Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FAT3_0005300
Sequence Length
1723 nt
GC Content
0.4248
UUUACAGGUGUUAUUAGCACAACUGAAGAACUGGAUUUUGAAUCCUCCCCAGAAAUUUACAGAUUCAUUGUUAGAGCCUCUGACUGGGGUUCACCAUACCGCCAUGAAAGUGAGGUCAAUGUGACUAUUCGAAUAGGAAAUGUCAACGACAACAGCCCUCUCUUUGAAAAAGUGGCUUGCCAGGGAGUUAUUUCAUAUGACUUUCCAGUUGGUGGUCACAUCACAGCAGUCUCAGCGAUCGAUAUCGAUGAACUUGAACUUGUAAAGUACAAAAUCAUUUCUGGAAAUGAACUUGGCUUCUUUUAUUUAAACCCAGAUUCUGGUGUUUUACAGCUUAAAAAAUCACUGACAAAUUCUGGCAUUAAAAAUGGCAAUUUUGCCCUCAGAAUUACAGCAACUGAUGGAGAGAAUCUUGCAGACCCCAUGUCUAUUAACAUUUCAGUCCUACAUGGGAAAGUGUCUUCAAAGAGCUUCAGUUGCAGAGAAACUCGUGUGGCUCAAAAGCUGGCAGAGAAACUACUCAUUAAGGCAAAAGCAAAUGGGAAACUGAAUCUGGAAGAUGGAUUUCUUGACUUUUAUUCAAUUAAUAGACAGGGACCAUAUUUUGACAAGUCUUUUCCUUCUGAUGUGGCUGUAAAGGAGGAUCUGCCAGUUGGUGCUAACAUUCUGAAGAUUAAAGCCUAUGAUGCCGACUCUGGCUUCAAUGGAAAAGUGCUAUUUACAAUAUCAGAUGGAAAUACGGAUAGUUGCUUUAAUAUUGAUAUGGAGACUGGGCAGCUUAAAGUCCUUAUGCCCAUGGAUCGAGAACACACAGACCUCUAUCUCCUUAAUAUCACCAUCUAUGACUUAGGUAAUCCACAGAAAUCGUCAUGGAGACUGCUGACCAUCAAUGUGGAGGAUGCUAAUGACAAUAGCCCAGUUUUUAUUCAAGACAGUUACUCAGUUAACAUUCUUGAAAGUUCAGGCAUUGGUACUGAAAUCAUUCAAGUGGAAGCCAGAGACAAAGACUUAGGUUCUAAUGGUGAAGUGACUUACUCAGUCUUGACAGAUACACAGCAGUUUGCCAUCAAUAGCUCAACUGGAAUCGUUUAUGUAGCCGACCAGUUGGACCGGGAAUCCAAAGCCAAUUAUUCUUUGAAAAUAGAAGCCAGGGACAAGGCAGAGAGUGGUCAGCAGCUGUUUUCAGUUGUCACUCUUAAAGUUUUUUUAGAUGAUGUCAAUGACUGCUCCCCAGCUUUCAUUCCCAGUAGCUAUAGUGUGAAGGUUCUUGAAGAUCUCCCUGUUGGCACUGUCAUUGCUUGGCUUGAGACCCAUGAUCCAGAUCUUGGACUGGGGGGUCAAGUGCGCUAUUCUUUGGUCAAUGACUAUAAUGGGAGAUUUGAAAUAGAUAAAGCAAGUGGUGCCAUCCGCUUGAGCAAAGAGCUUGAUUAUGAGAAACAGCAGUUCUAUAACCUUACUGUGCGGGCCAAAGACAAAGGGCGGCCUGUCUCUCUGUCAUCUGUUUCCUUUGUUGAGGUGGAAGUGGUGGAUGUCAAUGAAAACCUCCACACUCCCUAUUUCCCAGACUUUGCUGUUGUUGGAUCUGUAAAGGAAAACUCACGCAUUGGAACAAGCGUGCUGCAGGUGACUGCUCGAGAUGAAGACUCCGGAAGGGAUGGAGAGAUCCAGUACUCCAUCAGGGAUGGCAGUGGUCUUGGAAGGUUCAGUAUAGACGACGAGAGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-464.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -504.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 574.08
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((((...)))))..)))....((((((((((..(((((..((.....(((((((((((.......(((((((.....)))))))..((((((..(((....))).)))..)))((((..(((......)))..))))..(((((((((....(((..((((.((.((.....(((((((...(((((...(((((((.((((((.((.........(((((((......((.(((((((((((..(((.((((...)))).)))..)))))((((((((((..((((((((((.((.((((((.((((((((((((.((((.((((((...............((((((((..........((((....)))).))))))))...((((((((.....((..(((((.(((((((((((...................))))))).....)))).).)))).)))))))))).(((..((....))..)))..))))))...)))).))))((((((...((....)).)))))).....))))))))...((((..((((((.((.(((......))).)).))))))))))..........((..(((((.((((((((...((((((..(((((((..(((...((....))...))).)))))....((..(((.((((....)))).)))..)).......)).)))))))))))))).))))).))(((((((((((((..((((((..(((((((((((((..............)))))..((((.(((...........))).))))........(((((((.((.(((((((((..((((((......((((.(.......)))))......))))))((..((((.......))))))........(((((((..((((......))))..)))))))..(((.(((.....(((((((....))).))))...))).)))......))))))))).))))))))).(((..((..(((....)))..))..)))...))))).)))))))))..((((((((..(((..........)))))))))))...((....)))))).))))))))))))))))).))))))))))..)).....(((((((....(((((((....))))))))))))))......)))))))).)))))).)))))))))))))))))........((.((....)).)).)))))))..)))))..))))))).((((((((.(.((((((.((((((..(((..(.((((.....)))))..)))..))))))...(((((...(((((...))))).))))).................)))))))))))))))(((((((.((((((((((.((((...(((.....(((((...........)))))(((((((.............))))))))))...))))...)))..))))))).)))))))((((.((((.((........)).)))))))))))).))))..)))....))))))))))))))))))))........(((((.(((...))))))))..((((....))))..(((.......))).))..)))))...))))))))))((((((((...))))).)))(.(((((....(((.......)))..))))).).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({,{{{(((({...}))))..|}},|,.((((((((((..,((((,{({.....{((((((((((,......(((((((.....)))))))..{,,(((..({{....))).)))..,}|((((..(((......)))..)))).|(((((((((....(((..({{,.,(((((,,{((((((((((((,,,,.}}}|||||||,.,||||||}}}).,...((((((({{,.,{({,{,,||||,|||..{((.{{((,,.,}}),)))..|||||(((({{{|{{,.((((((((((.,,.{(((({.((((({({{(((,{(({.{{{{{{.......,.,,,...{{{{{(((..,,......((({....)))).|||||}}}...((((((((....,({..(((((.(((((((((((..,,,.,......,}}...))))))).....)))).},}})}.}})))))))).(((..{(,,..)),,))}..}))))}..|}}}..,}}.((((((...((....)).})))))..,,,))))))}){{,((((..{(((((.((.(((......))).)).)))))}}}}}.}},......||..{{{{{.{{{{{{{{.,,|{|{{{|||,{{|||.,|||,,,{{,.,.}),,,))).})}}}...,||,.{((.((({....|))).))},|||....,,,||,|}}}}}}}}))))}.))}}}.,,(((((((((((({..{{{(((,,{((((({((((((,,.....,,.....)))))}.(({{.(((........}..))).,)))}}...,,,|||,,{{,{{,{{({{{{{{..{{{{{{...,,.|||{,||,,,||||)))),||...)))))}{{..((({.......)))))).,,,,,,.{((((((..((((......})))..))))))}.,{((,({{.,,..{{|||||....}}},,}}||}|))).}||.,....}))}})))),}}}}}}))},||{|{|.....,||||},,.|}},...,}}})})))}}}}},,}}},,{(((((((..((({(.....)),}))))))))))...((....))}})),,}}}}}}))})))}},,.))))))))))..}}.{{|.(((((((....(((((((....)))))))))))))}...}},}}}}}))}})}}},,...)))))))....{||{{|{{,...,,,,|,,,.,|,|}|}}}}}}|,,||,|{(((({((,|,(({{{,,({({((((({.((((((..(((..(.((((,...,)))))..)))..))))))...{{{,,...{||{|}}})))},,)))))}}}}}}},.,,,||,..,,}|||||||}}}},{||||||,((({{{({{|.{(((...((({....(((((...........))))){((((((.............))))))),))},.)))),,.))},,})))))),)))}||}{((||{(({.{(....,...)),)))))))),})},))))..)))....)))))))))))))))))))},.......(((((.(((...))))))))..((((....)))),{{,(.......})),))..)))),}}})))))))))){(((((((...))))).))),,((({{,...,||},....}))|.,|,,,,,),
Back