Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FBXW7_0002100
Sequence Length
1962 nt
GC Content
0.3863
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-487.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -530.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 489.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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