Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FBXW7_0003300
Sequence Length
2296 nt
GC Content
0.2940
AGCUGGAGUGGACCAGAGAAAUUGCUUGCUUUAGAUGAACUCAUUGAUAGUUGUGAACCAACACAAGUAAAACAUAUGAUGCAAGUGAUAGAACCCCAGUUUCAACGAGACUUCAUUUCAUUGCUCCCUAAAGAGGUAAAGAUUAUCAAUUACAUUCUUCAUUGGGUGUUAUUUGAAUAUAUAACUCAACAGCUACCACCUUUAAACAUUGUCAUGCUAAUUAUGGUAUUCGGUAUUGUCAGUUUGACACUCUUAAUUAGUGGUAAAGAGGGCUGUAAAUUGAUAAAUUGCCAUGACUUAAUAAUGUAAUUGUCAGAUUAAAGAAUGCAUGUGAACUAAGUAACUCCUUUCCACUAUUUGAAUAAGUCAUAUAUGUGAGAGUAACUAUUGAGUUUCACUAAUUUGAUUAUUUAUUUACCAAGAUUUUUUUGUCAAGUUAUUUGAAGCCCAACCUUUAGUUAUCUUGGUAUAUUCAUGAUAGUAGAUUUUUUAAAAUUCUGACCAUAUUAAAAUAGCAAUAUUUUUUCUCUUAUUUUAUUAUAUAUCUUAAGUCCCUUCAAGACCAAUAGGUUUAUGAUUCUAUUGAAUUCUAGUUCUCUGGUACUUAACAUUGUGUAAUUAUUUUAAAUACAAAUAUUAUAAUUUCACAUGUGUAUAUUUUUCUAAUCAUUCUCCUCCCCAUCUCCAUUACACAAAUACAGAUUUCCCAUACUAAUUACAUGCUAACAGCACUUCUUUGGGAAUUAUUUGUGCCUAUUUCUUUUUAUAUUUUUAUGUAAGCUGAAACUAUCAUAGACUGAUUAUAUGGGCAUUCAUAACUAUAAGGCAUAGUUUAGAUAUAGUUCCUUUAUUGAUAUUAUAGACCUAGUAAUUUUGUCAGUGAACAGAAAUAAUAUAACAUUAAAUAAUCAGCAUCACCAUGAUUUAUAUUUUCAUAAGUAAUAUGUAUAUGCCCCUAGUUAUAUGUCAGCUAAGAAGACAAUAUAAAAUACUAACAUACCAUUUCAAAUGAUCCUGAAACUUCAAAUUUGAACAGAAAAAAGUCAUUUUUUUAAGAUUAUCAUUCUAAAUAUCCUAAUGGUGUUAAAGAUAGUCCCAAUUAGAAUUGCACGUUGGAUACGAAUAAAAUAGUUGUAUCAUAUUUAAUGCAUGGAACUAAGCAUAACUCCAGAGAAAAGCAAAGUGGAGAAAAUCUUUUCUUCCUAAAAUGUGUUUUCUACUGAGUGCUUUUUAAAAAUGACUUUGGCCCAGAAGAAAAUUUUUAUUUUUGCUGGCUCAUUCUAAAACUGAAUCCUUUGAAUAGAUUUGGCUUAUGAAAGUGACGUCAGCUCUCUUUGCUUCCAGAAGGGCAUUAAUAAUGGGAAACACUUACAUAAGUAUUUGACUGAAAGUGAUUUUAUUCACCUUUGAUAUAUUCUCUGUAGUUUACUUAGUGAUAUCCUCCGUAUUUUAGAGGUUAUCAUUUUUGUUAAAAUGCAGGCUUUCUCAUAGUCUCAUUUUUUCUCUUAUUUCUAAUAAUGGUGAGGUUUUUGGUUUGUUUUGCUUUAUUUGAAUUUCCAUAACUUCUUAACAGACAAAAUGUUGUGUAAGAUCAGAAUAUGAAAGUAUUUUGAAAAAUCUAAGAAUUAAAAACAAAUAAUCAAUAACCAGGGUAAAUCCAGUAAAGAUUCUCUCAGUUUAAGUGUUCUUUUAAAGACUGCCUGGGGAAAAAUAAGUGAAAUUAGUUAUAUAGGAGACUAAGGGAGAGCCUUGGUUUAGCAUAUCAUCUGUGUUUCCCUCUUGUUUUCAACUACCAGAAAAAAAAAUUCCUAUUUUGAAAAAUGCUUUAUUGUCUAAGUGGAUAAAUAAUGAUAUAGAAAACAUUAUCUUCUCAGAAACAAAGUAUUAUUAUUUAAAACAUUAUUACCUUCUUGUCAGGAAAUGGACUUAUUUUUCUUAUAAUUCCUUUGGCCAUAUCUCAAAACUAUUUACAAACAUUUACUUUAUUAAUCUCAAAAAGCUUGACAGAAGUCUCACUAAUUUCACACUAGAGGCUUGUGAUGAAUAGCAUUGUCUUUAUAAGUGAAUACCAAGAAAAUCAUAAUCAUACAAUAGAUGAUCUAGAGCAAAACCUGAAAUUCUUAAUAGAGGAUUAGCCAACAUUUAAAAAUAAUUUUUUUUCCUUGACUAGUUUAAUCCACUGAAAUACAGCAAGUCUGGGAAAAUAUUGGCUACCUUUUAAGUACAAUGUGGUUGUCUUUUAUAUAGGUUAUAGAGAAAAAUAAAAGCAAUUCUUACAGAGUUGGACAAGGAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-450.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -506.10
Frequency: 0.0000
Diversity: 499.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.........(((((((((.(((.(((......(((...((((.....)))).)))......))).))).)))))))))........((((((...))))))))))))))..)))(........(((((...((((((((((((.(((((.((((((..(((......)))..))))))....((((((..((((....(((((.(((.(((((.(....).)))..)).))).)))))...))))...))))))..))))).))).))))))))).)))))......(((((((((....(((((((((((((((..(((((((((((((((((.(((((((.(((.(((.....))).))))).)))))......(((.((((((.(((((((((.....((((....))))......)))))))))..)))))).))).....))))).))))))....))))....))..)))))))))...))))))....(((((((((.(((.((((((((..................((((..((((((.(((((....)))))..(((((....)))))....((((((((..........((((.((((((..((........))..)))))).))))((((((.................................))))))..(((((((((((((...........((((...))))......))))))..)))))))....((((..(((((((....)))))))..)))).((((.(((((((....(((((..........))))).....)))))))))))(((((((((((((((((..((..((...)).))..))))))))))..............(((((((((....((((...((((((((((......))))))..))))...))))...((((((((((((.........))).)))))....)))).........(((((((................)))))))..(((((((....)))))))..(((((((.((...((((.((....)))))).))))))))).((((..(.....)..))))(((((((.........))))))).)))))))))...))))))).........))))))))((((((((.(((((((....)))))))..((((((.(((((((.(((.(.(((................))))))).)))))))...)))))).((((((((((((.....(((((((.........))))))).....))..)))).))))))...))))))))...))))))..))))....(((((((((.....((((((...(((((..((.((......(((....))).....)).)).)))))))))))((((((.((((.........)))).))))))...(((((((....((((((((((.(((((((....((((.(((((((.............((((.((((((((((((.......................(((((...((((...))))...)))))(((((((((....)))))))))...............))))))...)))))).)))).((......))........(((((.(((....(((.((......)).)))..))))))))))))))).))))............))))))).))))))))))...)))))))........)))))))))..(((....))).....))))))))..))).)))))))))..((((((((....(((.((.((((((..................)))))).)).)))...))))))))..........)))))))))..((((((((.((....(((.((((.......)))).))).....))......(((..(((((((.....................((((.....))))((.(((((((...............))))))).)).)))))))..)))(((((((((.(.......((((.((((((((((((.......))))).(((........))).....(((((..((((..(((((((.................(((((((.((((.(((................))).)))).)))))))..)))))))))))))))).....))))))).)))).......).)))))))))..........(((((((...)))))))))))))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((({((((((((((((((((((((((.(((.(((......{{,.{{.(((((......))))).}}...))}.))).))))))))).(({....{(((((...})))))....}}}..,,.,.......,.(((((...((((((((((((.(((((.{(((((..(((......)))..)))))}....((((((..,{{{....(((((.(((.{,{((,(....}.))),.}}.))).)))))...}}},...))))))..))))).)))}}}))))))).)))))..(((((((..((((({,.((((((((((((((({({((((((((((((((({.(((((((((((.(((.....))).))).)})))))......{((.((((((.(((((((((.....((({....})))......)))))))))..)))))).))}.....))))).))))))....)))),.,.))..}))))))))...)))))).....,((((((,...,},,,......,}}}}}})}))))).,.)))))))......(((((....))))}..|{{{(....))}}}....))))))))).....((({((((.{(((((..((........))..)))))}.)))),))}|,.......................}}}.}}},....((((((((..,{,((((((...........((((...))))......)))))),))))))))....,,{{..{((((((....))))))|,,||||{{((,.((({(((,{,.(((((........,,||||}....,)))))}},,,}}}}}|,.((((((((((..((...,...}}.)}..)))))))))}.,}}},.,,|,,..........|{|||},.......}}||,..{((((((((((((...{{,{,{,{{....,,,(((((((((.........)))},))))}...,,,,.,}},...,(((({{,,....||,....|{{.,||)))},,|...((((((((((((..,,(((((((.{{...((((,({....)))))),},))))))){((,{..,...,{{,.||}}|{{{{{,......,{{||}||||,{,....})),))).}}}}|(((,..,(({{((((((({(((.,,.(((((({....}))))))),....))).)))))).)))))))))}}..))))))))))))((,((((..((((((....)))))).))))}),{{{{.......}}}}..,,,,.,})}))}},)))))))))))))},.))))))(({((({,,(((((((((....(((((({(((((((((.....{(((((...(((((..((.((...{{,{{|....})),}.,.)).)).))))))))))}((((((.((((.........)))).))))))...(((((((,{..((((((((((.(((((((....((((.(((((((,.......,,...((((.((((((((((((...,,.,,,(,.,,,........(((((,{,((({...}))).}.)))))(((((((((....))))))))).,,.}}.,,.,,...))))))),.,})))).)))).(({....,))........{(({({(((,,,.(({.{,......}),))),.}})))))}})))))).))))..,.........))))))).))))))))))..})))))))........)))))))))..{.,({{{{........))},,..,..,....,|||||{,.((((((({.,,.(((.((.((((((,,,{{{.,..........}))))).)).}))...}))))))),,,,}}}}...,))))}}})))))|(((.((({{.{(...(((((((((((((({,,,{({(({........,,,..............((((((((.,.,{{...(((...(((,.{((.(((((((...............))))))).)).}....))).)))...}}),))))))))....,{{..,{{,,.{{{{{......})))}),|{{,{...,,{{,,.....((((,.,((((..(((((((.,,,..,,,,.....,,|{(((((.((((.(((...{.....,...,..))).)))).))))))),.)))))))))))))))).....}},)))).,}}},.....,))))))})))))))))))...}|,|||}}}})),,,))))))))))..})
Back