Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FAM120A_0009100
Sequence Length
673 nt
GC Content
0.4175
AAGGCCAGGGUCCUGGAGAAAACUUCCAGCAGGUCUCUGGUUGGCCAUGUUUGUGCUGUUGGAGUGCCACCACGCAUGGCUCUGCAGCUGUAGCGAAGGUCGUGGGACUCACGGAUCGUCGCAGGAUUGUGAUGAUUUGUCUCGGAAUCCUCUGAGACCUGUGCACUUCCAGCUGAUCAACUCUGGGAGUGGGGGGUGCAGGUGGAAACACUGAAAAGGAUUGUUUGAAAAGUUGGUCAAAGAUGAGGUCAAAGCAUUUUUCUUUAUCUUCUAGUGGGCCUGUGUAAUACUUGGAGAAAAUGAUGCCUUUCUGUUCUAGGUAAUUUUAUCUCCUAAUGUAAGGAAUGUAAAAGUAACUGUAUAUUUAGUUGGAAAUACAGAAAAGAAUCCUCAAACAUACAGUCUGAGAAUAUUAUGAAUUGUGGAAAUUGUAAAUUACUAGAUCAUUCUUUGAGCCAUGGAUAAUUAGUUACAGACUAUUUGUUUGUGUGGUGGGUCAAUGCAGUCCUCCUGAGAUGGUGAAGCUCCUUGUCAGCACUGACUGUGUGCAGUGCUGAGCUUUGGAACUUUAACCUAAGUUCAUUAGAUUUAAAAUAUUUCUGUUUGCAAUUACUAUGACAAACUUGCAAUCUGUAAGGCUUUAAAGUGAAGCAGUUCUCACUACCUUUCCUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-193.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -208.75
Frequency: 0.0000
Diversity: 163.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((.((((..(........)..)))).))))))))(((((....)).)))((((.((.((((.......)))).)).))))...((.((((((.((((((((.(((((((((((((....)))))))))))))((((((....))))))((((.(.(((((((((..........)))))))))).))))...((((....)))).....(((((((.....(((((.((((.((.(((.((((((((......(((((((.(((((.(((.((((((..(((..(((((.((...(((((.........)))))...)).)))))....)))(((((((....(((((((((((.(((....))).)))))).........((((.((.....)).))))....((((((.((....)).)))))).)))))....)))))))(((.((((.(.........(((((((.....)))))))).)))).))))))))).))).)).))).))))))).......(((((((((.(.....))))))))))))))))((((((......))))))..((((..((...))..))))...))..))))).)))).)))))))))))).....((((((...))))))))))).))).)))))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((((.((((,,(.....,}})..)))).)))))))}((((({{{.,{{(|,({{(,,,.||||.,},}}}))))}||{|,,,.}}}}.((((((.((((((((.{((((((((((((....))))))))))))}((((((....)))))){(((.(,(((((((((.,........}))))))))}})))),||{(((....)})),....(((((((.....(((({.((((.((,{{{,{.{((({{......{|{((((,(((((.(((.((((((..{({..(((((.{{...(((((.........))))).,,}}.)))))....}}|(((((((....(((({((((((.(({....,)).)))))).......,.((((.((.....)).))))....,|{{|{,{|....,},}}}}},.}))))....))))))){((.((((.(,,,,.,,,,({{{|||,,.,,)))))))}.)))).))))))))).))).)),})).))}))}|.,,,...(((((((((.{.....,)))))))))})}}})({{{{{....,.})))))..{{((..,,...|}..}})),,,,,..,,,}}.)))).}))))))))))).....((((({...))))))))})))))).)))))).,...
Back