Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_FAT3_0013500

Sequence Length

1561 nt

GC Content

0.5580

GCAAAGGAUUCAGGCAAACCCCAGCAAGUUUCUCACACUUACAUCCGCGUGCGAGUCAUUGAGGAAAGCACCCACAAGCCCACAGCCAUUCCCCUGGAAAUUUUCAUUGUCACCAUGGAGGAUGACUUUCCUGGUGGGGUCAUUGGGAAGAUUCAUGCCACAGAUCAAGACAUGUAUGAUGUGCUCACAUUUGCCCUGAAAUCGGAGCAGAAAAGCUUAUUUAAAGUGAACAGUCACGAUGGGAAAAUCAUCGCCCUGGGAGGCCUGGACAGCGGCAAGUAUGUCCUGAAUGUGUCUGUGAGUGAUGGUCGCUUCCAGGUACCCAUUGAUGUGGUCGUGCAUGUGGAGCAGUUGGUGCAUGAGAUGCUGCAGAACACUGUCACCAUCCGCUUUGAAAAUGUGUCCCCUGAGGACUUCGUGGGGCUGCACAUGCAUGGGUUCCGGCGCACCCUGCGGAAUGCAGUCCUCACCCAGAAGCAGGACAGCCUGCGCAUCAUCAGCAUCCAGCCCGUGGCAGGCACCAACCAACUGGACAUGCUGUUUGCGGUGGAGAUGCACAGCAGCGAGUUCUACAAGCCAGCCUACCUGAUCCAGAAGCUGUCCAAUGCUAGAAGACACCUGGAGAAUAUCAUGCGCAUCUCAGCCAUCUUGGAGAAGAACUGCUCAGGGCUGGACUGUCAGGAACAGCAUUGUGAGCAAGGCUUGUCACUCGAUUCCCACGCGCUCAUGACCUACAGCACGGCUCGCAUCAGCUUUGUGUGUCCGCGUUUCUACAGGAACGUGCGUUGCACCUGCAAUGGAGGACUGUGUCCGGGGUCCAACGAUCCUUGUGUGGAGAAGCCGUGUCCAGGGGACAUGCAGUGUGUCAGUUAUGAAGCCAGCAGGAGACCGUUCCUCUGCCAGUGUCCACCAGGGAAGCUCGGAGAGUGCUCAGGGCACACUUCUCUCAGCUUUGCUGGAAACAGUUACAUCAAAUAUCGGCUUUCUGAAAAUAGCAAAGAAGAGGAUUUCAAACUAGCUCUGCGUCUUCGAACACUGCAAAGCAAUGGGAUUAUAAUGUACACCAGAGCAAAUCCCUGCAUAAUUCUGAAGAUUGUGGAUGGCAAGCUGUGGUUCCAGCUGGACUGCGGCAGCGGCCCUGGAAUCUUGGGCAUCUCGGGCCGUGCUGUCAACGACGGGAGCUGGCACUCGGUCUUCCUGGAGCUCAACCGCAAUUUCACGAGCCUGUCCCUGGAUGACAGCUACGUGGAGCGGCGCCGGGCGCCCCUCUACUUCCAGACGCUGAGCACUGAGAGUAGCAUCUACUUCGGCGCCCUGGUGCAAGCGGAUAACAUCCGCAGCCUGACUGACACGCGGGUCACGCAGGUGCUCAGCGGCUUCCAGGGCUGCCUGGACUCGGUGAUACUGAAUAACAAUGAGCUGCCGCUGCAGAACAAGCGCAGCAGCUUCGCGGAGGUGGUGGGCCUGACGGAGCUGAAGCUGGGCUGCGUGCUCUAUCCCGACGCCUGCAAGCGCAGCCCGUGCCAGCACGGGGGCAGCUGCACUGGCCUGCCAUCGGGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-583.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -609.85

Frequency: 0.0000

Diversity: 601.54

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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