Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FAT3_0012800
Sequence Length
1494 nt
GC Content
0.5087
GGGGUAUUUCUGUCUCUGAAGUCCUGGACUAUGAAUUAUGCAAAAGGUUUUACCUGGUAGUGGAAGCCAAAGAUGGGGGCACCCCAGCUCUCAGCGCUGUGGCCACUGUCAACAUCAACCUCACAGAUGUUAAUGACAACCCUCCCAAGUUCAGCCAAGACGUCUACAGUGCGGUUAUCAGUGAAGACGCCUUGGUGGGAGACUCUGUCAUUUUGCUAAUAGCAGAAGAUGUAGACAGCCAGCCCAACGGACAGAUUCAUUUUUCCAUUGUGAAUGGAGAUCGGGACAAUGAAUUUACUGUAGAUCCUGUCUUGGGACUUGUGAAAGUUAAGAAGAAAUUGGACCGGGAACGGGUGUCUGGAUACUCUCUGCUUGUCCAGGCCGUAGACAGUGGCAUUCCUGCAAUGUCAUCAACUGCAACUGUCAACAUUGAUAUUUCUGAUGUGAAUGACAACAGCCCGGUGUUUACACCUGCCAACUAUACUGCUGUGAUUCAGGAAAAUAAGCCAGUGGGCACCAGCAUCUUGCAGCUGGUGGUGACAGACAGAGACUCCUUUCACAAUGGGCCUCCCUUUUCAUUCUCUAUUUUGUCGGGAAAUGAAGAGGAGGAGUUUGUGUUGGACCCUCAUGGGAUCUUGCGGUCGGCUGUGGUCUUCCAGCACACAGAGUCUCUGGAAUACGUGUUGUGUGUCCAGGCAAAGGAUUCAGGCAAACCCCAGCAAGUUUCUCACACUUACAUCCGCGUGCGAGUCAUUGAGGAAAGCACCCACAAGCCCACAGCCAUUCCCCUGGAAAUUUUCAUUGUCACCAUGGAGGAUGACUUUCCUGGUGGGGUCAUUGGGAAGAUUCAUGCCACAGAUCAAGACAUGUAUGAUGUGCUCACAUUUGCCCUGAAAUCGGAGCAGAAAAGCUUAUUUAAAGUGAACAGUCACGAUGGGAAAAUCAUCGCCCUGGGAGGCCUGGACAGCGGCAAGUAUGUCCUGAAUGUGUCUGUGAGUGAUGGUCGCUUCCAGGUACCCAUUGAUGUGGUCGUGCAUGUGGAGCAGUUGGUGCAUGAGAUGCUGCAGAACACUGUCACCAUCCGCUUUGAAAAUGUGUCCCCUGAGGACUUCGUGGGGCUGCACAUGCAUGGGUUCCGGCGCACCCUGCGGAAUGCAGUCCUCACCCAGAAGCAGGACAGCCUGCGCAUCAUCAGCAUCCAGCCCGUGGCAGGCACCAACCAACUGGACAUGCUGUUUGCGGUGGAGAUGCACAGCAGCGAGUUCUACAAGCCAGCCUACCUGAUCCAGAAGCUGUCCAAUGCUAGAAGACACCUGGAGAAUAUCAUGCGCAUCUCAGCCAUCUUGGAGAAGAACUGCUCAGGGCUGGACUGUCAGGAACAGCAUUGUGAGCAAGGCUUGUCACUCGAUUCCCACGCGCUCAUGACCUACAGCACGGCUCGCAUCAGCUUUGUGUGUCCGCGUUUCUACAGGAACGUGCGUUGCACCUGCAAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-508.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -535.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 321.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(((((.......))))))))((((((((((....((....((...(((((((.(((((..((((.((.(((((((......)))))))...)).))))..(((((.((((((((.((...)).))).((((((...(((((.......((((((.(((((.((.((.......)).)).))))).)))))))))))....))))))((((((...)))))).))))).)))))(((.((..(((((((.((((...((((((((...))))))))..(((((.............(((((((((((((((..(......................)..))))).))))).))))).(((((..(((((.(((((((((((((...((((((((.....))))))))...))))..((((...((((.(((((...))))).))))...))))((((((((((((..............(((((.(((((((((.((((.(((((((.(.(((((((........))))))).).))...(((((((((.............(((((.(((((((((((.........))).)))))))))))))....(((((((((.((.((...((((....))))...)).))...)))))))))..)))))))))..(((((((((.((.(((..((((..(((((..((......)).((...(((((((.((((.(((....))).))))...))))))).)).((((...((((.((.(((.......(((((...(((((.((......)).))))).))))))))))))))...))))..))))).))))...))))).)))))))))..)).)))...))))..)))).))))).)))))...............)))))))....((((((.....))))))..))))).))))))))))))))..)))))))))))))).)))))))..).).)))))))).))))))).))..((((((((((((((.(((((..((...(((((.((.(((((.((((....(((((.....(.(((((........((((.....))))...(((((((((((..((((.((((........))))))))...)))))))).)))...))))).)))))).)))))))))..((((((((((....(((......))).....)))))..))))).((((.(((......))).))))(((((...(((((((.......((..((((((.((((....((((..........................))))..))))..)).))))..))...((((((..((((..((....))..))))....)))))).))))))).))))).....)).)))))..))..)))))))))))).))))))))))))))).))))(((((((....))))))).((((((....))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.({(.{((((.,.....}}}}}}}|(((({{{{{,....{{,...((...(((((((.(((({..((((.,(.(((((((......)))))))...}}.))))..(((((.(((((,,,.,,...}}.}},.{(((((...(((((.......{(((((.(((((.((.((.......)).)).))))).)))))))))))....)))))|((((((...)))))).))))).)))))(((.{,,.(((((((.((((,..((((((((...}))))))).,(((((,..........,.(((((((((((((((..(,.....................)..)))))},)))).))))).|((((..(((({{(((((((((((((...((((((((.....))))))))...))))..{(((,..((((.(((({...))))).))))...})))(({((((,,,,|}}}......,,...(((((.(((((((((.{(({.((({,((.(.(((((((........))))))).).))...(((((((((,,..,.....}}.((({(((((((((((((.........)))})))))))))))))....(((((((((.{{.((,{{((((....))))..})),))...)))))))))..)))))))))..(((((((((.((.(({..((((..((({(,.{(,...,,||.{(...(((((((.((((.(((....))).))))...))))))).}}.{{{{...{(((.{,,{{{....,..(((((...(((((.((......)).))))).)))))}))))))))...))))..))))).))))...})))}.)))))))))..}}.)))...))))..))))}}}))).)))))...,}..........||||,},.,,,|(((((.....))))))..))))).))))))))))))))..)))))))))))))).)))))))..).,.)))})))).))))))).)}.,((((((((((((((.(((((..((,,.(((((.((,(((((,((((....|||{|,.,,,|,(({{{,.....,.((((.....))))...(((((((((((..((((.((((.,....,.))))))))...)))))})),)))...}},||{||,,,,}))))|||}}.,||||{{((((,.,,(((,,,...|||.,...}))),..))))).,|||||{||,{,|||,,.}}},{((((...(((((((.,.....((,.(((((,.({((,,..,{{{,.,..,.,..}}}}}.....,}.,},)}}},,)})),.||||})}.,))...((((((.,((((..((....))..))))..,.)))))).))))))).))))).....)}.)))))..))..)))))))))))).)))))))},)))))),)))){((((({....))))))).((((((....))))))
Back