Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FBXW7_0007800
Sequence Length
606 nt
GC Content
0.4571
GAUAGAUUGCCAGAAGUGGAGUUACUGGGUCAGAGGAAUGUGAAAACCUUUGCAUCUUCUGAUAGUCUAGCCAAGGUCCAAGAAGUAGCAAGCUGGCUUUUGGAAAUGAAUCAGGAACUGCUCUCUGUGGGCAGCAAAAGACGACGAACUGGAGGCUCUCUGAGAGGUAACCCUUCCUCAAGCCAGGUAGAUGAAGAACAGAUGAAUCGUGUGGUAGAGGAGGAACAGCAACAGCAACUCAGACAACAAGAGGAGGAGCACACUGCAAGGAAUGGUGAAGUUGUUGGAGUAGAACCUAGACCUGGAGGCCAAAAUGAUUCCCAGCAAGGACAGUUGGAAGAAAACAAUAAUAGAUUUAUUUCGGUAGAUGAGGACUCCUCAGGAAACCAAGAAGAACAAGAGGAAGAUGAAGAACAUGCUGGUGAACAAGAUGAGGAGGAUGAGGAGGAGGAGGAGAUGGACCAGGAGAGUGACGAUUUUGAUCAGUCUGAUGAUAGUAGCAGAGAAGAUGAACAUACACAUACUAACAGUGUCACGAACUCCAGUAGUAUUGUGGACCUGCCCGUUCACCAACUCUCCUCCCCAUUCUAUACAAAAACAACAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-147.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -159.19
Frequency: 0.0000
Diversity: 110.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((.((((......((((.((.(((((((((((((.((((((....)))))))))))))))...))))...)).)))).......)))).))).)(((((((((((((((.....((((((.....)))))).......(..(.(((((..(((.((((...((((....(((((((..((((.(..(((.............))).).)))).)))))))....((..((((((((((..((......(.((.......)).)......)).)).))))))))..)).........)))))))))))........(((......)))))))).)..)............))))))))))(((...(((((...)))))....)))..........................(((..((.....))..)))...((((((.((((((((.((.(((((..(((((((.(((((....)).))).)))............................(((((((((..(((.......)))....))))).))))..)))).)))))..))...)))))))).))))))............)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.{((.{(((......((((.((.(((((((((((({,((((((....))))))))))))))}...))))...)).)))).......)))}.))}.)(((((((((((((((.....((((((.....))))))..........,.,,{{,..(((.((((,.,((((...,(((((((..((((.{..(((..,.......,..))).}.)))).)))))))....((..((((((((({..{,......(.((.......)).)......}}.)),,)))))))..))...,}}}..,}})))))))).......,{{({{{{..,,...)))})...............))))))))))(((...(((((...)))))....)))..........................{{{.,({,....},..))}...((((((.((((((((,(,.(,((({{(((((((.((({,....}}.}}}.}}|..,,....,..||,,...,.}.......{{{{{{{{{..{{{,,,,,..})}....})))}}})))..)))).},))))},)..})))))))).))))))............)))))
Back