Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FGD4_0000500
Sequence Length
709 nt
GC Content
0.4175
GUUGCAGUGAACCGAGAUUGCGCCACUGAACUCCAGACUGGGCGACAGAGCGAGACUCCAUCUCAAAAGAAAAAAAAAGGCACAUAGAGAAAAAGCAUACAGAUUUAUUAACGUGCACACGUGAGAAUCACAGAAUGAUUGCCCAGUAUCCCAAUGGGGCCCAAAUACUUACAUAAUCUUAUUUCAGAGGGGAAGAGGAGAUAGGGAAUAUUGGUAUUCUGCUGAGUAAUAAUUGAUUACUGUGGAGAAUGAAUGGAUGAGGGAACAGAGACUGAUGUGUAAAUGAUUCUCUUUGGAAAUGGAGUGAUCCCGAGAGGCAGACGUUAUUUUGUAGAAAGAUCUGAUUAGGUCUGGUUACAUUCUUGGUCAUCUUUUCUGCAGUAGAUUGUGAGAUAAUGGAGAGAAGGAAAAAGUAUUGUUUUUGUUGGGUCUAUCUGGUGUUUAUGUAGACAGAGGAAAAAUCUAUUCCUAAUACCUGUUGAUUUUUAAGGGCUUUUAAUUCAAAAUACUCAUUAUCUCAGGAGGCUGUGUUUUGGGGUGGAAAUUCCUUGCGCUCCUUCAAUUGGAAGUUAUGAAAUUGUUAUAGGCUGGGUAUGGUGGCCCACACCUGUGUUCCAGCACUUUGGGAGACCUAGGUGGAAGGAUUGCUUGAACCCAGAAGUUCAGGACCCGGCUGGGCAAUAGGGAGUCCCCUUUUUGUUUUGUUGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-183.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -199.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 214.24
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((........))))))((((((.....)))..)))((((((((((((((((((.((((......................))))...........(((((....((((....))))..)))))........((((((((((..(((...)))(((..((((.((.((((((....((((((..(....((((((.((((((((.....((((((.(..((((((.....))))))..).)))))).......(((((((((...((......))...)).)))))))...........(.(((((((((.((((........(((((((((((..((((((((..((....))..)))))))))).)))))))))....((.(((((((((((.......(((........(((((((..(((((.....((((((...(((((...........)))))....))))))....))))).)))))))......))).......))))))))))).))..)))).))))))))).)..))))))))..)))))))..)))))))))))).)).))))...)))(((((......)))))(((((((.((((((....)))))).))..)))))...((....(((((((......)))))))..)).))))))))))..))))))......)))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,({((((,...,,..}}}})),|||||,,,.,||}..}))((((((((((((((((((,(,((..,{||.........((((,{.||,............,,|||.|,.,,||}}..,}||{{,,,})}}....,,{{{{((((((,,(((..,|||{{(,..,{,{{{.,,,,{((({.((((......}},|,||||,|||||{,||||,}((((((.(..((((((.....))))))..).))))))..,.,}}{{{{{{{{{...{|,.,,,,))...}}.))})))),.},.,,|||||.(((((((((.((((.(..,...{((((((((((..((((((((..((....))..)))))))))))))))))))}....{(.((((((((((({{...,,(((,,{{....{{((((,,,,{((({{{.,({{,{{,,.|||||}..|||||...}}},)}}}},}},||,.,.}},,,.}}))))},,},..,}}......}))))))))))).)).,)))).))))))))){|,.,})))}}|,,}||||||...,,)}}}}||||,.,.,|}},,,|||{((((..,,.,}})),(((({((.(((((,....}))))).))..)))))...||....(((((((......))))))),})),)))))))))),,||}}}},}},.,)))))))))))).
Back