Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FBXW7_0004900
Sequence Length
620 nt
GC Content
0.4548
GAUUACUUCCUUAGGAUAGAUUGCCAGAAGUGGAGUUACUGGGUCAGAGGAAUGUGAAAACCUUUGCAUCUUCUGAUAGUCUAGCCAAGGUCCAAGAAGUAGCAAGCUGGCUUUUGGAAAUGAAUCAGGAACUGCUCUCUGUGGGCAGCAAAAGACGACGAACUGGAGGCUCUCUGAGAGGUAACCCUUCCUCAAGCCAGGUAGAUGAAGAACAGAUGAAUCGUGUGGUAGAGGAGGAACAGCAACAGCAACUCAGACAACAAGAGGAGGAGCACACUGCAAGGAAUGGUGAAGUUGUUGGAGUAGAACCUAGACCUGGAGGCCAAAAUGAUUCCCAGCAAGGACAGUUGGAAGAAAACAAUAAUAGAUUUAUUUCGGUAGAUGAGGACUCCUCAGGAAACCAAGAAGAACAAGAGGAAGAUGAAGAACAUGCUGGUGAACAAGAUGAGGAGGAUGAGGAGGAGGAGGAGAUGGACCAGGAGAGUGACGAUUUUGAUCAGUCUGAUGAUAGUAGCAGAGAAGAUGAACAUACACAUACUAACAGUGUCACGAACUCCAGUAGUAUUGUGGACCUGCCCGUUCACCAACUCUCCUCCCCAUUCUAUACAAAAACAACAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-149.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -162.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 156.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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