Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_FAT3_0014200

Sequence Length

1061 nt

GC Content

0.5212

ACAAAGGGGUUGAUGACCCGGGAGAAGUGACCUGCUUUGCAGGUAGUAAUAAAGGCAGCAACUCUGAAGUUCAGUCCCUCAGCUCCUUCCAGUCAGAUUCUGGUGACGACAAUGCCUCCAUAGUGACUGUCAUUCAGCUUGUCAACAAUGUAGUUGACACUAUAGAGAAUGAAGUGUCUGUCAUGGACCAAGGACAGAACUACAACCGAGCCUAUCACUGGGACACCUCUGAUUGGAUGCCAGGGGCCCGCCUGUCGGACAUAGAGGAAGUGCCCAACUAUGAGAACCAGGAUGGAGGGUCUGCACACCAGGGGAGCACACGGGAGCUGGAGAGCGAUUACUACCUGGGUGGUUAUGACAUUGACAGUGAAUACCCACCCCCUCAUGAAGAGGAGUUCUUGAGUCAGGACCAGCUGCCUCCUCCUCUCCCGGAGGACUUCCCAGACCAAUAUGAGGCCCUGCCACCCUCCCAGCCUGUCUCCCUGGCCAGCACACUGAGCCCAGACUGCAGGAGAAGGCCCCAGUUUCAUCCUAGCCAGUAUCUCCCUCCUCACCCAUUCCCCAACGAAACGGAUUUGGUGGGCCCGCCUGCCAGCUGUGAAUUUAGUACUUUUGCUGUGAGCAUGAACCAGGGCACAGAGCCCACAGGCCCAGCAGACAGCGUGUCUCUGUCCUUGCACAAUUCCAGAGGCACCUCAUCCUCGGAUGUGUCUGCCAACUGCGGCUUUGACGAUUCCGAAGUAGCCAUGAGUGACUACGAGAGCGUGGGAGAGCUCAGCCUCGCCAGCCUUCACAUUCCCUUUGUGGAGACUCAGCAUCAGACUCAAGUGUAGACAUCACAUCUUGGGUACUUCACCCUGUUUGUUACAGAAAAGUGGAAGCAGAUUGGCUGGGCUUCUGUCCCAGUGGAGCAUUGUCUGUGGAAUGAGAAGGGAAUACUGUAUUUUUCCACUAGAAACUUCUUCACAAGUCAUACUGUCCCAACAAGCAAGCUUGAUUCCAGUUGGGUGAAAAUGAAAGGCUCAGAAAUUGUUUUUGAGAGGUGACUGGUAAUCCUUGAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-349.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -368.05

Frequency: 0.0000

Diversity: 237.74

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....((((..((((((...((((((((.((((((...)))))).......((((.(((....((((...)))).......)))))))((((.......))))....((((((((.(((((....(((.((((((..(((((((((......)))))))....)).)))))))))((((.....))))...((((((((...........((.((((..((....))..)))).)).......(((((((((.(((.(.....((((((((.....)))..((((..((((..(((((((..........((((((..(.((((((..((((..............((((((.(((..((((...)))).))).))))))((((.....)))).......(((.(((......))).))))))).))))))..)..))))))............(((...))))))))))...)))))))).((((((((....))).).))))(((((((((..((((....))))..)))).).)))).......))))).....(((......))).).)))..)))))))))(((((((((((((........(((((((.((((((.((.....(((((..(((((((..(((.....(((((((..(((((((((..............)))))))))..((((....)))))))))))...))).)))))))........((((((.(((.(((((((((((.(((..((((((.((...)))))((.((.(((((((.......))))))).))..)).)))..)))...)))))...)))).)).))).)))))).)))))..)))))))))))))))...)))).))))).))))))))))))..))))))))))))).((((((.((...((.....))...)).)))))).....))))))))....))))).)..))))......((((...(((((((((((...............((((((((...))))))))...))))))).))))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....((((..{(((((..,((((((((.((((((...)))))).......{(((.(((....((((...}))).......))))))}{{{({{{....,,}}}}}}((((((({{(((((.,.,{({.((((((,.{{(((((((......)))))))....,}.)))))}}||{((({{{.{|,,,...{|||||||,,......,..,,.,|{({{(({{,,}}.,||,,.||.,,.|,|(((((((((.({{{{.....(((({{((.....}))..((((..((((.{(((((((..{{,...,.((((((..{.((((((..((((.{,,..........((((((.(((..(((,...,))).))).))))))((((.....)))).,,{{{,(,,.||}}},..,}))}))})}}}.))))))..),.))))))...,,.......||{..,)),))))))),}.)))))))).((((((((....))).)})}))(((((((((,.(({{....)))),.)))).),}))).......)))))..,..,{{,.....},,..})),..)))))))))(((((((((((((....,,..(((((((.(((({{,({.{{{,(((((..(((((((,.(((.....((((((({.(((((((((..............))))))))),,((((....))))}))))))...))).)))))))........((((((.(((.(((((((((((.(,({.((((((.({...))))){|,|{.(((((((.......))))))).}}..}}...,..}}}...}))))...)))).)).))).)))))).)))))}}))))))))))))))),,,)))).))))).)))),,,)))))}}))))))))))))).((((((.{{..{({.....))...)).)))))).....)))))))).,..))))).}..})))......((((...(((((((((({...............((((((({...})))))))...))))))).))))))))..