Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FBXW7_0004000
Sequence Length
795 nt
GC Content
0.4591
AAUGUGAAAACCUUUGCAUCUUCUGAUAGUCUAGCCAAGGUCCAAGAAGUAGCAAGCUGGCUUUUGGAAAUGAAUCAGGAACUGCUCUCUGUGGGCAGCAAAAGACGACGAACUGGAGGCUCUCUGAGAGGUAACCCUUCCUCAAGCCAGGUAGAUGAAGAACAGAUGAAUCGUGUGGUAGAGGAGGAACAGCAACAGCAACUCAGACAACAAGAGGAGGAGCACACUGCAAGGAAUGGUGAAGUUGUUGGAGUAGAACCUAGACCUGGAGGCCAAAAUGAUUCCCAGCAAGGACAGUUGGAAGAAAACAAUAAUAGAUUUAUUUCGGUAGAUGAGGACUCCUCAGGAAACCAAGAAGAACAAGAGGAAGAUGAAGAACAUGCUGGUGAACAAGAUGAGGAGGAUGAGGAGGAGGAGGAGAUGGACCAGGAGAGUGACGAUUUUGAUCAGUCUGAUGAUAGUAGCAGAGAAGAUGAACAUACACAUACUAACAGUGUCACGAACUCCAGUAGUAUUGUGGACCUGCCCGUUCACCAACUCUCCUCCCCAUUCUAUACAAAAACAACAAAAAUGAAAAGAAAGUUGGACCAUGGUUCUGAGGUCCGCUCUUUUUCUUUGGGAAAGAAACCAUGCAAAGUCUCAGAAUAUACAAGUACCACUGGGCUUGUACCAUGUUCAGCAACACCAACAACUUUUGGGGACCUCAGAGCAGCCAAUGGCCAAGGGCAACAACGACGCCGAAUUACAUCUGUCCAGCCACCUACAGGCCUCCAGGAAUGGCUAAAAAUGUUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-208.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -224.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 178.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((....)))))))..)((((..((.((((((...(((((((..(((....)))..))))))).............((((((.....))))))..............((((((((...(((..((((....(((((((..(((((((((((...........(((((((.((((..((((((....((..((((((((((..((......(.((.......)).)......)).)).))))))))..))....)))...)))....))))..)))))))(((((.......)))))................)))))))).)))...(((((...)))))((...))...........)))))))(((.....)))(((((...(((.((((...((((((.((((((((.((.(((((..(((((((.(((((....)).))).)))............................(((((((((..(((.......)))....))))).))))..)))).)))))..))...)))))))).)))))).............................((((.(((((((((((((((((..((((((((...)))))))).................((((((((((((.((...)))))))))...))))).......((((......))))))))))))))...))).)))))))).(((.........)))......)))))))))))).)))).)))))))))))...))))))...))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((....})))))}.,)((((..,{.((((((...(((((((,{(((....))},})))))))......,{{((..(((((({{{..{({,||{...{{........}},,..}}}}}}.,)))|,,...,(((((((..((((.{..(((..,.......,..))).}.)))).)))))))..,,((,,({(({{(((,..,.......{,||..,,.,,||.}......,),))..))))))),}))}}..))).,,((((((((((....,,.,{{(((((.......)))))..,.....,{{.......}},}||,(((...(((((...)))))....)))...........,,||...,{{.....},}(((((...((,{((((...((((((.((((((((,(,.(,((({{(((((((.((({,....}}.}}}.}}|..,,....,..||,,...,.}.......{{{{{{{{{..{{{,,,,,..})}....))))}}})))..)))).},))))},)..})))))))).)))))).............................((((.((((((((((((((((({{{{{{((((,,.}}}))))),.....}}...{,..,.((((((((((((.{{...))))))))}..,))))).,..,,.((((......))))))))))))))...))),,))))))}.(((.........)))......))))))))))))..,}}.,.))))))))))..))))))...,}...))))
Back