Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FAT3_0008500
Sequence Length
648 nt
GC Content
0.3873
ACAGUUCGUCUUUUCAAAUUAUGAAGAACAUUUUACCUGGGUUCAUUACAUUUCAUCUUGUAAGAUUGUGAUCAUCUGUUGAUUUCUAUAUAUGUGGUUCUCUAAAUUAAGUUGUGCCUGAUAAGUGGACUGUGAUGGGGCUAAACAAAGGACCCUCUCUCAAACUCCUAGAAACCUCUCUCCUUGUCUUCAAUAUUUCAACUUCCCAAGAGUAAAAUUAUAUGACACCUUGGAAAGUUCACUGGUAGUCAUAGCUUAUCCAGAUUUUAGUCCAGACCCUAUCACUAUUAUUAACAGUGGACAAGUUUACUUCAUUUCUAUAGGCCACAGAAUCCUCACCUAUAAAUCAAGGAGUUUGAGCAACAAUAAAACCAUCAAUACCUGCUGUGUGUACUGCUACAGCAUUUCCUACUCCCACGUAGACAUCAUUAAUCAAUUAUAAUGGCCUUUCAUACAUGCUCAUGCUUUGCAUCCAUUUCAACCUAACCCUGAGCGGGAGCUGGUUUUGCGAAAUGACAUUUAUUUGCCAUUGAGGGCCCUGAGACCGUCUCUAUCUCUGACAGUCUUUGAGUCUAUAUAUGAGAAUGGUAUUGAAGUGAAGGGAAAAAGGAGACUGGUGGGAGAGAUGAUAGAAAUGCAGUUAAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-139.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -151.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 123.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....))(((((((.....))))))(((((((((..((((............)))).)))))).)))(((...((((..((((((((......((((((.........(((..((((.((.((....))...)).))))..)))..))))))((((((((.....((((...(((.((.((((..(((((((((((((((((.(((((.((.............))))))).)))))...(((((((.((((....((..(((....)))..))..)))).)))))))....((((((.(((((.....(((((((...((((((...........(((........)))(((.((((((....................(((((((.((...)))))))))....((((......))))...((((((........))))))...........)))))).)))..((.(((..((((.........))))..)))))))))))...))))))).....))))))))))).((((.(.(((((.(((.........))).))))).).))))........)))..)))))))))..))))))...)))...))))))))))))...))))))))))))...))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.....}}(({((((.....))))}|{{{{{{{{{..{{||,,.,,,,,....,}},,))))))},}|(((...((((..((((((((.,,,..((((((.........(((..((((.((.{,....,,...)).))))..))),.))))))((((((((..,,,((((...{{{.{{{((((..(((((((((((((((((.(((((.((.........,...))))))).))))}...(((((((.{{((....{{..(((....}))..}}..)))).))))}}}....((((((.(((((..,..(((((((,,,((({{,..,....,}..|||,,,.....}||(((.((((((....................(((((((.{,...}))))))))....((((......))))...,(((((........)))))}...........)))))).)))}.((.{{(..{{({.........})}}.,))})}}))))}.,.)))))))..,..))))))))))).((((.{.(((((.(((.........))).))))).).))))........)}..,)))))))))..)))))}...))),,.}})))))))))),,,))))))))))))...)))))
Back