Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FBXW7_0000300
Sequence Length
1683 nt
GC Content
0.4290
AGCUGGAGUGGACCAGAGAAAUUGCUUGCUUUAGAUGAACUCAUUGAUAGUUGUGAACCAACACAAGUAAAACAUAUGAUGCAAGUGAUAGAACCCCAGUUUCAACGAGACUUCAUUUCAUUGCUCCCUAAAGAGUUGGCACUCUAUGUGCUUUCAUUCCUGGAACCCAAAGACCUGCUACAAGCAGCUCAGACAUGUCGCUACUGGAGAAUUUUGGCUGAAGACAACCUUCUCUGGAGAGAGAAAUGCAAAGAAGAGGGGAUUGAUGAACCAUUGCACAUCAAGAGAAGAAAAGUAAUAAAACCAGGUUUCAUACACAGUCCAUGGAAAAGUGCAUACAUCAGACAGCACAGAAUUGAUACUAACUGGAGGCGAGGAGAACUCAAAUCUCCUAAGGUGCUGAAAGGACAUGAUGAUCAUGUGAUCACAUGCUUACAGUUUUGUGGUAACCGAAUAGUUAGUGGUUCUGAUGACAACACUUUAAAAGUUUGGUCAGCAGUCACAGGCAAAUGUCUGAGAACAUUAGUGGGACAUACAGGUGGAGUAUGGUCAUCACAAAUGAGAGACAACAUCAUCAUUAGUGGAUCUACAGAUCGGACACUCAAAGUGUGGAAUGCAGAGACUGGAGAAUGUAUACACACCUUAUAUGGGCAUACUUCCACUGUGCGUUGUAUGCAUCUUCAUGAAAAAAGAGUUGUUAGCGGUUCUCGAGAUGCCACUCUUAGGGUUUGGGAUAUUGAGACAGGCCAGUGUUUACAUGUUUUGAUGGGUCAUGUUGCAGCAGUCCGCUGUGUUCAAUAUGAUGGCAGGAGGGUUGUUAGUGGAGCAUAUGAUUUUAUGGUAAAGGUGUGGGAUCCAGAGACUGAAACCUGUCUACACACGUUGCAGGGGCAUACUAAUAGAGUCUAUUCAUUACAGUUUGAUGGUAUCCAUGUGGUGAGUGGAUCUCUUGAUACAUCAAUCCGUGUUUGGGAUGUGGAGACAGGGAAUUGCAUUCACACGUUAACAGGGCACCAGUCGUUAACAAGUGGAAUGGAACUCAAAGACAAUAUUCUUGUCUCUGGGAAUGCAGAUUCUACAGUUAAAAUCUGGGAUAUCAAAACAGGACAGUGUUUACAAACAUUGCAAGGUCCCAACAAGCAUCAGAGUGCUGUGACCUGUUUACAGUUCAACAAGAACUUUGUAAUUACCAGCUCAGAUGAUGGAACUGUAAAACUAUGGGACUUGAAAACGGGUGAAUUUAUUCGAAACCUAGUCACAUUGGAGAGUGGGGGGAGUGGGGGAGUUGUGUGGCGGAUCAGAGCCUCAAACACAAAGCUGGUGUGUGCAGUUGGGAGUCGGAAUGGGACUGAAGAAACCAAGCUGCUGGUGCUGGACUUUGAUGUGGACAUGAAGUGAAGAGCAGAAAAGAUGAAUUUGUCCAAUUGUGUAGACGAUAUACUCCCUGCCCUUCCCCCUGCAAAAAGAAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAAAUCCCUUGUUCUCAGUGGUGCAGGAUGUUGGCUUGGGGCAACAGAUUGAAAAGACCUACAGACUAAGAAGGAAAAGAAGAAGAGAUGACAAACCAUAACUGACAAGAGAGGCGUCUGCUGUCUCAUCACAUAAAAGGCUUCACUUUUGACUGAGGGCAGCUUUGCAAAAUGAGACUUUCUAAAUCAAACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-461.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -492.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 346.39
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((..(((((...(((((((((.(((.(((......(((...((((.....)))).)))......))).))).))))))))).(((....((((((...))))))....)))...((((......)))).(((((.....)))))((((.(((((((.((((...((((.((((.((((((((.(((((((...((((((.........((((..(((((((((.((((((((((...(((((.........((((((((((((((((((...((.......))...))))).......)).)))))...)))))).........)))))...)).(((.((.((((((...(((((((((..((..((((((.......)))))).....((((..(((.((((.(((((....)))))))))))).))))..........))...))))))))))))))).((((...((((...))))...)))))).))).(((((....))))).........(((.(((.(((((..((((((((.(((((((.(((((((.......)).))))).)))((((....))))...........(((((..(((((............))))).))))).....)))).))))))))..))))).))).)))...)))))).))...))).))))))..))))((((((.((.(((..((...))..))).)).))))))....))))))...)))))))(((....(((((((((..((((....))))...)))))))))..)))..)))))))).))))(.((((......)))).)..)))).)))).))))).)).)))).(((((((.(.((((((.((((.((........(((((((((((((((((....(((...)))..))))))))))))).))))(((....)))....)).)))).))))))))))))))((.((.(((((.(((((((((..(((....)))))))))..)))))))).)).))..((((((.....))))))((((((((....))))).)))......)))))..)))..........(((((((....)))))))..(((((...(((.((((....))))))))))))..(((((((((.....))))..)))))...))))))(.(.((((....(((((....)))))((((......((((((....))))))......))))...(((((((((((((((((.((((((((..((.(((........))).)).((((((((((((((...((((((((...((((.......)))).....)).))))))...)))))).))))).)))(((((...........................))))).(((((....)))))..))))))..))))))))))((((((....................(((......((.((((((....(((((.(((..(((((.(....).)))))..)))......(((.(.......).)))....................)))))....)))))).))....)))(((((((..(((..((((((......))))))..)))))))))))))))).......)))))))))))))...).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{((((.,,,..||||....(((((((((.(((.(((....,.{{,.{{.(((((......))))).)}...))}.})).))))))))).,,,...,((((({...||}}}}.,,,|||.,,((((......)))}.{((((.....))))}((((.(((((((.((((...((((.((((.((((((((,(((((((.,.((((((.........((((..(((((((((((((....))))},.,.{,.........((((((((((((((((((...((.......)}...))))).......))))})))...)))))){{{{{...((((((((.,{,(((,,(,((((((,..{((((((((..((.,((((({.......)))))}..,,.{(((..(((.((((.(((((....)))))))))))).)))),}},,,....))...})))))))))))))).((((...((({...})))...))))|}.}}}.{,{||...,))))),..,,....,|,.{((.(((((,(((((((((.(((((((.(((((((.......)).))))).)))((((....))))...........(((((..(((((............))))).))))).,...)))).)))))}})))))))).))))))))))).)))}}......,}.))))))..))))((((((.{(.(((,{(,..,))..))).)).))))))....))))))...)))))))|{{....(((((((((,{(({,...,))))...)))))))))..))...)))))))).)))){.((((......)))).)..)))).)))).))))).)).)))).(((((((.(.((((((.((((.((........(((((((((((((((((....,,{...,,),,))))))))))))).)))),({....,,,.,,.)).)))).))))))))))))))((.((.(((((.(((((((((..(((....)))))))))..)))))))).)).))..(((({{...,,))})))|||||{{{.,,|}|}}|{{{|{{...{{|||||............,.(((((((....))))))),.(((((...((,{((((....)))))))))))),.{((((((((.....))))}.,)))}...,,,,))|}}}|..,..}}}}}}}...,||||,((((......((((((....))))))......)))).},|{{{{{{((((((((((.((((((((..((.(((........))).)}.{(((((((((((({...(((((({(...(({{.......))}}.....)),})))))...}))))).))))).))|(((((....,,...............,.....))))).(((((....)))))..)))))),.)}))))))))|||{{,.....................,.......{{,((({((,{,.(({({.(((..(((((.(....).)))))..)))......||{.|.......,.)))..........,..{{{....,})}}..,|}}}}}},||.,.,))}((((((({.(((..{(((((......))))))..))))))))))}))))}.....,.))))))))},,}}..,},)
Back