Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FAT3_0011900
Sequence Length
585 nt
GC Content
0.4803
GAGGAAACCCUCGAGGAAGGUUUGCUCUGGGCCUGGUGCAAAGUGAGUGGAAGGUCUAUGUGAAGAGGCCUCUAGACAGAGAAGAACAGGACAUUUACUUUCUCAAUAUCACUGCCACUGAUGGGCUUUUUGUCACACAGGCCAUGGUGGAAGUGAGCGUCAGUGAUGUGAAUGACAAUAGCCCAGUGUGUGAUCAGGUUGCAUAUACAGCAUUACUUCCUGAAGACAUUCCAUCAAAUAAAAUCAUCCUGAAAGUCAGUGCAAAGGAUGCUGAUAUUGGAUCCAAUGGAUAUAUACGAUACUCACUCUAUGGAUCUGGAAACAGUGAAUUUUUUCUAGAUCCAGAAAGUGGCGAGUUAAAAACCUUGGCUCUGUUGGACCGGGAGAGGAUCCCCGUGUACAGCCUGAUGGCCAAGGCCACUGACGGGGGUGGCAGGUUCUGCCAGUCCAACAUCCACCUAAUCCUGGAGGAUGUGAAUGAUAACCCCCCUGUGUUUUCUUCUGACCACUACAACACCUGUGUCUAUGAGAACACAGCCACCAAGGCUCUGUUGACCAGAGUUCAAGCCGUGGACCCCGACAUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-190.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -200.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 140.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....)))).((...((((((((((((((((((((...(((((.((((((((..((((........((((....)))).........))))..)))))).))...)))))..))))...)))))....((((.(((((((.((((((........(((((((.(((.....)))...(((...((.((.(((((((((.((((.(((((((.(((......(((.(((...................))).)))......)))))))))).....((.(((((((((............(((((...((((((((((((..........))))))))))))...)))))((((........))))..)))))))))))((((.....)))).)))).))))))))).)))).))))))))))(((((((((((...))))).(((..((((((.((.......)).))))))....))).))))))((((((((((....(((.((..........)))))...)))))))))))))))).))).)))))))))))))..))))))((.(....).)).)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((....)}}}.{,,..(((({(((((((((((((((...{((((.((((((((,,{(({.....,,,|{{{....}|}},........}}})..})))))}}....))))).,}}}}..,|||||....((((.(((((((.((((((........(((((((.(((.....))}...(((...((.((.(((((((((.{(((.(((((({.{{{,,{{,.{{{.{{{..................,}}}.})),,.,..,})))))))).,,,.((.(((((({{{............{((((...((((((((((((.,,.....,.))))))))))))...))))},((({{{,....,)))}}))}))))))))((({.....)))).)})).))))))))).)))).))))))))))(((((((((((...))))),{{{..((((((.((.......)).))))))....}}}.})))))((((((((((....(({{((..........)))))...)))))))))))))))).))).)))))))))))))}.)))))){{||..,,}.,}.,}.
Back