Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_FAT3_0005100

Sequence Length

438 nt

GC Content

0.4155

GAUGCAGUGUACUUUAAAAUUAAUCCUCGGUCGGGUCUGAUUGUUACAGCACGGCCACUGAAUACUGUUAAGAAGGAGGUUUAUAAACUGGAGGUGACAAACAAGGAAGGAGAUUUAAAAGCACAGGUCACCAUCAGCAUAGAAGAUGCAAAUGACCACACCCCAGAAUUUCAGCAACCACUGUAUGAUGCUUAUGUGAAUGAAAGUGUCCCAGUGGGAACCAGCGUUCUAACAGUUUCAGCUUCUGAUAAGGAUAAAGGAGAAAAUGGGUACAUCACCUAUAGUAUCGCUAGCCUGAAUUUGUUACCAUUUGUCAUUAAUCAGUUUACAGGUGUUAUUAGCACAACUGAAGAACUGGAUUUUGAAUCCUCCCCAGAAAUUUACAGAUUCAUUGUUAGAGCCUCUGACUGGGGUUCACCAUACCGCCAUGAAAGUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-105.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -112.89

Frequency: 0.0000

Diversity: 67.75

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((..(((..........))).)))((((((((.(.(((.......)))).))))).(((((.(((((((.(((.(.(((((.....((((.((((.........((.((.(((((........))))).)).)).((((.....)))).........))))))))...........((((((...(((((((..........))))))).)))))))))))..).)))))))))))))))(((((...........)))))...((((((.....))))))........((((.(((((((((.....(((((((..(.(((((((.((((((((...)))))..)))..))))))).)..)))........)))).....)))))))))..))))(((((((.....)))))))..(((......))).....)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((..,,{..........,,,.)))((((((((.(.(((.......)))).))))).(((((.((((((,,(((.(.(((((.....((((.((((.........{{.{{.{{{{{........}||||,}}.|}.((((.....))))...}},,,.))))))))...........((((((...(((((((,{....,,,.))))))).)))))))))))..).))))))))))))))).(((((...{({{{..,,{|,.((((((..((((({....((((...))))...}))...)))..)))))).{{{..,.(((((((.((((((({...}))))..)))..))))))}.}..)}}}}}))...)))),....,||},|||,,.||,,(((((((.....)))))))..,,,....,.}}}.....)))