Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_FAT3_0004800

Sequence Length

354 nt

GC Content

0.4237

AGGAAGCAGAUUGACUGGGAGAGCUUUCCCUAUGGCUACAAUCUCACUCUUCAAGCAAAAGACAAGGGAUCUCCUCAAAAAUGUUCAGCAUUAAAGGCAGUCUACAUUGGCAACCCCACAAGAGACACUGUCCCCAUUAGAUUUGAAAAAGAAGUGUACGAUGUGAGCAUAAGUGAAUUUUCCCCUCCUGGUGUCGUGGUUGCUAUAGUAAAAUUAAGUCCUGAACCGAUAGAUGUGGAAUACAAAUUAUCUCCUGGUGAGGAUGCAGUGUACUUUAAAAUUAAUCCUCGGUCGGGUCUGAUUGUUACAGCACGGCCACUGAAUACUGUUAAGAAGGAGGUUUAUAAACUGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-77.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -85.70

Frequency: 0.0000

Diversity: 59.04

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.....((((((.(((((((....)))))...))...))))))..))(((((......((((..((((.....(((...(((((((.((((...((((((((....(((.....)))....))))..)))).....((.((((.......)))).)).)))))))))))...)))....))))((((((((((((((((((((...((((.....((.(((((.(((((((...((((.((((...(((((.(....).)))))...)))).))))...)))....))))))))).)).....))))))))..))))).).))))).......)))))))))......)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((...,.((((((.(((((({....}))))...))...))))))}.))(((((......,{{{..((((.....(((...(((((({,((((...((((((((....(((.....}}}....))},,})))).....{{.{(((.......)))).)}.)))))))))))...)))....))))((((((((((((((((((((...(((({({{.((.(((({{((((,,({(.{{((.((((...{{{{(,{,...||)))},...)))).))),..,}}.}}}.))))))))).))}}}}.))))))))..))))).),})))).......))))))}},......)))))