGCUGAGAGUGGCCGAGCACAGGCACAAGAAGGGGCUGAUGUACCCCUACAUCUUCCAUGUCCUGACGAAGGGUGAAAUCAAAAUUGCUGUUUCUAUUGAAGAUGAAGCCAACAAGGACCUGCCUCCGGCCGCUCUGCUCUAUAGGCCAGUUCGUCAGUAUGUUUACGGAGUCCUGUUUAGUUUGGCAGAAAGCAGAAAGAAAACUGAGAGACUUGCUUUUAGAAAGAACAGACUUCCACCAGAAUUUUCACCAGUGAUCAUUAAAGAAUGGGCAGCUUACAAAGGAAAGUCUCCUCAAACCCCGGAACUGGUUGAAGCUCUUGCCUUCAGGGAGUGGACCUGCCCCAACCUGAAGAGGCUGUGGUUGGGUAAGGCGGUAGAGGACAAGAACCGCAGGAUGAGGGCCUUCCUGGCCUGCAUGAGGUCGGACACCCCAGCCAUGCUCAACCCUGCCAACGUGCCCACUCACCUCAUGGUGCUCUGCUGCGUCUUACGGUACAUGGUGCAGUGGCCGGGAGCACGCAUCCUUCGGCGUCAGGAGCUAGAUGCCUUCCUGGCUCAGGCGCUGUCCCCCAAACUCUACGAGCCUGAUCAGCUCCAGGAGCUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-431.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -453.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 307.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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