Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FAT3_0010000
Sequence Length
666 nt
GC Content
0.4715
GUGACUGUGACAGAUGGUGGUCCCUCUCCAAAACAGUCAACCAUUUGGGUGGUGGUUCAGGUUCUAGAUGAAAAUGACAACAAGCCCCAGUUCCCAGAGAAGGUCUACCAGAUCAAGCUGCCAGAACGUGACCGAAAGAAGAGAGGAGAACCGAUUUACAGGGCUUUUGCAUUUGAUAGAGAUGAGGGCCCCAACGCAGAAAUCUCCUACAGUAUUGUGGAUGGGAAUGAUGACGGAAAGUUCUUUAUUGACCCUAAAACUGGGAUGGUUUCUUCUAGAAAGCAGUUUACAGCAGGCAGUUAUGACAUCCUAACGAUAAAGGCAGUGGACAAUGGGCGCCCACAGAAAUCCUCCACGGCCCGCCUCCACAUUGAAUGGAUUAAGAAACCACCCCCUUCACCUAUACCAUUGACCUUCGAUGAGCCGUUUUAUAACUUCACAGUCAUGGAAAGUGAUAGAGUGACUGAAAUUGUAGGGGUGGUGUCUGUGCAGCCAGCUAACACCCCUCUGUGGUUUGACAUAGUUGGGGGGAAUUUUGACAGCGCUUUUGAUGCAGAGAAGGGUGUUGGGACAAUUGUCAUCGCAAAACCUUUGGAUGCAGAGCAGAGGUCCAUCUAUAAUAUGAGUGUGGAAGUCACCGAUGGGACAAAUGUUGCUGUUACUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-182.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -196.10
Frequency: 0.0000
Diversity: 167.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((....((((..((((((((.......(((((((.(((((((((.((((((..(((.....)))..)))......))))))...))))))...)))((..(((......)))..))....))))........)))))).))))))..)))).(((((((..(((((.....)))))))))))).............((((((.(((((((((((((....((((((((...((((........(((.......))).((.(((((...))))).))(((...(((.(((.((...(((((((...((((.......(((((...(((((....................)))))..)))))))))...))))......((((((((............((((((...))))))((.((((((((.((((..((....))..)))).)))))))).)).........)))))))))))...)).))).)))))).((((((((((......)))))..))))).........((((((((((.........))))))))))))))..)))))))).....(((((((.........))))))))))))))))))))..))).)))))))))(...(..(((........)))..)...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({((((,,..{(((,,((((((((.....,.((((.{,.,{{((((((,((((((..(((.....)))..)))...,..)))))}{{{|,|||,...{{(((..,||}}}...)))..,))}}.)))).,......)))))).},)))}.,}},,.(((((({..(((((.....)))))})))))).............((((((.(((((((((((((...{((((((({...((((,.......(((.......))).((.(((((...))))).)),,,...(((.(((.((...{{{,,{{,..|{{|..,||,.(((((...{((((......,{.....,}.....)))))..))))),}}}..,}}},..,,,.((((((((...,,.......((((((...)))))),{.,((({{{,.{{((..((,,,,|}..}})).})})})))}}},.....}.,))))))))})),..}).))).))),,|.(((({(((((......)))))..))))),.....,..((((((((((.........))))))))))}}}}..})))))))}....(((((((.........))))))))))))))))))))..))).)))})))))(...{,|{({.......,}))).)...)
Back